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一种长非编码RNA及其应用制造技术

技术编号:7305761 阅读:261 留言:0更新日期:2012-05-02 12:54
本发明专利技术提供了一种新的、分离的长非编码RNA,该长非编码RNA具有SEQ?ID?No1所示的序列。本发明专利技术还提供了该长非编码RNA用作肿瘤标志物的用途,以及检测该长非编码RNA的探针和引物。本发明专利技术还提供了该长非编码RNA的抑制剂,该抑制剂能够抑制长非编码RNA的表达及肿瘤细胞增殖。本发明专利技术还提供了包含该抑制剂的药物组合物。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种新的肿瘤标志物及其用途等。
技术介绍
人体中编码蛋白质的基因大约有2-3万个,仅占人类基因组的2%,其余98%不编码蛋白质的基因组DNA最初被认为是没有功能的,是生物体中的垃圾,通常被称为“垃圾DNA。但目前的研究表明,这些垃圾DNA大多可转录产生非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)。根据成熟转录本大小的不同,ncRNA可分为小分子ncRNA (如siRNA,miRNA, piRNA 等),中等长度 ncRNA (70-200nt)和长 ncRNA (long ncRNA, IncRNA, > 200nt)。目前,ncRNA 领域研究较多的是小分子ncRNA,而对hcRNA的研究还处于起步阶段。由于序列内部存在过多的终止密码子,IncRNA不能被翻译成蛋白质,他们通常是以RNA转录本的形式行使其生物学功能,如发育过程中的细胞分化、细胞增殖、细胞凋亡和类固醇代谢等,越来越多的证据表明hcRNA在细胞中起着调控基因表达的重要作用。最近的研究发现hcRNA与细胞的癌变有着极为密切的联系,起肿瘤抑制基因作用的^cRNA表达下降或者缺失会导致肿瘤的发生,已经发现IncRNA与肺癌、非霍杰金淋巴瘤、皮肤T细胞淋巴瘤和慢性淋巴细胞白血病等肿瘤疾病有关。这些研究结果都表明hcRNA在细胞增殖、分化和癌变中发挥着重要的作用,肿瘤相关^cRNA的发现可能会对肿瘤的诊断及基因治疗产生重大的影响。通过大范围分析肿瘤和正常组织的hcRNA,可以鉴定与肿瘤特异相关的hcRNA,使其成为潜在的病理诊断标记。通过引入针对具有癌基因特性的hcRNA的shRNA可以有效地表达特异性的 siRNA并抑制^cRNA作用的发挥,比其他的治疗手段的毒副作用会更低。相反,通过病毒载体或质粒载体过表达具有肿瘤抑制基因作用的hcRNA,进而抑制其调控的特定靶基因的表达,也可以达到抑制肿瘤生长的效果。因此,发现肿瘤特异性表达的hcRNA对基于hcRNA 的肿瘤诊断和治疗具有十分重要的意义。
技术实现思路
本专利技术涉及以下按顺序编号的段落中定义的主题1. 一种分离的寡聚核酸分子,其特征在于所述核酸分子选自1)序列表中SEQ ID Nol所示的核酸分子;2)与序列表中SEQ ID Nol所示的核酸序列具有90%或以上同源性的寡聚核酸分子。2.段落1所述的寡聚核酸分子作为肿瘤标志物的应用。3.根据段落2所述的寡聚核酸分子作为肿瘤标志物的应用,其特征在于所述肿瘤选自肝癌、乳腺癌、卵巢癌或食管癌。4. 一种在分离的样本中检测段落1所述的寡聚核酸分子的方法,其特征在于所述方法为杂交法、扩增法或测序法。5.根据段落4所述的检测寡聚核酸分子的方法,其特征在于所述杂交法为Northern杂交或者基因芯片杂交。6. 一种探针,其特征在于,该探针能够检测段落1所述的寡聚核酸分子。7.根据段落6所述的探针,其特征在于,所述探针具有SEQ ID No 6所示的核酸序列。8.段落6或7所述探针在制备肿瘤检测试剂中的应用。9. 一种诊断肿瘤的检测系统,其特征在于该检测系统包含段落6或7所述的探针。10.根据段落4所述的检测寡聚核酸分子的方法,其特征在于所述扩增法为实时荧光定量聚合酶链式反应。11. 一组寡聚核酸分子,其特征在于,所述寡聚核酸分子为逆转录引物6碱基随机逆转录引物;上游引物5,-AGATTCCCATTTTGGCTTTG;下游引物5,-GGTGACATGGTGCTGTTTCA;12.段落11所述的寡聚核酸分子组合在制备肿瘤检测试剂中的应用。13. 一种诊断肿瘤的检测系统,其特征在于所述检测系统包含段落11中所述的寡聚核酸分子。14.根据段落13所述的检测系统,其特征在于该系统还包括逆转录酶及其反应缓冲液、四种脱氧核糖核苷酸底物、DNA聚合酶、荧光定量PCR反应缓冲液、人工合成的内参及正常人对照品。15.根据段落4所述的检测寡聚核酸分子的方法,其特征在于所述测序法为高通量测序。