一种与甘薯块根颜色、花青素含量相关的SNP标记及其应用制造技术

本发明专利技术属于甘薯育种技术领域，提供了一种与甘薯块根颜色、花青素含量相关的SNP标记及其应用，所述SNP标记位于甘薯第10a号染色体的第25658800位，碱基多态性为A/T。当待测样本的SNP基因型为A/T时，块根花青素含量高，颜色为紫色；SNP基因型为T/T时，块根花青素含量较低，大概率呈现非紫色。本发明专利技术提供的检测方法和试剂盒，通过甘薯自然群体表型鉴定，验证开发的SNP标记鉴定紫薯的效率达到了100％，鉴定非紫薯的效率达到了85.04％，可以快速、精准检测甘薯块根颜色和花青素含量的高低，具有操作简便、成本低廉等优势，可满足大规模分子标记辅助选择的需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及甘薯育种，尤其涉及一种与甘薯块根颜色、花青素含量相关的snp标记及其应用。

技术介绍

1、花青素(anthocyanins)是一种类黄酮化合物，是当今发现最有效的抗氧化剂，也是最强效的自由基清除剂，具有抗突变的功能。因其符合人们对天然、安全、健康的需求，富含花青素的产品受到了人们的追捧。在植物中花青素的合成途径由结构基因和调节基因协同调控。参与花青素合成的调节基因主要是myb转录因子、bhlh转录因子和wd40重复蛋白，它们通常形成mbw复合体调节花青素通路结构基因的表达，从而调控植物中花青素的合成。甘薯不仅拥有全面均衡的营养价值，还具备显著的保健功能。其块根蕴含多种营养物质，其中花青素的含量尤为突出，那些薯肉呈现紫色的甘薯，正是因富含这种成分而独具特色。

2、在现有技术中，栽培甘薯作为六倍体物种，不仅遗传背景高度杂合，还存在广泛的杂交与自交不亲和现象。这些生理特性极大地阻碍了甘薯遗传群体的构建，导致通过连锁分析获得的遗传位点数量有限，严重限制了其在深入研究及育种实践中的应用。

3、snp作为继限制性酶切片断长度多态性本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与甘薯块根颜色、花青素含量相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于甘薯第10a号染色体的第25658800位，碱基多态性为A/T。

2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述碱基多态性为A/T，有AT、TT两种基因型；

3.一种含有权利要求1或2所述SNP标记的SNP-KASP标记，其特征在于，所述SNP-KASP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

4.一种检测权利要求3所述SNP-KASP标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括正向引物F1、正向引物F2和反向引物R；

5.一种检测权利要求3所述SNP...

【技术特征摘要】

1.一种与甘薯块根颜色、花青素含量相关的snp标记，其特征在于，所述snp标记位于甘薯第10a号染色体的第25658800位，碱基多态性为a/t。

2.根据权利要求1所述的snp标记，其特征在于，所述碱基多态性为a/t，有at、tt两种基因型；

3.一种含有权利要求1或2所述snp标记的snp-kasp标记，其特征在于，所述snp-kasp标记的核苷酸序列如seq id no.1所示。

4.一种检测权利要求3所述snp-kasp标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括正向引物f1、正向引物f2和反向引物r；

5.一种检测权利要求3所述snp-kasp标记的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求4所述的引物组。

6.一种检测甘薯块根颜色或花青素含量的方法，其特征在于，包括以下步骤：

7.根据权利要求6所述的方法，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：肖世卓，曹清河，戴习彬，周志林，赵凌霄，赵冬兰，张安，袁蕊，王珧，王洁，李青莲，宁通，赵路宽，
申请(专利权)人：江苏徐淮地区徐州农业科学研究所江苏徐州甘薯研究中心，
类型：发明
国别省市：