【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学，尤其涉及一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法及脱卤微生物的分析方法。
技术介绍
1、有机卤化物（organohalides）是含有氟、氯、溴、碘等卤素的有机化合物，它们主要由工业和农业过程产生，比如农药、药物和个人护理品的生产等等，在自然界中广泛存在，具有毒性、顽固性和生物累积性。这些通过有机卤化物往往通过各种途径排放进入环境中造成污染，对于人体健康和生态系统造成长远的危害。环境中的微生物通常以群落的形式存在，通过与环境及其相互之间的作用关系，推动着全球的地球化学循环，显著地改变了生活环境，这些复杂的微生物可以参与有机卤化物的脱卤过程，实现这类物质的有效降解。微生物脱卤反应（microbial dehalogenation reactions）由裂解碳卤键的脱卤酶催化，是有机卤化物矿化和解毒的关键初始步骤。
2、脱卤酶的促脱卤反应具有相似的催化机制，通过亲核取代进行卤素置换。当前主要的脱卤反应有七类，分别是还原脱卤、氧化脱卤、水解脱卤、硫解脱卤、脱氢卤化、甲基转移脱卤和分子内取代反应，分别是在还...
【技术保护点】
1.一种脱卤微生物功能基因组数据库的构建方法，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，步骤（1）中，所述获取脱卤反应相关基因包括：
3.根据权利要求2所述的构建方法，其特征在于，所述脱卤反应相关基因包括：
4.根据权利要求1-3任一项所述的构建方法，其特征在于，步骤（2）中，所述核心数据库通过如下方法构建得到：
5.根据权利要求1-3任一项所述的构建方法，其特征在于，步骤（3）中，所述同源蛋白数据库包括：arCOG、KOG、COG、eggNOG、KEGG同源蛋白数据库中的一种或多种；
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