【技术实现步骤摘要】
本公开涉及细胞通讯，具体涉及一种细胞互作分析方法及装置、电子设备及存储介质。
技术介绍
1、目前，细胞通讯是指细胞与周围环境或系统中的其他细胞相互协调发挥作用的过程。相关技术中细胞互作分析方法包括如下两类：第一类，是由单细胞分析迁移应用到空间转录组数据的方法，如cellphonedb(cellphonedb是一种细胞通讯分析工具)、cellchat(cellchat是一个能够从单细胞rna测序数据中分析细胞间通讯网络的r包)。第二类，是针对空间转录组数据设计的方法，如stlearn(stlearn是一种可以在空间中重建组织内的细胞类型演变，并识别具有细胞间相关作用的区域的方法)。其中，第一类方法对空间转录组数据中的位置信息没有很好的利用，第二类方法利用了空间转录组数据中的位置信息，但缺少在空间转录组上进行单细胞层面的细胞互作分析。因此，目前缺乏一种能够利用空间转录组数据进行单细胞互作分析的方法。
技术实现思路
1、本申请实施例的主要目的在于提出一种细胞互作分析方法及装置、电子设备及存储介质...
【技术保护点】
1.一种细胞互作分析方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求了1所述的方法，其特征在于，所述计算不同细胞类群之间的临近值，并基于所述临近值在多个所述细胞类群中确定目标细胞类群对，包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据每个细胞类群中每个细胞与对应的近邻细胞的数量计算不同细胞类群之间的临近值，包括：
4.根据权利要求了2所述的方法，其特征在于，所述根据所述位置信息计算每个细胞类群中每个细胞的近邻细胞，包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述目标细胞类群对中不同配受体对的基因...
【技术特征摘要】
1.一种细胞互作分析方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求了1所述的方法，其特征在于，所述计算不同细胞类群之间的临近值，并基于所述临近值在多个所述细胞类群中确定目标细胞类群对，包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据每个细胞类群中每个细胞与对应的近邻细胞的数量计算不同细胞类群之间的临近值，包括：
4.根据权利要求了2所述的方法，其特征在于，所述根据所述位置信息计算每个细胞类群中每个细胞的近邻细胞，包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述目标细胞类群对中不同配受体对的基因表达量，在所述目标细胞类群中确定目标配受体对，包括：
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述目标配受体对包括目标配体基因和目标受体基因，所述目标细胞类群包括信号发送类群和信号接收类群；
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述根据所述目标配体基因在所述信号发送类群的所基因表达量、所述目标受体基因在所述信号接收类群的基因表达量计算得到真实表达均值，包括：
8.根据权利要求1所...
【专利技术属性】
技术研发人员：白寅琪，吴鑫超，张哲玮，荆泽华，
申请(专利权)人：杭州华大生命科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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