【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及基因测序分析，特别是涉及一种基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法。
技术介绍
1、随着全球化进程的加速，世界各国的人员和物资流动频繁，许多新出现和未确证的病原体引发的疾病负担不断加重，给人类健康带来了前所未有的挑战。例如：sars、禽流感、甲型h1n1流感、h7n9流感、埃博拉病毒以及猴痘等一系列疾病，均表现出迅速传播的潜力和严重后果。这些疾病不仅对公共卫生构成威胁，还可能导致经济损失和社会恐慌，促使各国公共卫生系统不断加强病原体的监测、快速识别和响应能力。面对传染病的威胁，快速准确的病原体检测显得尤为重要，能够为有效的防控措施提供重要依据。
2、当前，传统的病原微生物鉴定技术主要包括形态学观察、细胞生理生化特征、细菌培养分型、基因芯片和自动化微生物分析系统等。这些方法通常依赖于微生物的培养，周期较长，且对培养条件极为敏感，容易出现假阴性或假阳性结果。此外，基于特异引物、探针或抗体的检测方法(如抗原抗体反应和pcr检测)在进行微生物识别时，依赖于已知微生物的序列先验知识，这使得它们在应对未知或突变的...
【技术保护点】
1.一种基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，其包括微生物数据库构建与更新模块、微生物信息标准化标注模块、纳米孔测序分析模块、测序数据质控模块、宿主测序读段去除模块、微生物数据库比对注释模块、同属测序读段组装模块和微生物数据库比对计算模块；
2.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，第一计算比对条件：相似度＞第一相似阈值，且覆盖度＞第一覆盖阈值；
3.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，所述系统还包括微生物丰度统计模块，所述微生物丰度统计模块用于统计物种...
【技术特征摘要】
1.一种基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，其包括微生物数据库构建与更新模块、微生物信息标准化标注模块、纳米孔测序分析模块、测序数据质控模块、宿主测序读段去除模块、微生物数据库比对注释模块、同属测序读段组装模块和微生物数据库比对计算模块；
2.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，第一计算比对条件：相似度＞第一相似阈值，且覆盖度＞第一覆盖阈值；
3.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，所述系统还包括微生物丰度统计模块，所述微生物丰度统计模块用于统计物种一致下各物种的代表性测序读段的数量，计算物种一致下某一物种的微生物丰度＝该物种对应的代表性测序读段的数量/物种一致下各物种的代表性测序读段的数量累加和。
4.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，所述测序数据质控模块用于对该待分析测序序列文件中保留下的测序读段进行质量检查，以确认接头污染、低质量读段和长度短读段均已被有效去除。
5.如权利要求1所述的基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统，其特征在于，所述微生物数据库构建与更新模块用于在检测到公共数据库进行了更新后，利用更新后的公...
【专利技术属性】
技术研发人员：曹广文，谭晓㛃，丁一波，蒲蕊，任翔宇，施艺玮，刘文斌，
申请(专利权)人：中国人民解放军海军军医大学，
类型：发明
国别省市：
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