【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术提供了用于诊断和预测短暂性缺血发作(TIA)的风险和致因的方法和组合物。
技术介绍
短暂性缺血发作(TIA)是常见的，仅在美国，每年就侵袭超过三十万人。尽管从定义来看，TIA症状会得到缓解，但TIA绝不是不严重的。多达25%的TIA患者在TIA后的数天至数周内发生复发性缺血性血管事件(1-3)。虽然其具有高发病率和临床重要性，特异性靶向TIA的疗法的开发仍受到关于其内在生物学的知识匮乏的限制。此外，对TIA的临床诊断是不完善的，并且在错误地诊断为患TIA的个体中进行的大量评价是昂贵的(4)。我们之前已经证实，大鼠中的血液基因表达谱在实验性缺血性卒中和TIA之后发生改变(5)。模拟人类TIA的大鼠中非常短暂的局部缺血，引发脑组织中特征为热激蛋白(HSP70)表达升高、小神经胶质细胞活化和巨噬细胞浸润的明显改变出)。脑细胞功能和炎症中的这种变化改变了血液免疫细胞，利用全基因组表达分析能检测到这一过程(5)。此夕卜，基因及相关功能通路在非常短暂的缺血和缺血性卒中之间明显不同(5)。人类TIA还与系统性炎症中的改变相关。TIA患者倾向于具有升高的C反应蛋白(CRP) (7)、IL-6、VCAM-1和细胞因子水平，以及升高的白细胞计数(8-10)。Lp_PLA2是一种不稳定的动脉粥样硬化斑块的标志物，其同纤维蛋白原(13-14)和D 二聚物(15) —样，也与TIA相关(11-12)。这些生物学差异能否代表TIA的致因或结果仍不清楚。然而，更好地理解由这些差异所代表的病理生理学将有助于开发针对TIA的疗法。基因表达已被用于鉴定缺血性卒中患者和对照之间的差...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.07.14 US 61/364,3341.断短暂性缺血发作(TIA)或经历TIA的倾向的方法，所述方法包括:测定来自患者的生物样本中多种TIA相关生物标志物的表达水平，其中与对照相比，表达水平的升高或降低指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险，其中所述多种TIA相关生物标志物选自表1、2、5A、5B、5C、5D、7、8和9所示的生物标志物。2.按权利要求1所述的方法，其还包括测定选自以下的一种或多种生物标志物的表达水平:CNTN4、TLR5、GPR84、BCL6、NELL2、APBA2 和 MLL。3.按权利要求1至2中任一项所述的方法，其中所述测定步骤在疑似缺血事件之后3小时或更短时间进行。4.按权利要求1至2中任一项所述的方法，其中所述测定步骤在疑似缺血事件之后3小时或更长时间进行。5.按权利要求1至2中任一项所述的方法，其中所述测定步骤在疑似缺血事件之后至少24小时进行。6.按权利要求1至5中任一项所述的方法，其中选自以下的一种或多种TIA相关生物标志物表达水平的升高指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险:DKFZP434B061、FAM55D、FLJ30375、IGFBP5、LTBR 和 SCN2A。7.按权利要求1至6中任一项所述的方法，其中选自以下的一种或多种TIA相关生物标志物表达水平的升高指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险:GABRB2、ELAVL3、TffISTUDPPA4、DKFZP434P211、DLX6、ZNF479、ASTN2、SNX31、ALS2CR11、L0C440345。8.按权利要求1至7中任一项所述的方法，其中选自以下的一种或多种TIA相关生物标志物表达水平的升高指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险:GABRB2、ELAVL3、COLlAl、SH0X2、GA BRB2、TffISTU DPPA4、DKFZP434P211、WIT1、S0X9、DLX6、ANXA3、EPHA3、SOXl 1、SLC26A8、CCRLl、FREM2、ST0X2、ZNF479、L0C338862、ASTN2、FOLHl、SNX31、KREMEN1、ZNF479、ALS2CR11、FIGN、RORB, L0C732096、GYPA, ALPL, LHX2、GALNT5、SRD5A2L2、GALNT14,0V0L2、BMPRlB, UNC5B、0DZ2、ALPL、RASAL2、SHOX, C19orf59、ZNFl 14, SRGAPU ELAVL2、NCRNA00032、L0C440345、FLJ30375, TFPI, PTGRU ROBOU NR2F2、GRM5、LUM、FLJ3905UC0L1A2、CASP5、OPCML, TTC6、TFAP2B、CRISP2、SOXlU ANKRD30B、FLJ3905U