用于扩增土壤线虫CO I基因的简并引物组合及其应用制造技术

本发明专利技术提供一种用于扩增土壤线虫CO?I基因的简并引物组合，所述引物组合包括7COX1JB-F1和7COX1JB-R1以及7COX1JB-F2和7COX1JB-R2（如Seq?ID?No.1-4所示）。本发明专利技术利用巢式PCR的方法扩增出土壤线虫的部分COI基因片段，利用该片段可以有效地对土壤线虫进行分类鉴定，对操作人员要求不高，只需熟练PCR操作即可，即使完全没有线虫形态分类鉴定知识的人也可轻松完成，且一次巢式PCR就可以同时完成大量样品的分类鉴定，节约了鉴定时间，与传统方法相比，本发明专利技术选择了CO?I基因，分辨率更高，可以更有效地对土壤线虫进行种的区分，同时填补了土壤线虫分类鉴定领域的空白。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及巢式PCR技术，具体地说，涉及一种用于扩增土壤线虫CO I基因的简并引物组合及其应用。
技术介绍
几乎在所有类型的生态系统中，从海洋到淡水、土壤，从热带到极地地区，从海拔最高到海拔最低的区域都有线虫的存在。线虫可以分为自由生活和寄生生活两大类，自由生活线虫的取食范围包括细菌、真菌、藻类、原生动物以及腐殖质等，而寄生性线虫则在动物和植物中均有发现。土壤线虫是土壤食物链的一个关键环节，在三条土壤的基本能量通路(植物组织、细菌和真菌)中，致病性线虫参与了植物组织通路，食细菌和食真菌的线虫参与了细菌和真菌通路，而杂食性的线虫则涵盖了所有通路，这使得线虫越来越多的被应用于土壤生态系统的指不生物(Yeates. , G. ff. , Bongers, T. , de Goede, R. G. M. , Freckman, D. ff. and Georgieva, S. S. 1993. Feeding habits in soil nematode families and genera—an outline for soil ecologists. Journal of Ne本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于扩增土壤线虫CO?I基因的简并引物组合，其特征在于，包括：第一对引物：7COX1JB?F1:5’?ATACCTWSWWTAATYGGDGGKTTTGG?3’，7COX1JB?R1:5’?AYACCHGTTAAMCCRCCHAHAGTAAA?3’；以及第二对引物：7COX1JB?F2:5’?GGDGCHCCTGATATRAGNTTYCCHCG?3’，7COX1JB?R2:5’?ACYTTHACHCCNGTHGGNACAGCAAT?3’；其中，Y代表碱基C或T，W代表碱基A或T，K代表碱基G或T，D代表碱基G、A或T，R代表碱基A或G，M代表碱基A或C，H代表A、T或C，S代表G或C，N代表A...

【技术特征摘要】
1.用于扩增土壤线虫COI基因的简并引物组合，其特征在于，包括第一对引物7C0X1JB-F1:5’ -ATACCTWSWWTAATYGGDGGKTTTGG-3’，7C0X1JB-R1:5’ -AYACCHGTTAAMCCRCCHAHAGTAAA-3’ ；以及第二对引物7C0X1JB-F2:5， -GGDGCHCCTGATATRAGNTTYCCHCG-3，，7C0X1JB-R2:5’ -ACYTTHACHCCNGTHGGNACAGCAAT-3’ ；其中，Y代表碱基C或T，W代表碱基A或T，K代表碱基G或T，D代表碱基G、A或T，R 代表碱基A或G，M代表碱基A或C，H代表A、T或C，S代表G或C，N代表A、T、C或G。2.含有权利要求1所述简并引物组合的用于检测或进行分类学鉴定土壤线虫的试剂盒。3.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括dNTPs、LATaq DNA 聚合酶、PCR反应缓冲液中的一种或多种。4.根据权利要求2或3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括标准阳性模板。5.权利要求1所述简并引物组合或权利要求2-4任一项所述试剂盒在检测或进行分类学鉴定土壤线虫中的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，包括以下步骤1)提取样品中的DNA；2)以步骤I)中提取的DNA为模板，进行巢式PCR扩增反应；3)分析PCR产物。7.根据权利要求5...

【专利技术属性】
技术研发人员：许崇任，王戎疆，李家练，雷莹，
申请(专利权)人：北京大学，
类型：发明
国别省市：