本发明专利技术提供了使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法，所述方法减少了假阳性和假阴性并且改善了分析结果的可靠性。使用阵列比较基因组杂交技术分析核酸突变的方法包括：[步骤(a)：使多个标记的样品核酸逐个与多个相同的探针核酸组接触以实现杂交]，[步骤(b)：获得已经杂交到样点X1至Xn的每个样点中的样品核酸的标记强度F1至Fn，所述样点已经杂交有相同的探针核酸]，[步骤(c)：确定从F1与F2的比较值至F1与Fn的比较值的n-1个比较值中的每个是否落入指定的数值范围]，以及[步骤(d)：比较已经确定为未落入指定的数值范围内的比较值的数目是否超过指定数目并且，在超过指定数目的情况中，判断样点X1为阳性]。n是3以上的整数。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及，所述方法降低来自分析结果的假阳性等的影响并且改善分析结果的可靠性。
技术介绍
阵列比较基因组杂交(CGH)技术已知为这样的方法，其用于在短时间内检测发生在数101Λ至数Mb水平上的基因组结构异常，诸如基因组拷贝数异常(见，例如，非专利文件1和2)。在使用阵列CGH的用于遗传性疾病等的诊断阵列的情况中，变得必要的是精确地诊断与病理状况直接相关的拷贝数异常。因此，作为标准的核酸必定不具有拷贝数变异 (CNV)并且因此应当进行小心的选择和确认包括稀有CNV的情况，以致总是存在麻烦的并且需要复查的情况。此外，在包括用于全基因组分析的阵列、检查出拷贝数异常的情况中，因为难以获得已被证明为对于目标基因组是正常的标准核酸，所以必需对双亲和同胞进行连续检查并且进行重复地复查以确认所述情况是否是假阳性或假阴性或新发生(de novo)拷贝数异常，并且用正常分析物的分析实例和公用数据库验证(见，例如，非专利文件1)。在判断出是假阳性或假阴性的情况中，复查变得必要并且产生这样的问题，即利用一次检查不能做出诊断。
技术介绍
文件非专利文件非专利文件1 :"Arei CGH Shindan Katsuyo Gaido Bukku Shitte Okitai Senshokutai Bisaikozo Ijosho(Arrey CGH Diagnosis Utilization Guidebook, Chromosome Fine Structure Disorder Which Is Need To Know)(阵列CGH诊断使用指南， 需要了解的染色体精细结构异常)”由Joji hazawa等编辑，Iyaku (Medicine and Drug (医学和药物))Journal Co.，Ltd.2 Jssei Imoto, Joji Inazawa “Maikuro Arei Gijusu wo Mochiita CGH Kaiseki :CGH Arei Hou(CGH Analysis Using Microarray Technology :CGH Array Method (使用微阵列技术的CGH分析CGH阵列方法))，，，Saibo Kogaku (细胞技术)，卷23， No.03,355-361(2004)。专利技术概述本专利技术要解决的问题鉴于
技术介绍
的以上问题，本专利技术的一个目的是提供分析核酸突变的方法以及用于执行数据处理的程序，所述方法减小分析结果中假阳性和假阴性的影响，尤其是，减小由于标准核酸的CNV所导致的影响(其为常规阵列比较基因组杂交技术中的问题)，并且改善分析结果的可靠性而不需要复查。此外，本专利技术的另一个目的是提供使用分析核酸突变的方法来诊断源于基因突变的疾病的方法。解决所述问题的方式以上问题已经由以下方法解决。1. 