用于核酸测试的改良方法技术

技术编号:8861165 阅读:175 留言:0更新日期:2013-06-28 00:36
用于核酸分析的方法牵涉下列步骤:接受含有样品的样品管,接受每份样品的测试请求(所述测试请求规定要对所述样品进行的一种或多种测定法),根据是否要进行一种或多种测定法,获得每份样品的一份或多份样品等分试样,依照要对所述样品等分试样进行的测定法,将每份样品等分试样归入一个或多个测试类,并将属于同一测试类的样品等分试样组合入同一批次中,其中所述批次包含要进行第一测定法的样品和要进行第二测定法的样品。以如下的方式加工所述批次,使得一起完成所述样品等分试样中含有的核酸的扩增,并且进行样品等分试样的分析以测定所述样品等分试样中核酸的存在和/或浓度。此外,描述了实施此类方法的系统。

【技术实现步骤摘要】
用于核酸测试的改良方法专利技术背景本申请涉及用于在自动化系统中分析核酸的改良方法及用于进行此类改良分析的分析系统。核酸分析领域中使用的系统需要加工含有核酸的样品。此类加工牵涉分选样品,转移容器,或将液体样品和试剂从一个容器转移至另一个和分析。对于较高通量,同时加工经常用多种消耗品,诸如移液管头和单一容器或多孔板实施。对整合的且自动实施从样品制备到获得分析方法的结果必需的所有或至少大多数步骤的分析仪也有兴趣。专利技术概述用于核酸分析的方法,牵涉下列步骤:接受各含有样品的样品管,接受每份样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的一种或多种测定法,根据是否要进行一种或多种测定法,生成每份样品的一份或多份样品等分试样,依照要对所述样品等分试样进行的测定法,将每份样品等分试样归入一个或多个测试类,将属于同一测试类的样品等分试样组合入同一批次中,所述批次包含要进行第一测定法的样品和要进行第二测定法的样品,同时扩增所述批次中含有的核酸,进行所述样品等分试样的分析以测定所述样品等分试样中核酸的存在和/或浓度。用于分析含有核酸的样品的系统,其包含:样品接受单元,其中接受各含有样品的样品管,阅读器,其阅读所述样品管上的标识,数据管理单元,其接受样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的测定法,所述数据管理单元进一步自所述阅读器接受样品管标识,所述数据管理单元确定多少份样品等分试样是必需的,将所述样品等分试样归入测试类,并将所述归入提供给控制单元,所述控制单元控制吸移器以将归入同一测试类的样品等分试样移液入同一批次孔中,同一或别的吸移器,其用于将试剂移液入所述批次孔中,热单元,其用于将所述批次孔进行热概况处理以扩增核酸,检测单元,其检测来自所述批次孔的信号,评估单元,其测定所述批次的各孔中核酸的存在和/或数量。专利技术详述核酸分析例如对于检测疾病、测定遗传状况(遗传病症和素因)及对于法医目的具有不断增加的重要性。在谈论核酸分析时,通常意味着检测样品中某些核酸的存在及也可以是浓度。为了这样做,通常处理样品材料以释放样品中含有的核酸材料,并且经常还纯化有待检测的核酸。然而,鉴于样品中存在的少量核酸和经常可用的非常有限量的样品,此类检测是不容易的。替代越来越提高测定法的灵敏性,已经证明了增加初始样品中含有的核酸材料以使核酸的存在或数量适当检测可行是更有用的。一种用于实现此类增加的标准规程(经常称作“扩增”)是公知的聚合酶链式反应(PCR)。对于此扩增规程,将样品材料(通常在一些预处理后,用于释放核酸并将其纯化)与合适的试剂混合,然后进行温度循环处理。每个温度循环(在最佳条件下)使样品中存在的核酸(NA)量加倍。可以在扩增结束时或者在扩增过程期间完成核酸的存在和/或浓度的检测,如下文会描述的。凭借已知的扩增仪,仅将测试相同核酸的样品一起进行温度循环处理。对于扩增,将样品与扩增试剂混合(以获得扩增混合物),并且经常在多孔板(MWP)的孔中分配。然后,将整个MWP进行温度循环处理。这意味着分批加工扩增混合物。MWP中的孔数目决定可以在一个批次中一起循环的反应混合物的数目。经常使用的MWP形式是每板为48、96、356和1536孔。