目标分子的衍生分子及其生成方法、系统及计算机产品技术方案

技术编号:44988622 阅读:15 留言:0更新日期:2025-04-15 17:05
本申请提供了目标分子的衍生分子及其生成方法、系统及计算机产品,涉及深度学习和分子生成技术领域。该方法包括:S1,获取目标分子的表达范式;S2,将所述目标分子的表达范式输入至经过训练的分子生成模型中,生成所述目标分子的衍生分子;其中,所述目标分子选自铁载体。基于前述方法能够生成复杂且高质量的铁载体分子结构,显著提高了新型铁载体分子的发现效率,缩短了研究周期,并降低了实验成本,为生物活性分子的设计和开发提供了高效且经济的新技术途径。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及深度学习和分子生成,具体地,涉及目标分子的衍生分子及其生成方法、系统及计算机产品


技术介绍

1、铁载体分子(siderophores)是一类由微生物产生的小分子有机化合物,对铁离子具有极高的亲和力,能够从环境中螯合出铁离子并将其运输到细胞内。作为一种特殊的天然产物,铁载体不仅在微生物中铁的获取和运输中发挥关键作用,还表现出显著的抗菌活性,为开发新型抗生素和药物提供了新的途径。

2、然而,目前已知的铁载体种类仍然较少,分子结构也呈现出多样且复杂的特点,这极大地限制了对铁载体功能和应用潜力的研究。因此,挖掘和探索潜在的新铁载体,对于扩展铁载体的应用范围、以及开发新型药物方面都具有重要意义。潜在铁载体的发现主要依赖于实验室中的生物化学实验,这种方法不仅耗时耗力,而且成本高昂,且高度依赖于专家的专业知识和直觉,由于化学空间离散且广阔,全面搜索所有可能的分子结构变得不切实际。此外,目前也未见有基于深度学习的铁载体分子发现方法。


技术实现思路

1、为了至少解决现有问题的至少之一。本申请提出了一种铁本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种目标分子的衍生分子生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述分子生成模型是通过如下方式训练获得的:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述编码器选自Transformer,所述解码器选自Matrix LSTM。

4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述训练进一步包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述预处理包括:

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述S2步骤包括:

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述递归生成的字符满足下列任...

【技术特征摘要】

1.一种目标分子的衍生分子生成方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述分子生成模型是通过如下方式训练获得的:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述编码器选自transformer,所述解码器选自matrix lstm。

4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述训练进一步包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述预处理包括:

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述s2步骤包括:

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述递归生成的字符满足下列任一条件,作为目标分子的衍生分子标准表达范式:

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,包括:对所述目标分子的衍生分子标准表达范式进行分子结构生成。

9....

【专利技术属性】
技术研发人员:黄勇王宝勖
申请(专利权)人:合肥综合性国家科学中心大健康研究院
类型:发明
国别省市:

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