一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法技术

本发明专利技术公开了一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法，包括以下步骤：1)获得问号赖型钩端螺旋体；2)挑选复制基因及进化距离信息提取。本发明专利技术也可推广到其他基因、基因组的提取及分析。

【技术实现步骤摘要】
一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法
本专利技术属于微生物
，涉及一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法，具体地说，涉及一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法。
技术介绍
问号赖型钩端螺旋体(LeptospirainterrogansserovarLai)是钩端螺旋体(钩体)的一种，钩端螺旋体是一种古老的微生物，在进化中属于真菌的一个分支。钩体病是一种世界范围内的人畜共患病，主要症状包括发热、肌肉痛、乏力，严重者发现为脏器广泛性出血，肾、肺功能损伤。我们所研究的问号赖型钩端螺旋体是具有代表性的一种具有剧毒的钩体，它的生物学特征和致病性有其独特性，也是我国两个流行菌型之一。问号赖型钩端螺旋体有两条染色体。虽然在预防和治疗钩体病方面取得了很大进展，但其遗传学特性和致病机理尚不完全清楚，期待通过其复制基因的研究来揭开其机理。基因复制是指以亲代基因为模板合成子代基因的过程。基因复制可能是复制1个基因，1段染色体片断或者全基因组。复制基因被公认为是产生新物种、新功能所必需的材料来源。研究发现在真核生物(动物，植物等)、原核生物(细菌和古细菌)中，普遍存在着大量的复制基因。然而，大部分复本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法，其特征在于，包括以下步骤：?1)获得问号赖型钩端螺旋体?问号赖型钩端螺旋体在NCBI下载，包括其各段基因信息；?2)挑选复制基因?通过Blast软件进行比对挑出复制基因，首先，我们筛除了可能的没有功能的序列，然后，用blast对比所有的问号赖型钩端螺旋体复制基因，选取对比分数在10?8以下的，通过BLAST软件基于二参数模型，MATLAB，VC++软件进行挑选、比对，选择复制基因，再用Kestim61软件分别计算出每对复制基因的每个同义位点和非同义替代位点的替代数目，总共获得519对复制基因；?3)进化距离信息提取?基于二参数模型，用Kestim61软件...

【技术特征摘要】
1.一种问号赖型钩端螺旋体复制基因挑选方法，其特征在于，包括以下步骤：1)获得问号赖型钩端螺旋体问号赖型钩端螺旋体在NCBI下载，包括其各段基因信息；2)挑选复制基因通过Blast软件进行比对挑出复制基因，首先，我们筛除了可能的没有功能的序列，然后，用blast对比所有的问号赖型钩端螺旋体复制基因，选取对比分数在10-8以下的，通过BLAST软件基于二参数模型，MATLAB，VC++软件进行挑选、比对，选择复制基因，再用Kestim61软件分别计算出每对复制基因的每个同义位点和非同义替代位点的替代数目，总共获得519对复制基因；3)进化距离信息提取基于二参数模型...

【专利技术属性】
技术研发人员：王晓峰，王参军，王洪柯，苏盈盈，孙宝光，
申请(专利权)人：王晓峰，
类型：发明
国别省市：