调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法、系统和存储介质技术方案

本发明专利技术涉及调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法、系统和存储介质，涉及生物信息学技术领域，包括如下步骤：(1)样本的处理和转录组原始数据的获得；(2)差异分析；(3)时序分析；(4)富集分析；(5)加权基因共表达网络分析；(6)机器学习；本发明专利技术利用RNA二代测序结果对棕色脂肪细胞下游代谢‑促进因子进行鉴定，通过差异分析、富集分析、时序分析，得到转录组的总体特征，使用加权基因共表达网络分析、机器学习对数据进一步缩减，筛选出关键调控基因；本发明专利技术有助于寻找能促进棕色脂肪细胞代谢的关键调控分子，为治疗肥胖提供生物学上的新靶点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息学，具体涉及调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法、系统和存储介质。

技术介绍

1、棕色脂肪细胞是新兴的代谢疾病治疗靶点，经基因编辑的棕色脂肪细胞移植给肥胖小鼠后能显著改善其肥胖及代谢表型。运动能够通过多种机制影响棕色脂肪的激活和功能，包括提升线粒体活性、增加脂肪酸氧化、调节热量消耗等。尽管如此，运动调节棕色脂肪的具体分子机制，尤其是涉及的下游因子和信号通路，仍然未被完全揭示。近年来，随着高通量rna二代测序技术的发展，基于转录组的分析成为了研究棕色脂肪生物学过程的有力工具。rna测序可以系统性地识别在特定刺激(如运动)下表达变化的基因，为揭示运动对棕色脂肪的调控提供了丰富的信息。然而，如何从复杂的基因表达数据中筛选出与运动相关的下游因子，并进一步验证其在棕色脂肪功能中的作用，仍然是一个挑战。因此，亟需一种高效、精确的方法来鉴定与运动相关的棕色脂肪下游因子，推动棕色脂肪作为治疗肥胖及代谢疾病的潜力发挥。

技术实现思路

1、本专利技术所要解决的技术问题是提供调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，步骤(1)中，所述实验组包括ISO组、NS组和ISO-NS联合组；

3.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，步骤(2)中差异分析采用DESeq2或edgeR软件进行分析；设定FDR阈值低于0.05，fold change≥1.5。

4.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，所述时序分析采用Masigpro包，采用两步回归方法进行时序分析。...

【技术特征摘要】

1.调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，步骤(1)中，所述实验组包括iso组、ns组和iso-ns联合组；

3.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，步骤(2)中差异分析采用deseq2或edger软件进行分析；设定fdr阈值低于0.05，fold change≥1.5。

4.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，所述时序分析采用masigpro包，采用两步回归方法进行时序分析。

5.根据权利要求4所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，所述时序分析包括如下的具体步骤：

6.根据权利要求1所述调控棕色脂肪代谢的下游运动因子鉴定方法，其特征在于，步骤(4)中，所述gsea富集分析包括如下具体的步骤：构建包含差异表达基因及其显著性统计值的输入框架，采用...

【专利技术属性】
技术研发人员：龚丽景，许春艳，肖靖喆，周妮红，
申请(专利权)人：北京体育大学，
类型：发明
国别省市：