一种同时检测蛋白质磷酸化和S-亚硝基化的方法技术

技术编号:45435121 阅读:19 留言:0更新日期:2025-06-04 19:15
本发明专利技术公开了一种同时检测蛋白质磷酸化和S‑亚硝基化的方法,利用磷酸亲和标签标记S‑亚硝基化的蛋白质,将S‑亚硝基化修饰转化为磷酸化模拟型标签,从而能够使用常规的磷酸化蛋白质组学技术同时富集并分析S‑亚硝基化和磷酸化这两种修饰,且通过对模型蛋白和复杂生物样品的测试,我们验证了该方法灵敏度高、重复性好,具有广泛的蛋白质覆盖范围,与传统单独富集方法相当,克服了分析不同化学性质修饰的技术挑战,为综合研究 PTM 交叉对话提供了可靠的工具。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及蛋白质组学方法,具体涉及一种同时检测蛋白质磷酸化和s-亚硝基化的方法。


技术介绍

1、翻译后修饰(ptms)是蛋白质功能和活性的动态调节器。在已知的400多种翻译后修饰(ptms)中,可逆磷酸化因在真核生物信号转导、蛋白互作、酶活性调节及亚细胞定位中发挥核心作用,成为研究最为深入的ptm类型。与此同时,蛋白质 s-亚硝基化(一种通过氧化还原反应将一氧化氮(no)分子连接到蛋白质的半胱氨酸残基上的修饰方式)也因其类似于磷酸化的调控功能而备受关注。最近的研究揭示了s-亚硝基化广泛参与植物生长发育调控及逆境胁迫应答的分子机制。

2、蛋白质通常会在多个位点发生不同类型的修饰,不同的翻译后修饰(ptms)之间的相互作用为蛋白质组增添了额外的调控层次,也使其变得更加复杂。越来越多的研究表明,磷酸化和s-亚硝基化之间存在复杂的串扰。例如,在拟南芥中,水杨酸结合蛋白sabp3的磷酸化需要先进行s-亚硝基化,而在bik1蛋白中,磷酸化则发生在s-亚硝基化之前,共同调控免疫信号。这种相互作用不仅限于单本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种同时检测蛋白质磷酸化和S-亚硝基化的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)所述磷酸亲和标签为碘乙酰胺基-LC-膦酸,其结构为:。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)蛋白质标记前用碘乙酰胺封闭游离硫醇,再用抗坏血酸钠还原S-亚硝基化修饰,标记后蛋白质酶解前还包括对二硫键的还原处理和烷基化处理,所用试剂包括三(2-羧乙基)膦/2-氯乙酰胺。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,具体步骤如下:蛋白质标记前用碘乙酰胺封闭游离硫醇,接着通过沉淀蛋白去除杂质,再用抗坏血酸钠还原S-亚...

【技术特征摘要】

1.一种同时检测蛋白质磷酸化和s-亚硝基化的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)所述磷酸亲和标签为碘乙酰胺基-lc-膦酸,其结构为:。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)蛋白质标记前用碘乙酰胺封闭游离硫醇,再用抗坏血酸钠还原s-亚硝基化修饰,标记后蛋白质酶解前还包括对二硫键的还原处理和烷基化处理,所用试剂包括三(2-羧乙基)膦/2-氯乙酰胺。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,具体步骤如下:蛋白质标记前用碘乙酰胺封闭游离硫醇,接着通过沉淀蛋白去除杂质,再用抗坏血酸钠还原s-亚硝基化修饰,并用6c-cyspat实现标记,随后用丙酮沉淀蛋白以去除多余的6c-cyspat试剂;复溶蛋白后用三(2-羧乙基)膦/2-氯乙酰胺还原并封闭二硫键,最后蛋白质被胰蛋白酶酶解成肽段,得到磷酸化肽、pat标记肽和未修饰肽的混合物;磷酸化肽和pat标记肽通过金属氧化物/固定化金属离子亲和层析技术同时富集;富集的肽段通过液相色谱-串联质谱进行分析。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,蛋白质标记前用碘乙酰胺封闭游离硫醇,接着通过沉淀蛋白去除杂质,具体步骤如下:蛋白重悬于hens缓冲液中,加入碘乙酰胺至终浓度 100 mm,随后在 37°c 下振荡孵育 1 小时,将混合物涡旋,加入丙酮沉淀蛋白,或使用酚抽提蛋白后加入甲醇沉淀蛋白,离心后,蛋白质沉淀洗涤并在空气中干燥。

6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,用抗坏血酸钠还原s-亚硝基化修饰,并用6c-cyspat标记,用丙酮沉淀去除多余的6c-cyspat试剂,具体步骤如下:将蛋白质沉淀重悬于含有抗坏血酸钠和6c-cyspat的hens缓冲液中,37°c下轻轻滚动孵育1小时,然后进行快速蛋白质沉淀,离心后,蛋白质沉淀用含10 mm nacl的80vol%丙酮洗涤两次,并在空气中干燥5分钟得到s-亚硝基化修饰被pat-switch的蛋白质。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,快速进行蛋白质沉淀的方法如下:将37°c下轻轻滚动孵育1小时的混合液与1/10体积的1m nacl混匀,并在室温下用5倍体积丙酮共孵育30分钟。

8.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,用tcep/caa还原并封闭二硫键,最后蛋白质被胰蛋白酶酶解成肽段,得到磷酸化肽、pat标记肽和未修饰...

【专利技术属性】
技术研发人员:张文洋晏石娟王炎姣李文燕黄文洁叶明洋谭国督
申请(专利权)人:广东省农业科学院农业生物基因研究中心
类型:发明
国别省市:

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