【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及单细胞聚类,尤其是涉及一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法、系统、电子设备及介质。
技术介绍
1、单细胞rna测序(scrna-seq)技术能够测量单个细胞的基因表达量,提供了极高的细胞差异分辨率,以便研究人员更好的研究组织内部的细胞异质性。近十年来,scrna-seq广泛应用于肿瘤、微生物和发育生物学等多个研究领域。细胞聚类是scrna-seq数据分析中的关键步骤,根据细胞的基因表达模式对细胞分组,进一步完成细胞功能识别和细胞类型注释任务。然而,scrna-seq数据的稀疏性、批次效应和高维性给细胞聚类带来了巨大挑战。技术偏差导致rna捕获率低,scrna-seq转录表达谱极其稀疏,并且存在大量dropout事件,增加了数据中的噪声和缺失值,从而影响细胞聚类分析的准确性。同时,由于组织在不同批次、不同时间、不同操作者等导致测得的基因表达量不同,从而使得数据分析存在误差。此外,scrna-seq数据通常具有极高维度,这使得提取细胞类型特异性信息和描述细胞间特征关系变得非常复杂,进一步增加了细胞聚类分析的难度。
...【技术保护点】
1.一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤S1中,基于非对称自编码器对原始数据进行训练,包括以下步骤:
3.根据权利要求2所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤S2中,利用源数据标签信息和特征距离信息,使同类细胞聚集、不同的细胞簇远离,包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤S3中,利用源数据和目标数据的低维表示计
...【技术特征摘要】
1.一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤s1中,基于非对称自编码器对原始数据进行训练,包括以下步骤:
3.根据权利要求2所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤s2中,利用源数据标签信息和特征距离信息,使同类细胞聚集、不同的细胞簇远离,包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的一种基于非对称自编码器的单细胞蒸馏判别聚类方法,其特征在于,步骤s3中,利用源数据和目标数...
【专利技术属性】
技术研发人员:孙燕,秦宝娟,尚军亮,孙渊,赵妍,张晓晗,蒋守佳,
申请(专利权)人:曲阜师范大学,
类型:发明
国别省市:
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