烟草腺毛cDNA表达谱芯片及其制备与应用制造技术

技术编号:6059969 阅读:333 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及一种烟草腺毛cDNA表达谱芯片及其制备与应用。本发明专利技术通过分离烟草叶面腺毛,提取总RNA,构建烟草腺毛cDNA文库;对cDNA文库进行随机测序,获得烟草腺毛EST数据库,利用PCR扩增EST序列,制备出烟草腺毛cDNA表达谱芯片;该芯片对烟草腺毛和去腺毛叶片基因表达进行分析,获得腺毛中表达上调的ESTs,筛选出特异表达基因。本发明专利技术制备出的芯片具有高效、灵敏、高通量、高精确性、特异性强的优势,可一次检测大量基因的表达模式,并在在相同试验条件下,综合分析多个样品的基因表达变化规律,适用于烟草腺毛与栽培措施、环境胁迫等关系方面的研究。

Tobacco trichome cDNA expression spectrum chip and its preparation and Application

The invention relates to a tobacco trichome cDNA expression spectrum chip, and the preparation and application thereof. The separation of tobacco leaf trichome, total RNA extraction, construction of tobacco trichome cDNA library; random sequencing of cDNA library for tobacco trichome EST database, EST sequence is amplified by PCR, prepared tobacco trichome cDNA microarray chip; the analysis of tobacco leaf trichome and trichome to gene expression was up-regulated ESTs trichome specific expression gene, screening. Chips prepared by the invention has the advantages of high efficiency, high throughput, high sensitivity, accuracy and specificity, the expression pattern of a large number of genes in the detection, and under the same experimental conditions, a comprehensive analysis of the expression of multiple samples of gene variation, suitable for tobacco cultivation measures, environment and glandular hairs the relationship between the stress.

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因芯片领域,具体涉及一种烟草腺毛CDNA表达谱芯片及其制备与应用。
技术介绍
植物腺毛作为植物表皮细胞的特化结构,因其在植物病虫害防御、抵抗逆境胁迫以及次生产物合成等过程中所起的重要作用而倍受关注。随着功能基因组学技术的进步, 利用芯片技术研究植物腺毛的发育、代谢和分泌的分子机制逐渐成为植物生物学研究领域的一大热点。拟南芥因其完整的基因组信息和完善的芯片产品,其腺毛的分子生物学研究存在诸多有利条件。但由于拟南芥属于典型非分泌型腺毛,因而这些有利条件无法在腺毛物质代谢和分泌领域广泛应用。烟草腺毛属于典型的分泌型腺毛,其主要分泌物是糖脂和二萜类化合物,与烟叶的品质和抗性密切相关。目前关于烟草腺毛的研究多集中在腺毛类型、密度、组织结构、化学成分等方面,而对于烟草腺毛的生长发育及物质代谢的分子机制还缺乏深入研究。虽有一些利用分子生物学技术对烟草腺毛的特异基因进行克隆和表达的报道,但目前对烟草腺毛的基因表达模式进行全景式分析仍缺乏有效的途径。这与烟草基因组庞大,测序尚未完成,Genebank中烟草基因信息缺乏,商业化烟草基因芯片不完善有关。目前,市场上出现的 Agilent和本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种烟草腺毛cDNA表达谱芯片,包括载片,在其平面上包覆有带正电荷的膜,在该膜的表层设有点阵,点阵上排布样点,其特征在于,在该点阵上排布有含来源于烟草腺毛cDNA克隆的PCR 产物,且含有阳性对照和阴性对照样点。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:崔红张松涛杨慧娟叶协锋冀浩靳超肖炳光刘国顺
申请(专利权)人:河南农业大学
类型:发明
国别省市:41

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