SCN2A、MYNN、F0XA2、DKFZP434B061、L0C645323、SNIP、L0C645323、L0C374491、ADAM30、SIX3、FLJ36144,CARD8、KREMENU RP1-127L4.6、FAM149A、B3GAT2、SP0CK3、G30、ITGBLl、IQGAP3、C7orf45、ZNF608、L0C375010、LRP2、TGFB2、SH0X2、H0XC4///H0XC6、ELTD1、FAM182B///RP13-401N8.2、PR00478、LIFR、FOLHl、EHF,NDST3、BRUN0L5、L0C728460、PDE1A、P0U2AF1、FAT1、PCDHlIX///PCDH11Y、FLJ37786、SLC22A4、DHRS13, EHF, MEG3、PIffILU L0C203274、LOClOO 133920///L0C286297、DMRTl、ADM、VWA3B、GAFA3、HESXl、ADAMDEC1、CAVl、LAMB4、TPTE、PPPIRlC、HPSE,A頂2、RUNDC3B、CARD16、FAM124A、MGC39584、OSM、RFX2、MYBPCl、LTBR, C18orf2、SNRPN、FLJ36031、IL1B、TRPMl, OSTCL、MAPK14、KCNJ15///L0C100131955、FIGN、HNT, S100A12、CHITl、C7orf53、FAM13A1、GNAOl、MAPK14、FAM55D、PRKD2、LIMK2, C18orf54、IGFBP5、EVI1、PLSCRU FOXCU L0C646627、ZNF462、CNTLN、ZNF438、DEFB105A///DEFB105B、L0C340017、Clorf67、ACSLl、ADH1B、SLC2A14///SLC2A3、IL1B、ST3GAL4、UBE2J1、PNPLA3 和 PAPPA。9.按权利要求1至8中任一项所述的方法，其中选自以下的一种或多种TIA相关生物标志物表达水平的降低指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险:ATG9B、DIP2C、EDAR、GSTM1、⑶SBL2、SMURF2、ZNF512B。10.按权利要求1至9中任一项所述的方法，其中选自以下的一种或多种TIA相关生物标志物表达水平的降低指示所述患者罹患TIA或有经历TIA的风险:NBPF10///RPl 1-9412.2、SFXNl、SPIN3、UNC84A、OLFM2、PPM1K、P2RY10、ZNF512B、MORF4L2、GIGYF2、ERAP2、SLFNl3, L0C401431、MED6、BAIAP2L1///L0C100128461、LNPEP、MBNLl、NOS3、MCF2L、KIAA1659、SCAMP5、L0C648921、ANAPC5、SP0N1、FUS、GPR22、GAL3ST4、METTL3、L0C100131096、FAAH2、SMURF2、SNRPN、FBLN7、GLS, G3BP1、RCAN3、EPHX2、DIP2C、CCDC141、CLTC、FOSB,CACNA11、UNQ6228、ATG9B、AK5、SPIN3、RBM14、SNRPN、MAN1C1、HELLS、EDAR、SLC3A1、ZNF519、L0C100130070///L0C100130775///L0C100131787///L0C100131905///L0C100132291///L0C100132488///RPS27、ZC3H12B、IQGAP2、S0X8、WHDC1L2、TNPOU TNFRSF21、TSHZ2、DMRTC1///DMRTC1B、GSTM1、GSTM2、PNMA6A、CAND1、CCND3、GSTM1、⑶SBL2。11.按权利要求1至10中任一项所述的方法，其还包括确定卒中致因的步骤。12.按权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述患者患有神经学病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSLl、ADHlB、AK5、ANXA3、APBA2、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、BMPRlB、CASP5、CAVl、CNTN4、DIP2C、ELAVL2、EPHX2、ERAP2、FAM124A、FAM13A、FAM149A、FATl、FOLHl、FOXCl、GABRB2、GIGYF2、GNAOl、GRM5、GSTMl、HESXl、H0XC6、IGFBP5、IL1B、IQGAP2、ITGBLl、LAMB4、LIFR、LTBR、MECOM、NBPFlO, NDST3、NELL2、N0S3、NTM、0DZ2、0LFM2、OPCML, PDE1A、RFX2、ROBOU S100A12、SCN2A、SLC22A4 (包括 EG:6583)、SLC2A3、SLC3A1、S0X9、SP0CK3、SPONUTGFB2、TLR5、TNFRSF21、TRPM1、TSHZ2、TTC6 (包括 EG: 115669)、UNC5B、UNC84A 和 ZNF608。