本发明专利技术的实施方案包括通过使用分离的或部分纯化的糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白、包含糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞提取物和/或在包含一种或多种糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞中改变极端酶的酶活性或溶解性或翻译后修饰目标蛋白质的方法。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术大体上涉及生物
更具体地说,本专利技术的实施方案涉及蛋白质的翻译后修饰。
技术介绍
直到最近,人们认为细菌通常并未使其蛋白质糖基化。虽然已报道一些例子,但这些被当作罕见的异常情况而摒弃(Borman 2006)。现在人们逐渐接受细菌以比真核生物可能更多的方式使其蛋白质糖基化,尽管这种看法尚未得到广泛认同(Schaffer等,2001)。 在最近的评论文章中声明,已显示糖基化有助于蛋白质稳定性、调节物理性质(如溶解性)、保护蛋白质免受水解、改变活性和靶向外化(Upreti等,200 。1994年,一组人员从酸热脂环酸芽孢杆菌(Alicyclobacillus acidocaldarius)中纯化淀粉酶并表示该淀粉酶在活性生长期间与细胞结合(khwermarm等,1994)。随着培养进入稳定期,细胞将活性可溶糖基化形式的淀粉酶释放至培养基中(khwermarm等,1994)。未尝试比较各种形式的淀粉酶的活性。
技术实现思路
本专利技术的实施方案包括通过用化学糖基化的方式和/或分离的或部分纯化的糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白、包含糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞提取物,和 /或在包含一种或多种糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞中改变极端酶或其它蛋白质的酶活性的方法。本专利技术的实施方案包括翻译后修饰蛋白质的方法。在一些实施方案中,翻译后修饰可通过使用糖基化(包括化学糖基化)、聚乙二醇化、磷酸化、甲基化或其它形式的翻译后修饰的方式进行,和/或是分离的或部分纯化的糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白,包含糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞提取物,和/或在包含一种或多种糖基转移酶和/或翻译后修饰蛋白的细胞中。本专利技术的实施方案包括翻译后修饰蛋白,所述翻译后修饰蛋白包括但不限于SEQ ID NOS :307(celB)、331(内切葡聚糖酶C)、333(肽聚糖N-乙酰氨基葡萄糖脱乙酰酶)、335 ( β -半乳糖苷酶)、337 (阿拉伯呋喃糖苷酶)和 338 ( α -木糖苷酶)。因此实施方案包括上述蛋白质的糖基化形式。本专利技术的第一方面涉及从极端微生物分离的酶,所述酶在温度高于约80°C和pH 低于约2时显示最佳的酶活性。本专利技术的另一方面涉及来源于酸热脂环酸芽孢杆菌(ATCC 27009)的半纤维素酶。本专利技术的再一方面涉及用于降解复合生物分子的酶。 更进一步地,本专利技术的再一方面涉及可用于同时糖化和发酵过程以将生物质糖转化为终产物的酶。本专利技术的再一方面涉及处理生物质的方法,所述方法包括以下步骤提供具有生物质糖的生物质源,用来源于酸热脂环酸芽孢杆菌(ATCC 27009)的水溶性半纤维素酶预处理生物质以产生终产物。本专利技术的再一方面涉及制备半纤维素酶的方法,所述方法包括以下步骤提供酸热脂环酸芽孢杆菌(ATCC 27009)源;在有上清液的微生物营养培养基中培养酸热脂环酸芽孢杆菌(ATCC 27009);从营养培养基上清液中分离酸热脂环酸芽孢杆菌的细胞;以及从营养培养基上清液回收并纯化来源于酸热脂环酸芽孢杆菌(ATCC 27009)的半纤维素酶。而且,本专利技术的再一方面涉及水解多糖的方法,所述方法包括以下步骤提供来源于微生物的水溶性半纤维素酶;在PH低于约2时用水溶性半纤维素酶进行多糖的水解。以下将更详细地描述本专利技术的这些和其它方面。附图简述图 1 分另Ij 描述了 SEQ ID NO :1 (RAAC00164)与 ref | YP_001223775. 11、 ref|YP_729290. 1 |、ref|ZP_01084440. 1 |、ref|ZP_01079150. 1 | 禾口 ref |ZP_01471594. l| (SEQ ID NOS :3_7)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ IDN0:1指定的功能。用“*”表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 2 分别描述了 SEQ ID NO 18 (RAAC00517)与 ref | ZP_00589533. 11、 refIZP_01386435. 11、ref|YP_378533. 11、ref|ZP_00513158. 11 和 ref|YP_374173. 11(SEQ ID NOS 20-24)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ ID NO :18指定的功能。用 “*”表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 3 分别描述了 SEQ ID NO 35 (RAAC00650)与 ref | YP_001127183. 11、 refIΖΡ_02038504. 1 |、ref|ΥΡ_00164798 7. 1 |、ref|YP_001377 1 1 4· 1 | 禾口 ref |NP_835081. l| (SEQ ID NOS :37-41)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ ID N0:35指定的功能。用“*”表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 4 分别描述了 SEQ ID NO 52 (RAAC00991)与 ref | ZP_02327412. 11、 ref I ΥΡ_001487207. 11、ref | ΖΡ_01172765. 11、ref | NP_831314. 11 和 ref | NP_844008. 11 (SEQ ID NOS 54-58)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ ID NO :52指定的功能。用 “*”表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 5A 和 5B 分别描述了 SEQ ID NO :69 (RAAC01110)与 ref | YP_001519856. 11、ref |YP_711688. 11、ref | ZP_01331931. 11、ref | YP_001076955. 11 和 ref | YP_336440. 11 (SEQ ID NOS 71-75)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ ID NO :69指定的功能。用 “*”表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 6A 禾口 6B 分别描述了 SEQ ID NO 86 (RAAC01166)与 gb|AAR99615. 1|、 gb|ABM68334. 2|,ref |ZP_01372248. 11、ref | ΥΡ_519555· 11 和 ref | ΖΡ_022;34077· 11 (SEQ ID NOS 88-92)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中SEQ ID NO :86指定的功能。用“*” 表示所有序列中的保守氨基酸,并且用“”表示一般保守氨基酸。图 7 分另Ij 描述了 SEQ ID NO 103 (RAAC01167)与 ref | ZP_01515212. 11、 refIΥΡ_001277643. 1 |、ref|ΖΡ_0229 1400. 1 |、ref|ΥΡ_001633727· 1 | 禾口 ref |YP_001434357. 1 (SEQ ID NOS :105-109)之间的序列比对,所述序列均具有对表1中 SEQ ID NO :1本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种分离的和/或纯化的糖基化蛋白,其中所述糖基化蛋白包括SEQ ID NO:307。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员:D·N·汤普森,
申请(专利权)人:巴特勒能源同盟有限公司,
类型:发明
国别省市:US
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