用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法技术

本发明专利技术公开了用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，属于生物工程技术领域，包括以下步骤：步骤一：获取IBD全基因组关联研究汇总数据；步骤二：利用孟德尔随机化方法分析IBD与口腔癌之间的因果关系，确定IBD相关基因；步骤三：收集口腔癌组织样本，并进行单细胞RNA测序；本发明专利技术中，通过对口腔癌标本进行单细胞RNA测序，描绘细胞簇和基因表达模式。使用t‑SNE和UMAP显示细胞簇和类型，使用点阵图定义基因表达的关键模式，通过GSEA分析与NFKBIA表达相关的通路。其实验结果阐明口腔癌疾病进展过程中的细胞异质性和基因表达动力学，并揭示与IBD相关的可能的治疗靶点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物工程，具体为用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法。

技术介绍

1、炎症性肠病(ibd)是一种胃肠道慢性炎症状态，以克罗恩病和溃疡性结肠炎两种不同的疾病为特征。它会导致包括口腔癌在内的不同类型癌症的高风险。现如今，炎症性肠病(ibd)和癌症研究的交叉已经引起了极大的关注，特别是通过孟德尔随机化(mr)研究。mr通过利用遗传变异作为工具变量，为探索因果关系提供了强大的框架。

2、但现有技术中，ibd与口腔癌之间的因果关系尚不明确，缺乏有效的诊断和预测生物标志物。为此，提出了用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法。

3、本
技术介绍
所公开的上述信息仅仅用于增加对本专利技术
技术介绍
的理解，因此，其可能包括不构成本领域普通技术人员已知的现有技术。

技术实现思路

1、本专利技术旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的在于提出用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法。

2、为实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于：在步骤二中，孟德尔随机化方法包括：选择与IBD相关的遗传变异作为工具变量，利用工具变量估计IBD与口腔癌之间的因果效应。

3.根据权利要求1所述的用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于：在步骤三中，单细胞RNA测序的具体步骤：

4.根据权利要求1所述的用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于：在步骤六中，功能富集分析的具体步骤：

【技术特征摘要】

1.用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的用于分析鉴定炎症性肠病相关口腔癌生物标志物的方法，其特征在于：在步骤二中，孟德尔随机化方法包括：选择与ibd相关的遗传变异作为工具变量，利用工具变量估计ibd与口腔癌之间...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾汉石，杨敏，郭予雄，
申请(专利权)人：广东省人民医院，
类型：发明
国别省市：