一种草鱼SNP液相育种芯片及其应用制造技术

本发明专利技术属于分子检测技术领域，具体公开了一种草鱼SNP液相育种芯片及其应用。本发明专利技术提供了一种草鱼SNP液相育种芯片，该芯片的基因分型对象包括草鱼全基因组上的21546个SNP位点，该芯片位点多态性高、功能位点和基因区域位点丰富、包含多种检测标记，位点在染色体上均匀分布，是一套精准高效的分子育种芯片。该芯片可广泛用于草鱼种质资源鉴定和遗传多样性评估、遗传图谱构建及QTL定位、全基因组关联分析、重要性状基因的挖掘鉴定和功能解析、全基因组选择育种等不同应用场景，有利于提高草鱼育种效率，培育具有生长速度快等优良性状的新品种，推动草鱼养殖业健康可持续发展。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子检测，具体涉及一种草鱼snp液相育种芯片及其应用。

技术介绍

1、目前，草鱼水产养殖的可持续发展面临许多挑战，如种质退化和各种传染性疾病的爆发，这给我国乃至全世界的水产渔业发展带来的经济损失不可估计。因此，加快草鱼向优质方向培育对我国草鱼产业发展十分重要，分子育种标记是推进该目标的手段之一。

2、snp芯片是一种高通量基因分型技术，用于检测基因组中单核苷酸多态性(snp)位点的变异，是分子育种的重要技术手段之一。snp是指基因组dna序列中由于单个核苷酸的突变(如转换、颠换、插入或缺失)引起的多态性。这种技术通过将大量特异性探针固定与目标dna进行杂交反应，从而快速、准确地检测多个snp位点。

3、全基因组snp分型是解析全基因组范围内基因遗传变异与性状关联分析的核心技术手段。中低密度、中高密度snp/indel基因型分型技术，基于多重pcr精准定位测序分型技术(genotyping by pinpoint sequencing of multiplex pcr products，简称mgps)或基于目标区域基因组本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种草鱼SNP分子标记组合，其特征在于，包括草鱼全基因组上的21546个SNP位点，所述SNP位点的信息如说明书表1所示。

2.一种草鱼SNP液相育种芯片，其特征在于，该芯片的基因分型对象为权利要求1所述的草鱼SNP分子标记组合。

3.权利要求2所述的草鱼SNP液相育种芯片在草鱼种质资源鉴定和遗传多样性评估、遗传图谱构建及QTL定位、全基因组关联分析、重要性状基因的挖掘鉴定和功能解析、全基因组选择育种中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：应用方法为利用所述草鱼SNP液相育种芯片对草鱼样品进行基因分型。

【技术特征摘要】

1.一种草鱼snp分子标记组合，其特征在于，包括草鱼全基因组上的21546个snp位点，所述snp位点的信息如说明书表1所示。

2.一种草鱼snp液相育种芯片，其特征在于，该芯片的基因分型对象为权利要求1所述的草鱼snp分子标记组合。

3.权利要求2所述的草...

【专利技术属性】
技术研发人员：李家乐，徐晓雁，沈玉帮，李惟中，陈语轩，刘宇婷，曹明月，雷雨婷，从乾，吕汶姚，盛滔，俞巧珍，周一飞，何柔梦，孟新展，
申请(专利权)人：上海海洋大学，
类型：发明
国别省市：