一种快速检测α-珠蛋白基因簇拷贝数变异的方法技术

本发明专利技术公开了一种快速检测α-珠蛋白基因簇拷贝数变异的方法，包括以下步骤：设计一对通用引物，三种TaqMan探针，三对加尾引物，样本检测：分别以待检基因和标准基因为模板，加入三对加尾引物，进行首轮巢式荧光定量PCR，得到首轮PCR产物；以首轮PCR产物为模板，加入通用引物及三种TaqMan探针，进行二轮荧光定量PCR，并在每个循环的反应结束后采集荧光信号；根据采集的荧光信号，定量样品的α1、α2珠蛋白基因拷贝数。本发明专利技术在同一反应管中扩增多个目的片段的反应效率能达到高度一致，能准确区分出α-珠蛋白基因11种基因型。本发明专利技术操作简单，通量高，只需要2步PCR循环反应，整个过程不超过2h。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物化学领域，涉及一种快速检测α -珠蛋白基因簇拷贝数变异的方法。
技术介绍
α珠蛋白基因的拷贝数变异(Copy number variation, CNV)在人类基因组中很常见，有研究认为这种现象是人类进行化过程中与疟疾的自然选择相关。α珠蛋白基因缺失和多拷贝，均可导致所编码α珠蛋白表达降低可增高，而导致一系列的生物学性状基因缺失导致α珠蛋白表达减少而导致α-地贫，基因多拷贝导致α珠蛋白表达增加而加重地贫症状。另外，α珠蛋白基因簇中，α I和α 2这两个基因为高GC含量，且高度同源，其编码的多肽链完全相同，基因结构中，两者的Χ、Υ、Ζ盒的DNA序列基本相同，仅在第二内含子及3’端非翻译区有些区别，而且还存在α 2与α I基因在缺失情况下的形成融合基因的情况，这种情况在哺乳动物的基因组DNA序列中并不少见。近年来，多种基于芯片的高通量方法用于识别全基因范围内的CNV，如芯片比较基因组杂交(Array comparative genomic hybridization, Array CGH)、SNP 分型芯片(SNP genotyping arrays)以及深度测序方法本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：周万军，徐湘民，
申请(专利权)人：南方医科大学，
类型：发明
国别省市：