诺如病毒核酸标准样品的制备方法技术

技术编号:7679864 阅读:280 留言:0更新日期:2012-08-16 02:38
本发明专利技术公开一种诺如病毒核酸标准样品的制备方法,其特征在于按如下步骤进行:提取诺如病毒RNA;RT-PCR反应;目标基因的纯化;目的片段的连接转化;回收质粒;体外转录。本发明专利技术不仅制备过程省时省力,而且所制备的诺如病毒核酸标准样品稳定性高、均匀性好,可以为诺如病毒检测研究、医药研究、应用研究等提供标准样品,以实现不同实验室结果的比对,从而保证实验室的质量控制。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种病毒核酸标准样品的制备方法,尤其是一种省时省力、稳定性高、均匀性好的。
技术介绍
诺如病毒(Norovirus, NV),属杯状病毒科、沃克病毒属的小圆状结构病毒,呈20面体对称,无包膜,电镜下缺乏显著的形态特征,与动物嵌杯病毒不同的是没有明显的嵌杯凹陷或表面孔洞,在氯化铯(CsCl)中的浮密度为1.38 1.41 g / cm。对各种理化因子的抵 抗力较强,耐乙醚、酸及热,IOO0C 30分钟不能完全灭活。诺如病毒在病毒引起的肠道传染病中属常见的致病源,它已成为非细菌性肠胃炎的最主要致病源。该病毒传染性极强,容易引起暴发流行,若治疗不及时或治疗方法不正确,轻者影响人体的生长发育,严重者可导致脱水死亡。近年来,该病毒引起的病例有上升的趋势,对该病的诊断控制尤为重要,但由于诺如病毒不能体外繁殖、无动物模型、不能用组织培养法或动物实验进行分离检测等,阻碍了对该病的病原学、致病机理、诊断方法的研究和防治措施的制订。由于该病毒不但具有上述的特殊性,而且该病毒属于RNA病毒,其RNA极其容易被降解,各自实验室提取RNA病毒,不但费时费力,而且很难保持其稳定性和均匀性,难以保证实验室的质量控制。
技术实现思路
本专利技术是为了解决现有技术所存在的上述技术问题,提供一种省时省力、稳定性高、均匀性好的。本专利技术的技术解决方案是一种,其特征在于按如下步骤进行 a.提取诺如病毒RNA 在离心管中加入Trizol裂解液1000 μ I、感染诺如病毒粪便200 μ I、加入氯仿200 μ I震荡混匀,10 000 g离心15min ;吸取上清液500 μ I加入到500 μ I异丙醇中,反复颠倒混匀,10 000 g离心15min ;弃去上清后,倒置于吸水纸上,沾干液体,加入75%的酒精1000 μ 1,颠倒洗涤,10 000 g离心IOmin ;再弃去上清后,倒置于吸水纸上,沾干液体;4OOOg离心lOsec,用吸干管底的液体,室温干燥3 min ;加入11.5μ I的DEPC水,溶解管内的RNA,2 OOOg离心5sec,4°C保存,做为模板备用; b.RT-PCR 反应 b-Ι.反转录体系5XM-MLV Buffer 4μ1, dNTPs (各 2. 5mmol/L) 2μ1, M-MLV (5υ/μ1) μ , RNA 酶抑制剂O. 5μ1,反转录游引物(20pmol/>L) μ , a步骤所得RNA模板11. 5μ1 ;所述反转录游引物是5’ -TCATTCGACGCCATCTTCATT-3’ ;b-2.反转录条件 42°C水浴lh 2h ; b-3. PCR扩增反应体系IOXPCR Buffer (含 Mg2+) 2· 5μ1,dNTPs (各 2· 5mmol/L) O. 5μ1,Taq DNA 聚合酶(5U/μυ μ ,上游引物、下游引物(20ρπιο1/μ1)各 μ ,b-2的反转录产物O. 5μ1,用无菌水补充至 25μ1 ; 所述上游引物是 5’ -TCATTCGACGCCATCTTCATT-3’ ; 所述下游引物是 5’ -TCACTATGATGCTGATTACTC-3’ ; b-4. PCR扩增条件94°C预变性3min ;94°C变性lmin,53°C退火lmin,72°C延伸I. 5min,30 个循环;72°C 5min ;4°C保存; c.