13.按权利要求1至12中任一项 所述的方法，其中所述患者患有骨骼或肌肉病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSL1、ADM、AK5、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、BMPRlB, CARD8、CASP5、CCND3、CLTC、CNTN4、COLIA1、COLIA2、DIP2C、DNAHl4、EDAR、ELAVL2、EPHA3、EPHX2、FAMl24A、F0SB、GABRB2、GIGYF2、GNA01、H0XC6、IL1B、KCNJ15、LAMB4、LIFR、LTBR、LUM、MAPK14、MYBPC1、N0S3、0DZ2、OSM、PAPPA、PDE1A、ROBOl、RUNDC3B、S100A12、SCN2A、SHOX, SLC22A4 (包括EG:6583)、S0X9、SP0CK3、TLR5、TNFRSF21、TNPOl、TSHZ2、TTC6 (包括 EG: 115669)、TffISTUUNC5B.VWA3B 和 ZNF438。14.按权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述患者患有炎性病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSLl、ADM、AK5、ANXA3、APBA2、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CAVl、CCND3、CCRLl、CLTC, CNTN4、DIP2C、DNAH14、EDAR、EPHA3、EPHX2、ERAP2、FAM124A、FBLN7、FOSB, FREM2、GABRB2、GRM5、IL1B、KCNJl5, LAMB4、LHX2、LNPEP, LRP2、LTBR、LUM、MAPK14、MECOM、MYBPCl、N0S3、0DZ2、OPCML, OSM、PAPPA, PDE1A、PPP1R1C、R0B01、RUNDC3B、S100A12、SCN2A、SFXNl、SLC22A4 (包括 EG:6583)、SLC26A8、SMURF2、SNRPN、SPONl、TGFB2、TLR5、TNFRSF21、TNPOl、TTC6 (包括 EG: 115669)、TffISTU UNC5B、VWA3B 和 ZNF438。15.按权利要求1至14中任一项所述的方法，其中所述患者患有心血管病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSL1、ADM、AK5、ALPL、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、BMPRlB, C180RF54、CACNAlI, CARD 16, CAVU CNTN4、DMRT1、DNAH14、EDAR、EPHX2、ERAP2、FAM13A、FOLHU FOSB,FREM2、GABRB2、GRM5、GSTMl、IL1B、IQGAP2、LIFR、LTBR、MANlCl、MAPK14、MBNLl、MCF2L、MECOM、MYBPC1、N0S3、NTM、0DZ2、0LFM2、OPCML、PAPPA、PDEIA、ROBO1、RORB、SIOOA12、SMURF2、SNRPN、S0X9、SP0CK3、SPONl、TFP1、TRPMl、UNC84A 和 VWA3B。16.权利要求1至15中任一项所述的方法，其中所述患者患有免疫学病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSL1、ADM、AK5、ANXA3、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCND3、CCRLl、CLTC, CNTN4、C0L1A2、DIP2C、DNAH14、EDAR、EPHA3、EPHX2、FAM124A、FATl、FOSB,GABRB2、G0LGA6L2、GSTMlG、USBL2、IL1B、IQGAP2、KCNJl5, LAMB4、LTBR、MAPK14、MYBPCl、NELL2、N0S3、NTM、0DZ2、OPCML, OSM、PAPPA, PDE1A、R0B01、RUNDC3B、S100A12、SLC22A4 (包括 EG:6583)、SNRPN、SPONl、TLR5、TNFRSF21、TNPOl、TSHZ2、TTC6 (包括 EG: 115669)、VWA3B和 ZNF438。17.