16. 一种诊断肿瘤的方法,其特征在于,该方法包含以下步骤1)测定离体样本中段落1所述的寡聚核酸分子的水平;2)比较被测定样本中段落1所述的寡聚核酸分子的水平与参考样本中的段落1所述的寡聚核酸分子的水平,如果与参考样本相比,被测定样本中该寡聚核酸分子的水平有显著改变,说明肿瘤的存在。17.根据段落16所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述方法为杂交法、扩增法或测序法。18.根据段落17所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述杂交法为Northern杂交或者基因芯片杂交。19.根据段落17所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述扩增法为实时荧光定量聚合酶链式反应。20.根据段落17所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述测序法为高通量测序。21.根据段落16-20任一项所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述显著改变为显著增加。22.根据段落16-20任一项所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述离体样本选自分离的体液、淋巴结样本或组织样本。23.根据段落16-22任一项所述的诊断肿瘤的方法,其特征在于所述肿瘤选自肝癌、乳腺癌、卵巢癌或食管癌。24. 一种试剂,其特征在于能够降低SEQ ID Nol所示寡聚核酸分子的水平。25.根据段落M所述的试剂,其特征在于所述试剂为小干扰核酸。26.根据段落M所述的试剂,其特征在于所述试剂为反义核酸。27.根据段落25所述的试剂,其特征在于所述小干扰核酸选自SEQ ID Nol514所示的序列或所示序列的修饰产物。28.根据段落沈所述的试剂,其特征在于所述反义核酸选自SEQ ID No 2546所示的序列或所示序列的修饰产物。29.根据段落27或观所述的试剂,其特征在于所述修饰为如下修饰中的至少一种1)对核酸序列中连接核苷酸的磷酸二酯键的修饰;2)对核酸序列中核苷酸的核糖的2’ -OH的修饰;3)对核酸序列中核苷酸的碱基的修饰。30. 一种肿瘤细胞增殖抑制剂,其特征在于包含有效量的段落M-四任一项所述的试剂。31. 一种药物组合物,其特征在于包含有效量的段落M-四任一项所述的试剂及药学上可接受的载体。32.段落24- 任一项所述的试剂在制备治疗肿瘤的药物中的应用。33.根据段落32所述的应用,其特征在于所述肿瘤选自肝癌、乳腺癌、卵巢癌或食管癌。34. 一种治疗肿瘤的方法,其特征在于包含步骤给需要治疗的对象应用 0. l-50mg/kg体重/天的段落M-四任一项所述的试剂。35.根据段落34所述的治疗肿瘤的方法,其特征在于所述肿瘤为高表达SEQ ID Nol所示序列的肿瘤类型。36.根据段落35所述的治疗肿瘤的方法,其特征在于所述肿瘤为高表达SEQ ID Nol所示序列的肝癌、乳腺癌、卵巢癌或食管癌。本专利技术要解决的技术问题是根据个体样本中非编码RNA的表达水平进行肿瘤的诊断,特别是乳腺癌、肝癌、肺癌、食管癌等的诊断。本专利技术要解决的问题还涉及提供用于肿瘤诊断的方法及相应诊断试剂。本专利技术要解决的另一个问题是提供用于抑制肿瘤细胞增殖的抑制剂及用于肿瘤治疗的药物组合物。本专利技术经过广泛而深入的研究,发现并分离出新的可做为肿瘤标志物的寡聚核酸分子Yiya。该寡聚核酸分子在正常组织或者癌旁组织中不表达或表达量很低,在肿瘤组织中广本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分离的寡聚核酸分子,其特征在于所述核酸分子选自1)序列表中SEQID Nol所示的核酸分子;2)与序列表中SEQID Nol所示的核酸序列具有90%或以上同源性的寡聚核酸分子。2.权利要求1所述的寡聚核酸分子作为肿瘤标志物的应用。3.根据权利要求2所述的寡聚核酸分子作为肿瘤标志物的应用,其特征在于所述肿瘤选自肝癌、乳腺癌、卵巢癌或食管癌。4.一种在分离的样本中检测权利要求1所述的寡聚核酸分子的方法,其特征在于所述方法为杂交法、扩增法或测序法。5.根据权利要求4所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员:杜权丁先锋梁子才
申请(专利权)人:北京大学
类型:发明
国别省市:

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