若没有足够必须测试相同NA的样品可用,则现在存在两种选项。一直等待直至可用更多样品填充批次(即,完成使用的MWP中的开放位置)或者用较少的样品作为板中可用的位置运行批次(即,用空的孔循环MWP)。选项1延长时间到可得到结果,而选项2浪费消耗品。因此,这两种选项都降低测试效率。发现了提及的缺点(等待更多样品或运行不完整的批次)可以通过容许在同一批次内对不同核酸运行分析(即,不同测定法)的方法和系统减轻。此类用于核酸分析的改良方法牵涉下列步骤:接受各含有样品的样品管,并接受每份样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的一种或多种测定法。根据是否要用所述样品进行一种或多种测定法,获得每份样品的一份或多份样品等分试样。对于每份样品等分试样,然后测定其属于哪一个或多个测试类。依照测试请求进行此测定,所述测试请求规定要对特定的样品等分试样进行的一种或多种测定法。将属于同一测试类的要进行测定法的样品等分试样在一个批次中组合,所述批次至少包含要进行第一测定法的一份样品等分试样和要进行与第一测定法不同的第二测定法的第二样品等分试样。然后,将所述批次中的样品等分试样进行相同温度概况处理以扩增样品等分试样中含有的核酸。然后,依照第一和第二测定法进行核酸的检测,其可以在扩增过程期间或在完成扩增过程后发生。如本文中所使用的,术语“样品”不仅用于初始样品,而且还指已经加工过(移液、稀释、与试剂混合、经过纯化、经过扩增,等等)的样品。样品等分试样是测试采用的样品部分。通常如下生成样品等分试样,即将样品部分移液入孔中,然后在那里进行进一步处理。在需要两份或更多份样品等分试样时,例如有可能吸出一定体积的所述样品,并将所述体积的部分释放入两个或更多个孔中。术语样品等分试样意图还覆盖与试剂和测定样品等分试样通常必需的其它流体混合的样品等分试样。现今,核酸分析是一种测定感染(HIV、HCV等)、遗传疾病和素因及家庭关系和出于法医目的鉴定个人的有力工具。由于典型的样品中微量的核酸,通常必需扩增样品中含有的核酸。已知几种用于此类扩增的方法,如聚合酶链式反应(PCR)、连接酶链式反应(LCR)、转录介导的分析(TMA),等等。这些方法是本领域中公知的,并且因此在本文中没有详细描述。然而,此类方法的一项共同要求是在检测前扩增患者样品中的核酸。对于此类扩增,样品及试剂的某种热处理是必需的(即,生成样品混合物)。在平行分析多份样品的自动化系统中,此类扩增混合物的热处理一起(逐批)完成。用于扩增的热处理牵涉某种温度对时间概况,其实现核酸的优化的且可重复的扩增。简言之,这称作热概况。在PCR的情况中,热概况包括以循环方式的多个加热和冷却步骤。单独的循环包括在某个时间中将反应混合物自基线温度(例如40℃)加热至较高水平温度(例如,70℃),然后保持该较高水平温度,冷却至基线温度,然后将基线温度保持预定的时间。此领域的测定法开发意味着寻找实现有待检测的核酸的足够的且可再现的扩增的合适的热概况,等等。LCR和TMA需要不同的,而且明确规定的热概况以获得可再现的扩增,其继而容许标准化的检测过程。如本文中使用的,批次/批是同时进行相同热概况处理以进行核酸扩增的许多样品等分试样。这意味着样品等分试样以如下的方式集中在一起,使得单独的样品等分试样在扩增期间进行相同热概况处理。实际上,这经常如下完成,即将属于同一批次的样品等分试样移液入多孔板的孔中,然后,将所述多孔板通过热单元用热概况处理。这意味着每份样品等分试样具有其自身的孔,并且没有混合样品等分试样(即,流体)。在用于NA扩增的相同热处理外,可以将属于一个批次的样品等分试样平行移液,并且可以以其它方式同时加工(如下文所描述的)。这意味着可以在核酸扩增前已经将样品等分试样分批在一起以进行那些步骤。然而,分批在一起并不意味着将样品等分试样混合,而是将一个批次的等分试样各自定位于不同孔中,并同时加工。此类同时加工至少包括将一个批次的样品等分试样进行相同热概况处理以扩增核酸。对于进行提及的测定法,系统包含本文档来自技高网...
用于核酸测试的改良方法

