用于扩增I型登革病毒基因组的引物组、试剂盒及其方法和应用技术

本发明专利技术提供了一种用于靶向扩增I型登革病毒基因组的引物组、试剂盒及其方法和应用，涉及登革病毒检测，属于基因组检测技术领域。本发明专利技术设计了用于扩增I型登革病毒基因组的通用型引物组，能够对I型登革病毒基因组进行靶向扩增，构建文库后利用三代测序平台开展测序、序列拼装，得到I型登革病毒基因组。本发明专利技术提供的方法能够扩增所有I型登革病毒亚型，且通量大，成本低，序列拼接简单。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测，涉及i型登革病毒基因组检测，具体涉及用于靶向扩增i型登革病毒基因组的引物组、试剂盒及其方法和应用。

技术介绍

1、登革热是一种由登革病毒（dengue virus）引起、主要由伊蚊传播、严重危害人类健康的病毒性传染病。登革病毒属黄病毒科黄病毒属，基因组为单股正链rna，全长约11kb，两端为非编码区，内部的编码区依次编码3种结构蛋白（c、prm/m和e）和7种非结构蛋白（ns1、ns2a、ns2b、ns3、ns4a、ns4b和ns5）。根据包膜蛋白ｅ可把denv分为４种血清型，分别denv-1、denv-2、denv-3和denv-4，各血清型内又根据核苷酸序列差异进一步细分为多种基因型，比如i型登革病毒包括基因型i、ii、iii、iv和v这5种基因型。

2、获得i型登革病毒全基因组序列是进行i型登革病毒分子病毒学研究的重要基础，对于研究病毒在特定人群或地区内的进化、传播和分布情况，确定新的亚型，以及研发诊断试剂和疫苗等应用具有重要作用。测序的方法依然是目前最准确的鉴定病毒变异株的方法。只有通过全长测序的方法才能精确地鉴本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.用于扩增I型登革病毒基因组的引物组，其特征在于，所述引物组包含如SEQ IDNO.1-20所示的核酸序列。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述引物组分为两个引物池，分别为引物池1和引物池2；所述引物池1由如SEQ ID NO.1-10所示的核酸序列组成，所述引物池2由如SEQ ID NO.11-20所示的核酸序列组成。

3.一种扩增I型登革病毒基因组的方法，其特征在于，所述方法为使用权利要求1所述的引物组对I型登革病毒基因组进行扩增。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

5.根据权利要求4所述...

【技术特征摘要】

1.用于扩增i型登革病毒基因组的引物组，其特征在于，所述引物组包含如seq idno.1-20所示的核酸序列。

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述引物组分为两个引物池，分别为引物池1和引物池2；所述引物池1由如seq id no.1-10所示的核酸序列组成，所述引物池2由如seq id no.11-20所示的核酸序列组成。

3.一种扩增i型登革病毒基因组的方法，其特征在于，所述方法为使用权利要求1所述的引物组对i型登革病毒基因组进行扩增。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤s1中的样本包括体液样本、人工培养物样本或病媒生物。

6.根据权利要求4所述的方法，...

【专利技术属性】
技术研发人员：汪海波，黄慧娜，李伟刚，廖梦华，徐君婷，陈新彬，
申请(专利权)人：珠海国际旅行卫生保健中心拱北海关口岸门诊部，
类型：发明
国别省市：