【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因编辑领域,具体地,涉及一种cas蛋白及其变体、其相应的基因编辑系统及应用。
技术介绍
1、clustered regularly interspaced short palindromic repeats(crispr)系统是细菌和古细菌为了防御入侵噬菌体的dna而形成的。其中最常见的为crispr/cas9系统,cas9蛋白可在反式编码小rna(tracrrna)的协助下将pre-crrna加工成与tracrrna结合的成熟crrna。之后,人们发现通过人工构建模拟crrna-tracrrna复合体的单链嵌合体引导rna(guide rna,grna),即可有效的介导cas9蛋白对靶点的识别和切割。其中与靶点3′端紧邻的3个碱基必须是5′-ngg-3′的形式,从而构成cas/crrna复合体识别靶点所需的pam(protospacer adjacent motif)结构。
2、然而目前存在的不同的crispr/cas各有不同的优点和缺陷,例如,不同的cas蛋白大小、向导rna以及pam均存在差异。
...【技术保护点】
1.一种Cas蛋白,其特征在于,所述蛋白选自下组:
2.如权利要求1所述的Cas蛋白,其特征在于,所述Cas蛋白相对于SEQ ID NO:1所示氨基酸序列的多肽:
3.一种融合蛋白,其特征在于,包含权利要求1或2所述的Cas蛋白;以及一个或多个功能结构域。
4.一种分离的多核苷酸,其特征在于,所述的多核苷酸编码权利要求1-2任一项所述的Cas蛋白或权利要求3所述的融合蛋白;优选地,所述多核苷酸已进行密码子优化,以在真核细胞中表达。
5.一种向导RNA(gRNA),其特征在于,所述向导RNA包括能够结合权利要求1所述的Ca
...【技术特征摘要】
1.一种cas蛋白,其特征在于,所述蛋白选自下组:
2.如权利要求1所述的cas蛋白,其特征在于,所述cas蛋白相对于seq id no:1所示氨基酸序列的多肽:
3.一种融合蛋白,其特征在于,包含权利要求1或2所述的cas蛋白;以及一个或多个功能结构域。
4.一种分离的多核苷酸,其特征在于,所述的多核苷酸编码权利要求1-2任一项所述的cas蛋白或权利要求3所述的融合蛋白;优选地,所述多核苷酸已进行密码子优化,以在真核细胞中表达。
5.一种向导rna(grna),其特征在于,所述向导rna包括能够结合权利要求1所述的cas蛋白的同向重复(direct repeat,dr)序列和能够靶向靶序列的间隔(spacer)序列;优选地,所述同向重复(direct repeat,dr)序列包含seq id no.5、71中任一项所示的核苷酸序列,或与seq id no.5、71任一项所示的核苷酸序列具有至少约80%同源性的核苷酸序列;更优选地,所述dr序列包含靠近dr序列3’末端的茎环结构,所述茎环结构包含5’-x1x2x3x4x5nnnnnnnx6x7x8x9x10-3’;x1、x2、x3、x4、x5、x6、x7、x8、x9、x10是包含a、t、c或g的任何碱基,n是包含a、t、c或g的任何碱基;其中x1、x2、x3、x4、x5与x6、x7、x8、x9、x10可彼此杂交形成茎且使得nnnnnnn形成环;更优选地,其中所述dr序列包含如下所示的靠近dr序列3'末端的茎环结构:
6.一种分离的核酸分子,其特征在于,包含选自下列的序列,或由选自下列的序列组成:
7.一种复合物,其特征在于,包含:
8.一种载体,其特征在于,包含权利要求4所述的多核苷酸。
9.一种crispr-cas组合物,其特征在于,包含:
10.一种crispr-cas系统,其特征在于,包含一种或多种载体,所述一种或多种载体包含:
11.一种试剂盒,其特征在于,包括一种或多种选自下列的组分:权利要求1-2任一项所述的cas蛋白、权利要求3所述的融合蛋白、权利要求4所述的多核苷酸、权利要求7所述的复合物、权利要求8所述的载体、权利要求9所述的crispr-cas组合物或权利要求10所述的系统。
12.一种递送组合物,其特征在于,包含递送载体,以及选自下列的一种或多种:权利要求1-2任一项所述的cas蛋白、权利要求3所述的融合蛋白、权利要求4所述的多核苷酸、权利要求7所述的复合物、权利要求8所述的载体、权利要求9所述的crispr-cas组合物或权利要求10所述的系统。
13.一种宿主细胞,其特征在于,包含权利要求1-2任一项所述的cas蛋白、权利要求3所述的融合蛋白、权利要求4所述的多核苷酸、权利要求7所述的复合物、权利要求8所述的载体、权利要求9所述的crispr-cas组合物、权利要求10所述的系统或权利要求12所述的递送组合物。
14.一种酶制剂,其特征在于,所述酶制剂包括权利要求1-2任...
【专利技术属性】
技术研发人员:张红玲,
申请(专利权)人:尧唐上海生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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