物种移动鉴别系统、终端、服务器及方法技术方案

技术编号:8022598 阅读:198 留言:0更新日期:2012-11-29 04:49
本发明专利技术涉及一种物种移动鉴别系统,包括:通信终端,用于采集被鉴定对象的二维码图像,并向网络侧发送物种鉴定请求,物种鉴定请求中携带二维码图像;物种鉴定服务器,包括物种数据库,用于接收通信终端发送的物种鉴定请求,并对物种鉴定请求中携带的二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列,然后根据获得的碱基序列在物种数据库进行匹配,并根据匹配物种的信息组装鉴定结论,将鉴定结论反馈给通信终端。本发明专利技术还涉及一种物种鉴定服务器和物种移动鉴别方法。本发明专利技术通过具备摄像/扫描功能的通信终端采集被鉴定对象的二维码图像,并利用网络侧的物种鉴定服务器来进行物种鉴定,整个过程无需手动输入请求参数,因此操作简便,鉴别过程时间短且高效。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及物种鉴定技术,尤其涉及一种。
技术介绍
传统的物种鉴定技术采用形态学的方法鉴定物种,生物分类学家通过生物的外观形态来区分各种生物,但是地球生物物种繁多,据统计地球生物种类超过1000万种,当前已鉴定的物种约170万种,依靠生物分类学家,通过形态学鉴定物种是一项非常艰巨的任 务。同时,相邻的物种往往具有非常相似的形态特征,即使是熟练的分类专家也很难通过形态特征对物种进行快速,准确的鉴定。另外,同一物种在不同的发育时期其形态也是不同的,在某些发育时期可能不具备其用来做物种鉴定的特征,例如,对于种子样品,就无法根据根,茎和叶的形态来做物种鉴定。DNA条形码是近年来发展起来的一项新技术,已经在学术界进行了广泛的研究。DNA条形码指的是生物体DNA序列中一段标准DNA片段,这个片段的序列对研究的物种具有特异性。换句话说,根据DNA序列,就可以确定相应样品的物种来源。在建立DNA条形码数据库的基础上,通过比对待测生物DNA条形码与DNA条形码数据库中的DNA条形码,就可以快速、准确地鉴定物种。在现在已知的基于DNA条形码数据库的物种鉴定系统中,DNA条形码数据库中保存的是已经确定的物种的条形码,在鉴定时,需从待鉴定生物中提取DNA条形码序列,使用序列比对算法在DNA条形码数据库中通过序列匹配找到与待鉴定生物DNA条形码最相似的条形码,如果数据库中最佳匹配的条形码与待鉴定生物条形码的近似度高于给定阈值,则判断待鉴定生物就属于数据库中与之匹配的条形码代表的物种。上述物种鉴定系统采用B/S模式(浏览器/服务器模式),用户通过网页浏览器打开鉴定系统的主页,在鉴定功能栏目中利用专用扫描设备扫描输入待鉴定生物的DNA条形码,发送鉴定请求,服务器接收请求,对该DNA条形码进行鉴定,最后将鉴定结果反馈给客户端。该已知物种鉴定系统尚存在以下缺陷(I)缺乏标准的DNA条形码数据库,在DNA条形码数据库中还存在大量非标准的原始数据或待处理数据,影响鉴别的准确度;(2)缺乏简单,快速,高容量的DNA条形码表达方式;现在的DNA条形码仍然用DNA序列来表示,DNA序列是一段200-600个碱基长的字符串,打印出来占的面积较大,不能直接用来标记相应的样品;(3)缺乏简便的DNA条形码采集和识别方式,当前的DNA条形码用字符串来表示,只能用能够识别字符串的仪器来扫描,识别,速度慢,错误率高;(4)缺乏快速和准确的序列比对方法,当前的方法主要包括常用的基于BLAST的序列相似性比对算法,该算法首先找出被检测序列与标准序列相似的部分,然后再根据这些相似部分中的不相似部分进行比对。这种方法忽视了被测部分与标准序列中不相似的部分,从而降低了鉴定效率。
技术实现思路
本专利技术的目的是提出一种,能够实现以移动方式进行物种信息的采集和识别,使得物种鉴别更为方便快速。为实现上述目的,本专利技术提供了一种物种移动鉴别系统,包括通信终端,用于通过摄像/扫描功能采集被鉴定对象的二维码图像,并向网络侧发送物种鉴定请求,所述物种鉴定请求中携带所述二维码图像;物种鉴定服务器,包括物种数据库,用于接收所述通信终端发送的所述物种鉴定请求,并对所述物种鉴定请求中携带的二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列,然后根据获得的碱基序列在所述物种数据库进行匹配,并根据匹配物种的信息组装鉴定结论,将·所述鉴定结论反馈给所述通信终端。为实现上述目的,本专利技术提供了一种物种鉴定服务器,设于网络侧,包括鉴定请求接收模块,用于接收通信终端发送的物种鉴定请求,所述物种鉴定请求中携带有所述通信终端通过摄像/扫描功能采集到的被鉴定对象的二维码图像;二维码图像解码模块,用于对所述二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列;物种数据库,用于保存各个物种的参考碱基序列;碱基序列匹配模块,用于根据获得的碱基序列在所述物种数据库进行匹配;鉴定结论组装模块,用于根据匹配物种的信息组装鉴定结论;鉴定结论反馈模块,用于将所述鉴定结论反馈给所述通信终端。