【技术实现步骤摘要】
本申请属于生物代谢领域,具体涉及一种生物体代谢通量的预测方法、存储介质。
技术介绍
1、随着技术的发展,生物研究越来越智能化,生物的代谢通量研究是生物代谢领域中的重点研究方向。生物的代谢通量分析可以揭示生物体内特定代谢途径的活性水平,揭示代谢调控的位点和机制,并深化我们对代谢物如何参与细胞决策的理解。
2、对生物代谢通量的计算方法,过去通常使用同位素标记的方式,对生物体进行的直接观察,进而计算出生物活动中某个代谢网络的代谢通量,但是这种方式精度低、耗时长、效率低下,参考意义过小。针对这个问题,本领域技术人员引入计算机技术,通过数学模型与通量计算:通过构建基于代谢网络的微分方程模型,描述同位素标记的时空变化。通过优化算法(如最小二乘法)拟合实验数据,反推代谢通量分布。
3、但是,由于实验具有较高的复杂性,非稳态实验需精确控制标记时间点,操作难度高并且同位素标记数据的检测(如质谱)成本昂贵且耗时不稳定。其次,计算存在瓶颈,动态模型的求解涉及复杂的微分方程和优化问题,计算资源需求大,且现有工具对生物分析的支持有限。
...【技术保护点】
1.一种生物体代谢通量的预测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在对所述代谢网络进行数据模拟生成,获取模拟数据之前,所述方法还包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述代谢网络包括至少一个代谢反应;对所述代谢网络进行数据模拟生成,获取模拟数据,包括:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,根据各初始采样通量值,模拟所述代谢网络中同位素分布,得到所述模拟数据,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,将所述模拟数据输入至预测网络模型,包括:
6.根据权利要
...【技术特征摘要】
1.一种生物体代谢通量的预测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在对所述代谢网络进行数据模拟生成,获取模拟数据之前,所述方法还包括:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述代谢网络包括至少一个代谢反应;对所述代谢网络进行数据模拟生成,获取模拟数据,包括:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,根据各初始采样通量值,模拟所述代谢网络中同位素分布,得到所述模拟数据,包括:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,将所述模拟数据输入至预测网络模型,包括:
6.根据权利要求1所述方法,其特征在于,对所述网络模型进行训练的方法,包括:
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