一种结构变异位点及其在辅助检测牦牛生长性状中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种结构变异位点及其在辅助检测牦牛生长性状中的应用。所述结构变异分子标记为牦牛4号染色体24135756‑24135950位EXOC4基因的结构变异；本发明专利技术以待测牦牛个体的全基因组DNA为模板，利用PCR扩增牦牛EXOC4基因的部分片段，通过电泳结果鉴定牦牛EXOC4基因上的结构变异位点的基因型。并将其与牦牛的生长性状关联分析，结果表明该结构变异位点与牦牛6月龄胸围显著相关。本发明专利技术所述SV位点可用于牦牛生长性状的分子辅助育种选择，为牦牛生长性状的定向选育提供了有效方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子标记，具体涉及一种结构变异位点及其在辅助检测牦牛生长性状中的应用。

技术介绍

1、牦牛(bos grunniens)作为青藏高原地区特有的牛种资源，是青藏高原牧民重要的生活和经济来源，也是当地畜牧业经济中不可缺少的重要畜种。gwas作为遗传定位的重要手段，在畜禽重要经济性状的遗传基础解析中发挥着重要的作用。近年来越来越多的研究表明基因组结构变异在畜禽表型变异中起着重要的作用。结构变异(structuralvariation，sv)一般指基因组中超过50bp的序列和位置变异，包括但不限于缺失、重复和更复杂的重排，如大串联重复、反转、反转录转座子插入和倒位。在畜禽育种中，通过筛选与生长性状密切相关变异位点，并与表型进行关联分析，可达到早期选种和提高育种值准确性的目的。但是，目前关于牦牛全基因组sv及其对生长性状的影响的研究十分有限。

2、exoc4是外泌体复合物一个组成部分，参与了外泌性囊泡与质膜融合位点的对接过程。exoc4能够调节组蛋白修饰蛋白atf2和rnf20，同时还能影响pak1和pak2的表达，进而影响细胞骨架动态变化本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.检测SV分子标记的试剂在检测牦牛6月龄胸围性状中的应用，其特征在于，所述SV分子标记位于牦牛基因组Bosgru_v3.0版本4号染色体24135756-24135950位，EnsemblID：ENSBGRG00000004701；所述SV分子标记存在三种基因型II、ID和DD；其中，以牦牛的基因组DNA为模板，通过PCR扩增SV分子标记，扩增出714bp一种条带，将基因型定义为纯合插入型II基因型；扩增出714bp和519bp两种条带，将基因型定义为杂合型ID基因型；扩增出519bp一种条带，将基因型定义为纯合缺失型DD基因型。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所...

【技术特征摘要】

1.检测sv分子标记的试剂在检测牦牛6月龄胸围性状中的应用，其特征在于，所述sv分子标记位于牦牛基因组bosgru_v3.0版本4号染色体24135756-24135950位，ensemblid：ensbgrg00000004701；所述sv分子标记存在三种基因型ii、id和dd；其中，以牦牛的基因组dna为模板，通过pcr扩增sv分子标记，扩增出714bp一种条带，将基因型定义为纯合插入型ii基因型；扩增出714bp和519bp两种条带，将基因型定义为杂合型id基因型；扩增出519bp一种条带，将基因型定义为纯合缺失型dd基因型。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述牦牛6月龄胸围性状中dd基因型优于ii和id基因型。

3.检测sv分子标记的试剂在牦牛6月龄胸围性状早期选育中的应用，其特征在于，所述sv分子标记位于牦牛基因组bosgru_v3.0版本4号染色体24135756-24135950位，ensemblid：ensbgrg00000004701；所述sv分子标记存在三种基因型ii、id和dd；...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴晓云，阎萍，褚敏，梁春年，郭宪，葛倩芸，马晓明，包鹏甲，喇永富，裴杰，熊琳，
申请(专利权)人：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，
类型：发明
国别省市：