一种TRIM相互作用蛋白的预测方法技术

本发明专利技术公开了一种TRIM相互作用蛋白的预测方法。本发明专利技术基于目前公开的文献收集TRIM‑target互作数据，结合肺腺癌(LUAD)的蛋白质组学和转录组学数据，构建了基于K近邻算法(KNN)的TRIM靶蛋白预测模型(LUAD‑TRIMCIVtargeter)。该预测模型在肺腺癌背景下展现出良好的预测性能，能有效识别TRIM CIV亚家族的特异性靶蛋白，在癌症研究中能够提供更精确的靶蛋白预测，为肿瘤发生机制的深入研究提供了强有力的工具。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息，特别涉及一种trim相互作用蛋白的预测方法。

技术介绍

1、trim(tripartite motif-containing protein，三基序蛋白)家族是人类中一个重要的蛋白质家族，共有70多个成员，其n端通常包含三个保守结构域：ring指结构域、一个或两个b-box结构域，以及coiled-coil螺旋卷曲结构域(ccd)。其c端结构域则呈高度多样化，常见的包括pry结构域和spry结构域。依据结构域的组成和排列方式，trim家族可划分为12个亚家族(ci至uc)。

2、trim蛋白广泛参与细胞增殖、分化、凋亡、免疫调节等多个生物过程，尤其在肿瘤发生发展中扮演重要角色。研究表明，trim蛋白中位于c端的pry-spry结构域在底物识别和蛋白互作中起到核心作用。其中，civ亚家族成员以pry-spry结构域为标志，约占trim家族的一半，是泛素化相关通路中关键的调控因子，已被证实与多种癌症密切相关。因此，系统识别trim civ亚家族的底物和互作蛋白，有助于深入理解其在癌症发生机制中的作用。p>

3、传统上本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种TRIM相互作用蛋白的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于，在步骤(5)之后还包含如下步骤：

3.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于：

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【技术特征摘要】

1.一种trim相互作用蛋白的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于，在步骤(5)之后还包含如下步骤：

3.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于：

4.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于：

5.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于：

6.根...

【专利技术属性】
技术研发人员：高学娟，黄依莎，刘婉婷，曾观娣，于秀岭，
申请(专利权)人：暨南大学，
类型：发明
国别省市：