一种鉴定水稻芽期耐冷性的InDel4分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种鉴定水稻芽期耐冷性的InDel4分子标记及其应用，涉及基因工程领域，InDel4分子标记位于如SEQ ID No.1所示的水稻基因CTS4编码区；InDel4分子标记包括三个点位，分别为位于序列SEQ ID No.1第283‑331位的第一点位；位于序列SEQ ID No.1第389‑391位的第二点位；位于序列SEQ IDNo.1第482‑484位的第三点位。采用本发明专利技术提供的引物对芽期耐冷性不同的水稻进行鉴定，结果显示芽期耐冷性强的水稻材料和芽期耐冷性弱的水稻材料具有特异性区别，芽期耐冷性强的水稻材料较于芽期耐冷性弱的水稻材料条带更大；本发明专利技术设计的引物能有效将水稻的特异性基因片段扩增出来，并经过琼脂糖凝胶电泳加以区分。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因工程领域，具体涉及一种鉴定水稻芽期耐冷性的indel4分子标记及其应用。

技术介绍

1、水稻(oryza sativa l.)起源于热带、亚热带地区，对低温非常敏感，低温灾害会严重影响水稻的产量和品质。随着水稻直播技术的推广和应用，芽期低温冷害已经成为制约水稻生产的重要非生物胁迫之一。芽期耐冷性强的水稻材料可以抵御低温胁迫，对于减少水稻冷害损失、推广水稻直播种植具有重要意义。因此，在品种选育过程对水稻芽期耐冷性状的预判显得十分重要。

2、目前，科研人员要判断一个新的水稻品种或者育种材料的芽期耐冷性往往是通过漫长而复杂的低温培养实验，在合适的低温条件下鉴定耐冷性状；整个过程至少需2-3周时间，且需要专业的技术人员进行耐冷表型鉴定。因此，在育种实践中，有必要寻找快速鉴定水稻芽期耐冷性的方法。

技术实现思路

1、针对现有技术的上述不足，本专利技术提供了一种鉴定水稻芽期耐冷性的indel4分子标记及其应用。该分子标记可对芽期耐冷性不同的水稻材料进行鉴定，在实际应用中，只需pcr结合电泳实本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种水稻的InDel4分子标记，其特征在于，所述InDel4分子标记位于如SEQ ID No.1所示的水稻基因CTS4编码区；InDel4分子标记包括三个点位，分别为位于序列SEQ ID No.1第283-331位的第一点位；位于序列SEQ ID No.1第389-391位的第二点位；位于序列SEQ IDNo.1第482-484位的第三点位。

2.一种用于扩增权利要求1所述的InDel4分子标记的引物对，其特征在于，包括如SEQID No.2所示的正向引物：5'-CCTGAGTCACAAGCACGAAA-3'；如SEQ ID No.3所示的反向引物：5'-AACCGGTT...

【技术特征摘要】

1.一种水稻的indel4分子标记，其特征在于，所述indel4分子标记位于如seq id no.1所示的水稻基因cts4编码区；indel4分子标记包括三个点位，分别为位于序列seq id no.1第283-331位的第一点位；位于序列seq id no.1第389-391位的第二点位；位于序列seq idno.1第482-484位的第三点位。

2.一种用于扩增权利要求1所述的indel4分子标记的引物对，其特征在于，包括如seqid no.2所示的正向引物：5'-cctgagtcacaagcacgaaa-3'；如seq id no.3所示的反向引物：5'-aaccggttgcacaggtagtc-3'。

3.一种采用权利要求1所述的indel分子标记或权利要求2所述的引物对在检测水稻芽期耐冷能力中的应用。

4.一种用于检测水稻芽期耐冷能力的试剂盒...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘凤霞，段俊骅，孙红荧，谭禄宾，朱作峰，孙传清，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：