一种核酸适体结构计算方法、系统、设备及介质技术方案

本发明专利技术涉及核酸适体鉴定及优化技术领域，公开一种核酸适体结构计算方法、系统、设备及介质，本发明专利技术通过结合高通量测序、深度学习模型、二级结构预测和聚类分析实现核酸适体的高效筛选和精准优化，具体的，本发明专利技术利用高通量测序技术快速获取单轮筛选的大量核酸适体序列，并通过深度学习模型进行高效筛选和特征提取；进一步通过聚类分析将序列分为不同家族，保留序列多样性并识别出核心序列；利用MXfold2模型预测二级结构并结合折叠分数评估结构稳定性，最终通过递归算法优化核酸适体的设计。本发明专利技术不仅显著提高筛选效率，还通过数据驱动的方法优化核酸适体的亲和力和稳定性，为核酸适体的研究和应用提供更高效、更精准的解决方案。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及核酸适体鉴定及优化，尤其涉及一种核酸适体结构计算方法、系统、设备及介质。

技术介绍

1、核酸适体（aptamer）是一类能够通过形成特定三维结构与靶标分子特异性结合的单链寡核苷酸（dna或rna）。它们一般通过体外筛选技术（如selex）从大量随机序列中获得，具有高度的特异性和亲和力，类似于抗体，具有免疫原性低、稳定性高、易于合成等优点。

2、现有的核酸适体研究方法主要包括selex技术、高通量测序技术、机器学习和虚拟筛选方法，但是selex筛选的适体突变主要来自初始核酸库，序列突变概率低，难以产生真正“进化”的新适体，以及初始文库序列多样性有限，可能导致高亲和力序列缺失，影响筛选成功率，高通量测序技术虽能快速获得大量核酸序列，但难以从繁杂信息中高效提取适体序列规律，为后续优化提供有用信息，现有的机器学习和虚拟筛选方法主要从经过多轮筛选的富集文库中的全长适体角度预测结合特异性，忽略了筛选的效率、关键的二级结构，以及未考虑适体局部构象差异性，难以精准识别核心区域及有效结构。

3、因此，亟需一种新的高效核酸适体结构计算方法本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种核酸适体结构计算方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S2包括：

3.根据权利要求2所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S21包括：

4.根据权利要求3所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S3包括：

5.根据权利要求4所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S33包括：

6.根据权利要求1-5任一项所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S5包括：

7.根据权利要求1-5任一项所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，S7包括：

<p>8.一种核酸适体...

【技术特征摘要】

1.一种核酸适体结构计算方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，s2包括：

3.根据权利要求2所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，s21包括：

4.根据权利要求3所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，s3包括：

5.根据权利要求4所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，s33包括：

6.根据权利要求1-5任一项所述的核酸适体结构计算方法，其特征在于，s5包括：

7.根据权...

【专利技术属性】
技术研发人员：邴涛，於晶晶，林恒伊，隆振豪，谭蔚泓，
申请(专利权)人：中国科学院杭州医学研究所，
类型：发明
国别省市：