一种基于qPCR鉴定苹果边腐病菌的引物组、组合物、试剂盒及方法技术

本发明专利技术属于病菌检测技术领域，尤其涉及一种基于qPCR鉴定苹果边腐病菌的引物组、组合物、试剂盒及方法，包括构建基于ITS‑LSU‑TEF‑TUB序列的多基因系统发育树、苹果边腐病菌样品及引物探针设计、标准曲线的构建、苹果边腐病菌PCR扩增检测和反应结束后根据扩增曲线判定结果步骤。本发明专利技术中检测方法具有良好的可重复性和稳定性，相比较其他检测技术，荧光定量PCR具有检测时间短，检测灵敏度更高、特异性更强、所需模板微量、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于病菌检测，尤其涉及一种鉴定苹果边腐病菌的pcr扩增引物组、组合物、试剂盒及方法。

技术介绍

1、目前，世界各国苹果产业已成为一个重要的产业，但病害的发生严重制约了其发展。苹果边腐病菌是一种重要的植物病原真菌，被世界各国列为检疫对象。

2、苹果边腐病菌(cadophora malorum)的分类地位：fungi，ascomycota，pezizomycotina，leotiomycetes，helotiales，cadophora，苹果边腐病菌病原为苹果背芽突霉(cadophora malorum，异名phialophora malorum、sporotrichum malorum)，主分布于美国、英国、荷兰和意大利等国家。苹果边腐病菌引起的苹果边腐病会造成储藏期苹果和梨大量果实腐烂，使其产量遭受巨大损失。该病菌是一种土传真菌，不仅能在表层土壤中存活越冬，还能在树皮上越冬，其传播主要是依靠人类活动。

3、传统方法鉴定该病原菌比较困难，而荧光定量pcr方法具有快速、灵敏、特异、准确等特点，因此利用荧光定量pcr方法检测苹果本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一组鉴定苹果边腐病菌的PCR扩增引物组，其特征在于，其正向引物PHMA-F核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，反向引物PHMA-R核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。

2.一种鉴定苹果边腐病菌的组合物，其特征在于：包括检测用的引物探针，所述引物探针由权利要求1所述的引物组及特异探针组成，引物组正向引物序列如SEQ ID No.1所示，反向引物序列如SEQ ID No.2所示。

3.根据权利要求2所述的一种鉴定苹果边腐病菌的组合物，其特征在于：探针PHMA-FAM核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。

4.权利要求1所述的PCR引物组，在制...

【技术特征摘要】

1.一组鉴定苹果边腐病菌的pcr扩增引物组，其特征在于，其正向引物phma-f核苷酸序列如seq id no.1所示，反向引物phma-r核苷酸序列如seq id no.2所示。

2.一种鉴定苹果边腐病菌的组合物，其特征在于：包括检测用的引物探针，所述引物探针由权利要求1所述的引物组及特异探针组成，引物组正向引物序列如seq id no.1所示，反向引物序列如seq id no.2所示。

3.根据权利要求2所述的一种鉴定苹果边腐病菌的组合物，其特征在于：探针phma-fam核苷酸序列如seq id no.3所示。

4.权利要求1所述的pcr引物组，在制备检测或辅助检测苹果边腐病菌的产品、在制备鉴定或辅助鉴定苹果边腐病菌的产品、在制备定量检测苹果边腐病菌的产品、在制备预测植物感染苹果边腐病菌的产品、在检测或辅助检测苹果边腐病菌、在鉴定或辅助鉴定苹果边腐病菌、在定量检测苹果边腐病菌、或在预测植物感染苹果边腐病菌中的应用。

5.一种基于qpcr技术检测苹果边腐病菌的试剂盒，其特征在于：包括权利要求2及3所述的组合物。...

【专利技术属性】
技术研发人员：蔡磊，赵鹏，巩文峰，刘芳，李善魁，次仁央金，
申请(专利权)人：中国科学院微生物研究所，
类型：发明
国别省市：