一种使用阵列比较基因组杂交技术来分析核酸突变的方法，其包括步骤(a)使用η组相同的探针核酸组，其中多个样点存在于一个核酸微阵列上并且彼此不同的探针核酸已经被固定在多个所述样点上，使η种标记的样品核酸Sl至Sn逐个地与η组所述探针核酸组接触以实现杂交，步骤(b)选择已经固定有相同探针核酸的η个样点Xl至fti，所述样点Xl至& 选自η组所述探针核酸组，并且获得已经被杂交到η个相应的样点Xl至&中的样品核酸的标记强度Fl至而，步骤(c)将所述样点Xl的标记值Fl与所述标记值F2至1 中的每个比较，由此获得n-1个比较值C2至Cn，并且确定所述比较值中的每个是否落入指定的数值范围内，以及步骤(d):确定在n-1个所述比较值中在所述步骤(c)中已经确定为未落入所述指定的数值范围内的比较值的数目是否超过指定数目，并且在超过所述指定数目的情况下，判断所述样点Xl为阳性，η是3以上的整数，所述样品核酸是分析物核酸或标准核酸，至少Sl是分析物核酸，而Xl是已经与Sl接触的样点。2.根据以上1的分析核酸突变的方法，其中在η种所述样品核酸中至少两种是分析物核酸。3.根据以上1或2的分析核酸突变的方法，所述方法进一步包括步骤(c')确定从F2与Fl的比较值至F2与1 的比较值的n_l个比较值中的每个是否落入指定的数值范围，以及步骤(d')确定n-1个比较值中在所述步骤(c')中已经确定为未落入所述指定的数值范围内的比较值的数目是否超过所述指定数目，并且在超过所述指定数目的情况下，判断样点X2为阳性，样点X2是已经与不同于以上Sl的样品核酸S2接触的样点。4.根据以上1至3中任一项的分析核酸突变的方法，其中在η种所述样品核酸中至少一种是标准核酸。5.根据以上1至3中任一项的分析核酸突变的方法，其中η种所述样品核酸都是分析物核酸。6.根据以上1至5中任一项的分析核酸突变的方法，其中η种所述样品核酸是来源于属于分类学上相同物种的不同个体的核酸。7.根据以上1至6中任一项的分析核酸突变的方法，其中提供η个相同的探针核酸组NSl至NSn，各探针核酸组NSi被提供在具有ρ个样点tn至tip的核酸微阵列上，i是整数并且满足1 < i < η而ρ是整数并且满足2 ( ρ，将彼此不同的探针核酸固定在各探针核酸组NSi的ρ个所述样点tn至tip上，各探针核酸组NSi的ρ个所述样点中的一个是样点Xi，将相同的探针核酸固定到样点、至tnj上，j是整数并且满足1彡j彡P，步骤(a)包括使所述标记的样品核酸Si与所述探针核酸组NSi接触，从而将所述样品核酸Si杂交到已经固定在所述探针核酸组NSi的ρ个所述样点上的核酸上，步骤(b)包括获得已经杂交到各探针核酸组NSi的所述样点tn至、中的样品核酸的标记值Fil至Fip，NSl和NSm选自所述探针核酸组NSl至NSn并且m是整数并且满足2彡m彡n，所述步骤(c)包括以下步骤(cl)比较所述标记值Flj和Riij以确定ρ个比较值Cl “至Cp"，(c2)计算所述比较值Cl"至Cp"的平均值或中央值，以及(c3)基于在所述步骤(c2)中获得的平均值或中央值，设定指定的数值范围，并且判断所述比较值Cl"至Cp"是否落入所述指定的数值范围内。8.根据以上1至7中任一项的分析核酸突变的方法，其中所述样品核酸都用相同的标记物标记。9.根据以上1至8中任一项的分析核酸突变的方法，其中步骤(b)中的所述标记强度？1至而是校正值。10.用于在根据以上1至9中任一项的分析核酸突变的方法中执行数据处理的程序，所述程序执行以下进程⑴和(II)。11.根据以上10的程序，其中所述进程⑴包括以下进程⑴至(ν)，，以及。12. 一种诊断源于基因突变的疾病的方法，所述方法使用根据以上1至9中任一项的分析核酸突变的方法。本专利技术的优势根据本专利技术的分析核酸突变的方法可以降低假阳性和假阴性在分析结果中的影响，尤其是，降低由于标准核酸的CNV所导致的影响(其为常规阵列比较基因组杂交技术中的问题)，并且可以改善分析结果的可靠性。更具体地，即使对于在常规阵列比较基因组杂交技术中由于假阳性和假阴性的影响而需要复查的分析物，根据本专利技术的分析核酸突变的方法不需要复查。因为本专利技术的程序在以上分析核酸突变的方法中执行数据处理，所以可以降低在分析结果中假阳性和假阴性的影响，尤其是由于CNV所导致的本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：仓光昌之，岩木义英，氏原大，
申请(专利权)人：富士胶片株式会社，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。