按权利要求1至16中任一项所述的方法，其中所述患者患有代谢病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSLl、ADAM30、AK5、ALPL, ALS2CR11、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCRLl、CNTLN、CNTN4、C0L1A2、DIP2C、DMRTl、DNAH14、EPHA3、EPHX2、FAT1、F0XA2、GABRB2、GUSBL2、IGFBP5、IL1B、IQGAP2、ITGBLl、LRP2、LTBR、MAPK14、MBNLl、NELL2、N0S3、NTM、0DZ2、OPCML, PAPPA、PLSCRl、ROBOl、SLC22A4(包括 EG:6583)、SLC2A3、SLC3A1、SMURF2、SNRPN、SPONl、SRGAPl、TLR5、TSHZ2、UNC84A 和 VWA3B。18.按权利要求1至17中任一项所述的方法，其中所述患者患有内分泌系统病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSLl、ADAM30、AK5、ALPL, ALS2CR11、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCRLl、CNTLN、CNTN4、C0L1A2、DIP2C、DMRTU DNAHl4, EPHA3、FAT1、F0XA2、GABRB2、GUSBL2、IL1B、IQGAP2、ITGBLl、LRP2、LTBR、MAPK14、MBNLl、NELL2、N0S3、NTM、0DZ2、0PCML、PAPPA, PLSCRl、R0B01、SHOX, SLC22A4 (包括 EG:6583)、SLC2A3、SMURF2、SNRPN、SPONl、SRGAP1、TLR5、TSHZ2、UNC84A 和 VWA3B。19.按权利要求1至18中任一项所述的方法，其中所述患者患有自身免疫病，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSL1、ADM、AK5、ASTN2 (包括 EG:23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCND3、CLTC、CNTN4、C0L1A2、DIP2C、DNAH14、EDAR、EPHA3、EPHX2、FAM124A、FOSB, GABRB2、GUSBL2、IL1B、IQGAP2、KCNJl5, LAMB4、LTBR、MAPK14、MYBPCl、NELL2、0DZ2、OPCML, OSM、PAPPA、PDE1A、ROBOl、RUNDC3B、S100A12、SLC22A4 (包括 EG: 6583)、SNRPN、SPONl、TLR5、TNFRSF21、TNP01、TSHZ2、TTC6 (包括 EG: 115669)、VWA3B 和 ZNF438。20.按权利要求1至19中任一项所述的方法，其中所述患者患有糖尿病，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSLl、ADAM30、AK5、ALPL, ALS2CR11、ASTN2 (包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCRLl、CNTLN、CNTN4、COLIA2、DIP2C、DMRTl、DNAHl4、EPHA3、FAT1、F0XA2、GABRB2、GUSBL2、IL1B、IQGAP2、ITGBLl、LTBR、MAPK14,MBNLl、NELL2、N0S3、NTM、0DZ2、OPCML、PAPPA、PLSCRl、ROBOU SLC22A4(包括 EG:6583)、SLC2A3、SMURF2、SNRPN、SPONU SRGAPU TLR5、TSHZ2、UNC84A 和 VWA3B。21.按权利要求1至20中任一项所述的方法，其中所述患者患有结缔组织病症，并且相对于选自以下的多种生物标志物的对照表达水平，所述患者具有所述生物标志物的升高或降低的表达:ACSL1、ADM、ASTN2(包括 EG: 23245)、BCL6、CARD8、CASP5、CCND3、CLTC、CNTN4、COLlAl、COL1A2、DIP2C、DNAH14、EDAR、EPHA3、EPHX2、FAM124A、FOSB, GABRB2、IL1B、KCNJ15、LAMB4、LTBR、LUM、MAPK14、0DZ2、OSM、PAPPA、PDEIA、ROBO1、RUNDC3B、SIOOA12、SHOX、SLC22A4(包括 EG:6583)、TLR5、TNFRSF21、TNPOl、TTC6 (包括 EG: 115669)、VWA3B 和 ZNF438。22.按权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：弗兰克·沙普，展新华，格兰·C·吉克灵，S·克莱波姆·约翰斯顿，
申请(专利权)人：加利福尼亚大学董事会，
类型：
国别省市：
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