为实现上述目的,本专利技术提供了一种物种移动鉴别方法,包括网络侧的物种鉴定服务器接收通信终端发送的物种鉴定请求,所述物种鉴定请求中携带有所述通信终端通过摄像/扫描功能采集到的被鉴定对象的二维码图像;所述物种鉴定服务器对所述二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列;所述物种鉴定服务器根据获得的碱基序列在物种数据库进行匹配,并根据匹配物种的信息组装鉴定结论;所述物种鉴定服务器将所述鉴定结论反馈给所述通信终端。为实现上述目的,本专利技术提供了一种物种移动鉴别终端,包括二维码采集模块,用于通过摄像/扫描功能采集被鉴定对象的二维码图像;物种数据库,用于保存各个物种的参考碱基序列;二维码图像解码模块,用于对所述二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列;碱基序列匹配模块,用于根据获得的碱基序列在所述物种数据库进行匹配;鉴定结论组装模块,用于根据匹配物种的信息组装鉴定结论;鉴定结论展示模块,用于通过展示功能展示所述鉴定结论。为实现上述目的,本专利技术还提供了一种物种移动鉴别方法,包括物种移动鉴别终端通过摄像/扫描功能采集到的被鉴定对象的二维码图像;所述物种移动鉴别终端对所述二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列;所述物种移动鉴别终端根据获得的碱基序列在物种数据库进行匹配,并根据匹配物种的信息组装鉴定结论;所述物种移动鉴别终端通过展示功能展示所述鉴定结论。基于上述技术方案,本专利技术通过具备摄像/扫描功能的终端采集被鉴定对象的二维码图像,并在本地或利用网络侧的物种鉴定服务器来进行物种鉴定,整个过程无需手动输入请求参数,因此操作简便,鉴别过程时间短且高效。附图说明此处所说明的附图用来提供对本专利技术的进一步理解,构成本申请的一部分,本专利技术的示意性实施例及其说明用于解释本专利技术,并不构成对本专利技术的不当限定。在附图中图I为本专利技术物种移动鉴别系统的一实施例的结构示意图。图2为本专利技术物种移动鉴别方法的一实施例的流程示意图。 图3为本专利技术物种移动鉴别方法的另一实施例中物种数据库的建立流程的示意图。图4为本专利技术物种移动鉴别方法的又一实施例中二维码图像的编码过程的示意图。图5为本专利技术物种鉴定服务器的一实施例的结构示意图。图6为本专利技术物种移动鉴别终端的一实施例的结构示意图。图7为本专利技术物种移动鉴别方法的再一实施例的流程示意图。具体实施例方式下面通过附图和实施例,对本专利技术的技术方案做进一步的详细描述。针对于现有技术中采用DNA序列的表达方式的缺点,本专利技术利用了二维码所具有的易产生、易采集、可靠性高、信息容量大、尺寸大小可调的特点,将二维码作为DNA的信息载体,并利用日益普及的携带摄像/扫描功能的通信终端、带宽不断提高以及覆盖面积不断扩大的无线网络使得待鉴定对象的信息采集与传输都变得更加简单方便。优选的,利用了哈夫曼编码方法的最优特性和QR 二维码的特性,将两者结合起来生成动态的QR 二维码(也称DDQR)作为DNA条形码序列的信息载体。如图I所示,为本专利技术物种移动鉴别系统的一实施例的结构示意图。在本实施例中,物种移动鉴别系统主要包括通信终端I和物种鉴定服务器2。通信终端I可以是传统通信终端或智能通信终端,要求具备摄像/扫描功能和无线通信能力,能够与网络侧的鉴定设备进行信息的交互。在需要对某个对象进行物种鉴定时,通信终端I本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种物种移动鉴别系统,包括:通信终端,用于通过摄像/扫描功能采集被鉴定对象的二维码图像,并向网络侧发送物种鉴定请求,所述物种鉴定请求中携带所述二维码图像;物种鉴定服务器,包括物种数据库,用于接收所述通信终端发送的所述物种鉴定请求,并对所述物种鉴定请求中携带的二维码图像进行解码,获得对应的碱基序列,然后根据获得的碱基序列在所述物种数据库进行匹配,并根据匹配物种的信息组装鉴定结论,将所述鉴定结论反馈给所述通信终端。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘昶李欢陈士林邢航梁栋
申请(专利权)人:中国医学科学院药用植物研究所北京航空航天大学
类型:发明
国别省市:

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