【技术实现步骤摘要】
本申请涉及生物，具体涉及一种组合物及其在亚硫酸氢盐转化dna中的应用。
技术介绍
1、dna中的5-甲基胞嘧啶(5mc)是一种基本的表观遗传学标记，在基因转录调控、细胞分化、胚胎发育、x染色体失活、基因印记和肿瘤的发生等方面起着至关重要的作用。dna甲基化处于动态变化中，能够像年轮一样记录环境因素的影响，是最有应用前景的表观遗传标志物。目前常作为肿瘤早筛、预后的生物标志物。
2、美国专利us9868756b2保护了一种将核酸中的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基的方法，亚硫酸根离子存在下孵育核酸，由此使核酸脱氨。将脱氨基的核酸结合到固相上，在碱性条件下孵育脱氨基固相结合核酸，由此使脱氨基核酸脱磺化，从而将核酸中的胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基，从固相洗脱洗涤过的脱氨基和脱磺酸核酸。经过亚硫酸氢盐转化后的dna需要纯化并从固相中洗脱得到纯净的样品，而当前技术从固相中回收核酸效率有限，同时在亚硫酸氢盐转化技术应用中，样本投入量一般较低。常规亚硫酸氢盐处理中的长反应时间导致大多数dna在转化过程中降解，回收过程中耗材的吸附，柱式有限的回收效率...
【技术保护点】
1.一种组合物，其包含亚硫酸氢盐和牡蛎糖原，所述组合物的pH为4-7。
2.权利要求1所述的组合物，所述亚硫酸氢盐是亚硫酸氢钠、亚硫酸氢铵、亚硫酸氢钾和亚硫酸氢镁中的一种或多种，优选亚硫酸氢铵，更优选1-8M亚硫酸氢铵。
3.权利要求1所述的组合物，所述牡蛎糖原的浓度是0.01-10mg/ml，优选0.01-5mg/ml。
4.权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含pH调节剂，所述pH调节剂是酸、碱、弱酸盐和弱碱盐中的一种或多种；优选地，所述pH调节剂包含NaOH。
5.权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含表面活性...
【技术特征摘要】
1.一种组合物，其包含亚硫酸氢盐和牡蛎糖原，所述组合物的ph为4-7。
2.权利要求1所述的组合物，所述亚硫酸氢盐是亚硫酸氢钠、亚硫酸氢铵、亚硫酸氢钾和亚硫酸氢镁中的一种或多种，优选亚硫酸氢铵，更优选1-8m亚硫酸氢铵。
3.权利要求1所述的组合物，所述牡蛎糖原的浓度是0.01-10mg/ml，优选0.01-5mg/ml。
4.权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含ph调节剂，所述ph调节剂是酸、碱、弱酸盐和弱碱盐中的一种或多种；优选地，所述ph调节剂包含naoh。
5.权利要求1所述的组合物，所述组合物还包含表面活性剂，优选非离子表面活性剂，更优选吐温20，更优选0.01％-10％(体积分数)吐温20。
6.一种亚硫酸氢盐转化dna的方法，所述方法包括：
7.权利要求6所述的方法，所述转化反应是在80-98℃孵育1-20min。
8.权利要求6所述的方法，所述固相载体是吸附柱，优选硅基质吸附柱，更优选硅胶吸附柱。
9.权利要求8所述的方法，所述使用固相载体吸附转化后的dna样本的步骤包括向吸附柱中加入转化后的dna样本和结合液，混匀，离心。
10.权利要求9所述的方法，所述结合液包括胍盐和缓冲成分；优选地，所述胍盐是盐酸胍、硫氰酸胍和异硫氰酸胍中的一种或多种，优选盐酸胍，更优选5-10m盐酸胍；优选地，所述缓冲成分包含磷酸盐缓冲液、mes缓冲液、hepes缓冲液和柠檬酸缓冲液中的任意一种或多种；优选地，所述缓冲成分是柠檬酸缓冲液，更优选10-200mm柠檬酸缓冲液。
11.权利要求6所述的方法，所述脱磺化处理包括加入脱磺化液，所述脱磺化液包括碱溶液；优选地，所述碱溶液是naoh、koh和ca(oh)2中的一种或多种，优选10-200mm naoh或koh。
【专利技术属性】
技术研发人员：陈梦婷，赵彬鑫，欧阳茜，聂俊伟，
申请(专利权)人：南京诺唯赞生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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