【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及检测Hl和H3亚型流感病毒的核苷酸序列和试剂盒,尤指快速的基于 LNA和MGB修饰的短探针单重和双重荧光RT-PCR检测核苷酸序列和试剂盒,不仅适用于不 同动物组织样本中Hl和H3亚型流感病毒的准确检测,还可适用于不同动物活体样本(主 要为拭子样品)H1和H3亚型流感病毒的检测,可用于动物Hl和H3亚型流感病毒的筛查, 出入境检疫等,属于检验检疫领域。
技术介绍
自1934年首次分离出甲型流感病毒以来,由Hl或H3亚型的流感病毒已引起多次 世界性的人和动物的大流行以及大流行间期的小流行。Hl和H3亚型流感病毒感染宿主范 围广,主要感染宿主包括人,禽,猪、马以及其他多种动物。而且其中一些毒株具有在多种动 物间传播的能力,例如引起人类历史上多起大流感流感的病原均可在人、猪之间传播。从 1989年和1990年发生于我国的马流感疫情中分离出的H3N8亚型的马流感毒株(A/马/吉 林/1/89),该毒株的6个基因片段为禽源片段。2009年全球大流行的甲型Him流感病毒 是一个新型流感变异株,目前研究已经证明该毒株可自然感染猪、犬猫等哺乳动物。目前采用TaqM ...
【技术保护点】
一组检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其核苷酸序列如序列表SEQID NO:1至SEQ ID NO:6,其中序列SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2分别为检测H1亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO:3为检测H1亚型流感病毒HA基因的LNA修饰的荧光探针,序列SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5分别为检测H3亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO:6为检测H3亚型流感病毒HA基因的荧光探针。
【技术特征摘要】
一组检测H1和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其核苷酸序列如序列表SEQID NO1至SEQ ID NO6,其中序列SEQ ID NO1和SEQ ID NO2分别为检测H1亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO3为检测H1亚型流感病毒HA基因的LNA修饰的荧光探针,序列SEQ ID NO4和SEQ ID NO5分别为检测H3亚型流感病毒HA基因的正义引物和反义引物,序列SEQ ID NO6为检测H3亚型流感病毒HA基因的荧光探针。2.根据权利要求1所述的检测Hl和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其特征在于所 述探针序列SEQ ID NO 3的5,端标记报告荧光基团HEX,3,端标记淬灭荧光基团TAMRA, 第5、7、9、11位的碱基用LNA进行修饰。3.根据权利要求1所述的检测Hl和H3亚型流感病毒的核苷酸序列,其特征在于所 述探针序列SEQ ID NO 6的5’端标记报告荧光基团FAM,3’端标记MGB基团。4.一种检测Hl和H3亚型流感病毒的试剂盒,由以下组分组成1)裂解液2)Hl亚型单重荧光RT-PCR反应液,包括PCR缓冲液、RT缓冲液、MgCL2、dNTP、Hl正义 引物、Hl反义引物和Hl荧光探针3)H3亚型单重荧光RT-PCR反应液,包括RT缓冲液、MgCL2,dNTP、H3正义引物、H3反 义引物和H3荧光探针4)Hl和H3双重荧光RT-PCR反应液,包括RT缓冲液、MgCL2、dNTP、Hl正义引物、Hl反 义引物、Hl荧光探针,H3正义引物、H3反义引物、H3荧光探针5)RT-PCR酶颗粒6)Taq DNA聚合酶7)DEPC水8)阴性对照流感病毒阴性组织样品,用0.01mol/L pH7. 2PBS缓冲盐水制成20%悬 液,70°C作用1小时;9)阳性对照为体外转录的非感染性RNA片段,其对应的DNA序列为序列表SEQ...
【专利技术属性】
技术研发人员:张鹤晓,高志强,乔彩霞,蒲静,谷强,张伟,刘环,张利峰,汪琳,柏亚铎,张向东,
申请(专利权)人:中华人民共和国北京出入境检验检疫局,
类型:发明
国别省市:11[中国|北京]
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