一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法技术

技术编号:9356752 阅读:123 留言:0更新日期:2013-11-20 23:55
一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,它包括以下步骤:对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因-蛋白-反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。本方法构出的模型统一了反应格式,方便同其他模型进行比较查阅。本方法已在树干毕赤酵母基因组规模代谢网络构建中得到应用,与传统的基于KEGG数据库的网络初模型构建相比,节省了大量的劳力和时间,大大提高了构建效率。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,其特征是它包括以下步骤:,对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因?蛋白?反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:薛卫张梁柴文平倪丁香徐焕良任守纲
申请(专利权)人:南京农业大学
类型:发明
国别省市:

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