蛋白质亲和力预测方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质制造方法及图纸

技术编号:46590622 阅读:2 留言:0更新日期:2025-10-10 21:24
本发明专利技术涉及计算机辅助药物设计技术,提供一种蛋白质亲和力预测方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质,所述方法包括:获取蛋白质的三维结构,三维结构包括多条蛋白质链,每一蛋白质链包括多个氨基酸;根据氨基酸之间的连接关系确定每一氨基酸的特征向量,连接关系包括属于同一条蛋白质链的氨基酸之间的链内连接和属于不同蛋白质链的氨基酸之间的链间连接;将所有氨基酸的特征向量输入预先训练的预测模型,得到蛋白质的结合自由能,以根据结合自由能计算蛋白质的亲和力。本发明专利技术通过氨基酸之间的链内连接和链间连接,使得确定出氨基酸的特征更为全面,实现蛋白质‑蛋白质结合亲和力的精确预测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及计算机辅助药物设计,具体而言,涉及一种蛋白质亲和力预测方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质


技术介绍

1、蛋白质-蛋白质相互作用是指两种或多种蛋白质之间通过物理接触产生的相互作用,这种相互作用在许多生物过程中起关键作用,如信号传导、免疫反应和代谢控制。

2、亲和力是指蛋白质-蛋白质相互作用的强度或稳定性,亲和力反映了两种蛋白质之间结合的紧密程度,随着数据和计算能力的提升,人工智能的方法在蛋白质-蛋白质结合亲和力的预测中展现出巨大的潜力。

3、如何提高蛋白质-蛋白质结合亲和力预测的准确性是本领域技术人员亟待解决的技术问题。


技术实现思路

1、本专利技术目的在于提供一种蛋白质亲和力预测方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质,其通过氨基酸之间的链内连接和链间连接,使得确定出氨基酸的特征更为全面,进而利用更全面的氨基酸的特征实现蛋白质的结合自由能的精确预测,最终实现蛋白质-蛋白质结合亲和力的精确预测。

2、本专利技术的实施例可以这样实现:</p>

3、第一本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质亲和力预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述氨基酸之间的连接关系确定每一所述氨基酸的特征向量的步骤包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述以所述氨基酸为节点、根据所述氨基酸之间的连接关系确定对应节点之间的边及边特征向量,生成图结构的步骤包括:

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述以所述氨基酸为节点、根据所述氨基酸之间的连接关系确定对应节点之间的边及边特征向量,生成图结构的步骤之前,包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述若所述两个氨基酸...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质亲和力预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述氨基酸之间的连接关系确定每一所述氨基酸的特征向量的步骤包括:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述以所述氨基酸为节点、根据所述氨基酸之间的连接关系确定对应节点之间的边及边特征向量,生成图结构的步骤包括:

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述以所述氨基酸为节点、根据所述氨基酸之间的连接关系确定对应节点之间的边及边特征向量,生成图结构的步骤之前,包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述若所述两个氨基酸属于同一条蛋白质链,则根据所述空间距离及第一预设值,确定所述两个氨基酸的链内连接的步骤包括:

6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述图结构中的每一节点对应的氨基酸均有一个初始向量,所述根据所述图结构更...

【专利技术属性】
技术研发人员:陆遥遥丁灏唐可馨
申请(专利权)人:上海图灵智算量子科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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