目标基因的纯化 米用 TaKaRa Agarose Gel DNA Purification Kit Ver. 2. O试剂盒,回收目标分子DNA片段; d.目的片段的连接转化 d-Ι连接体系 c步骤所得到的纯化的目的片段4μ1, 2XRapid ligation buffer 5μ1, PGEM-T载体O.5μ1,Τ4 DNA Ligase O. 5μ1,室温连接 Ih ;d-2转化 将上一步骤的连接产物加入到感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴2 Om i η,4 2 °C热应激lmin,冰浴2min,加入800μ1 SOC培养基,150g摇菌I. 5h, I OOOg离心IOmin,弃去培养液,加入新鲜的SOC培养基200μ1,混匀后涂在含有Amp+的LB平板上,风干后,37°C倒置培养12tTll0h ; d-3阳性克隆的筛选 挑取单克隆菌进行培养,用PCR方法进行阳性克隆的筛选,PCR体系及反应条件如b-3、b-4 ; e.回收质粒; f.体外转录 将e步骤所得质粒用SalI进行单酶切,反应体系为10XH Buffer 5μ1,Sail μ ,质粒ΙΟμΙ,双蒸水34μ1 ;37°C 2h,用Omega回收试剂盒回收线性化质粒;转录反应体系为10XT7 RNA polymerase buffer δμΙ, ΤΤ 5μ1, NTP ΙΟμΙ, Rnasin μ ,线性化质粒 5μ1,Τ7RNApolymerase μ ,DEPC处理水 28μ1 ;37°C 2h,然后再加入 IOU DnaseI 2μ1,37°C,30min。本专利技术不仅制备过程省时省力,而且所制备的诺如病毒核酸标准样品稳定性高、均匀性好,可以为诺如病毒检测研究、医药研究、应用研究等提供标准样品,以实现不同实验室结果的比对,从而保证实验室的质量控制。附图说明图I是本专利技术实施例诺如病毒聚合酶基因的RT-PCR扩增电泳图。 图2是本专利技术实施例诺如病毒聚合酶基因系统发育树。具体实施例方式a.提取诺如病毒RNA在离心管中加入Trizol裂解液1000 μ I、人感染诺如病毒粪便200 μ I (购于中国疾病预防控制中心)、同时设阳性对照、阴性对照。加入氯仿200μ I震荡混勻,10 000 g离心15min ;吸取上清液500 μ I加入到500 μ I异丙醇中,反复颠倒混勻,10000 g离心15min ;弃去上清后,倒置于吸水 纸上,沾干液体,加入75%的酒精1000 μ 1,颠倒洗涤,10 000 g离心IOmin;再轻轻弃去上清后,倒置于吸水纸上,沾干液体;4 OOOg离心lOsec,用微量加样器吸干管底的液体,室温干燥3 min ;加入11. 5μ I的DEPC水,轻轻混匀,溶解管内的RNA,2 OOOg离心5sec,4°C保存,做为模板备用; b.RT-PCR 反应 b-Ι.反转录体系5XM-MLV Buffer 4μ1, dNTPs (各 2. 5mmol/L) 2μ1, M-MLV (5υ/μ1) μ , RNA 酶抑制剂0.5μ1,反转录游引物(20pmol/>L) μ , a步骤所得RNA模板11. 5μ1 ;所述反转录游引物是5’ -TCATTCGACGCCATCTTCATT-3’ ; b-2.反转录条件 42°C水浴lh 2h ; b-3. PCR扩增反应体系IOXPCR Buffer (含 Mg2+) 2· 5μ1,dNTPs (各 2. 5mmol/L) O. 5μ1,Taq DNA 聚合酶(5U/μυ μ ,上游引物、下游引物(20ρπιο1/μ1)各 μ ,b-2的反转录产物O. 5μ1,用无菌水补充至 25μ1 ; 所述上游引物是 5’ -TCA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:杜雄伟李叶
申请(专利权)人:大连民族学院
类型:发明
国别省市:

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