【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及肠道微生物领域，具体而言，涉及一种对肠道病毒组进行定量的方法和装置。
技术介绍
1、病毒群落是人体肠道微生物的重要组成部分。据估计，每克粪便中约含有109-10个病毒颗粒，研究人员把肠道中所有病毒的集合称为肠道病毒组。肠道病毒组种类丰富，在个体间具有高度异质性的特点。随着宏基因组测序技术的快速发展，研究人员能够不依赖分离培养，直接检测群落中所有微生物的核酸信息。基于宏基因组测序技术以及针对肠道细菌的生物信息工具开发，极大的提高了人们对肠道细菌等微生物的了解，然而由于缺乏肠道病毒组分析工具，目前对于肠道病毒组的了解十分有限。
2、已有研究表明，肠道病毒组的变化特征与炎症性肠病、糖尿病、高血压、结肠癌等多种疾病有关。肠道病毒组具有调控肠道菌群从而影响人体健康的巨大潜力。因此，开发肠道病毒组的相关工具，不断提升人们对肠道病毒组的认识，对全面解析疾病发生发展机制具有重要意义。
3、在人肠道病毒组研究中，需要根据不同个体肠道中的病毒种类和相对丰度差异，来刻画个体的肠道病毒组特征。而基于肠道菌群宏基因组测序数据...
【技术保护点】
1.一种对肠道病毒组进行定量的方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，构建病毒簇特异的标记蛋白数据库包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，构建肠道的病毒簇包括：
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，构建肠道病毒基因组的蛋白簇包括：
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，筛选所述病毒簇的标记蛋白，利用所述标记蛋白构建所述病毒簇特异的标记蛋白数据库包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，为所述候选标记蛋白簇选择代表蛋白序列，并对所述代表蛋白序列进...
【技术特征摘要】
1.一种对肠道病毒组进行定量的方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，构建病毒簇特异的标记蛋白数据库包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，构建肠道的病毒簇包括：
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，构建肠道病毒基因组的蛋白簇包括：
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，筛选所述病毒簇的标记蛋白，利用所述标记蛋白构建所述病毒簇特异的标记蛋白数据库包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，为所述候选标记蛋白簇选择代表蛋白序列，并对所述代表蛋白序列进行同源性质控和标记蛋白数量确定包括：
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法，其特征在于，将肠道宏基因组测序数据与所述标记蛋白数据库进行比对，实现对所述肠道病毒组的定量包括：
8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，对于每个所述病毒簇的标记蛋白，去掉覆盖深度排序最高和最低的各预定数量的所述标记蛋白，以中间剩余数量的所述标记蛋白的覆盖深度的均值作为所述病毒簇的读...
【专利技术属性】
技术研发人员：李俊桦，杨芳明，
申请(专利权)人：深圳华大生命科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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