【技术保护点】
用于核酸分析的方法,牵涉下列步骤:?接受各含有样品的样品管,?接受每份样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的一种或多种测定法,?根据是否要进行一种或多种测定法,获得每份样品的一份或多份样品等分试样,?依照要对所述样品等分试样进行的测定法,将每份样品等分试样归入一个或多个测试类,?将属于同一测试类的样品等分试样组合入同一批次中,所述批次包含要进行第一测定法的样品和要进行第二测定法的样品,?同时扩增所述批次中含有的核酸,?进行所述样品等分试样的分析以测定所述样品等分试样中核酸的存在和/或浓度。

【技术特征摘要】
2011.12.20 EP 11194628.11.用于核酸分析的方法,牵涉下列步骤:-接受各含有样品的样品管,-接受每份样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的一种或多种测定法,-获得每份样品的一份或多份样品等分试样,每一份等分试样对应于根据所述测试请求要进行的一种测定法,-将每份样品的一份或多份样品等分试样归入一个或多个测试类,根据要对每一份样品等分试样进行的测定法,将该样品等分试样归入一个测试类,其中至少根据一个特定样品等分试样要进行的测定法所采用的用于扩增核酸的热概况处理,来选择该特定样品等分试样归入的测试类,-将属于同一测试类的样品等分试样组合入一块多孔板中的一个批次中,所述批次包含要进行第一测定法的样品等分试样和要进行与第一测定法不同的第二测定法的样品等分试样,所述第一测定法和所述第二测定法至少采用相同的热概况处理,-将试剂添加至所述批次中的样品等分试样,-使用相同的用于扩增核酸的热概况处理同时扩增所述批次中的样品等分试样中含有的核酸,-检测来自所述批次中的样品等分试样的信号以测定所述样品等分试样中核酸的存在和/或浓度。2.依照权利要求1的方法,其中归入牵涉检查查找表,该查找表显示要进行的测定法的相应测试类。3.依照权利要求1的方法,若a.)所述第一测定法和所述第二测定法的样品加工步骤是相同的,或b.)所述第一测定法和所述第二测定法二者中采用相同的消耗品,则进一步包括将等分试样归入同一测试类。4.依照权利要求1的方法,其中进行分析牵涉检测来自所述样品等分试样的荧光。5.用于分析含有核酸的样品的系统(1),其包含:-样品接受单元(10),其中接受各含有样品的样品管(3),-阅读器(5),其阅读所述样品管上的标识,-数据管理单元(6),其接受样品的测试请求,所述测试请求规定要对所述样品进行的测定法,所述数据管理单元进一步自所述阅读器接受样品管标识,其中所述数据管理单元根据相应的测试请求确定对于每一份所述样品多少份样品等分试样是...

【专利技术属性】
技术研发人员:P弗兰克A吉斯勒A莫特尔赛德S罗里格
申请(专利权)人:霍夫曼拉罗奇有限公司
类型:发明
国别省市:

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