【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本文描述了涉及用于纠正abca4(atp结合盒亚家族a成员4)中的突变的反式剪接分子的组合物、方法和用途。
技术介绍
1、abca4的隐性遗传突变是导致渐进性失明,包括斯特格氏病(stargardt disease)和视锥-视杆细胞营养不良的原因。abca4位于感光细胞外节视盘膜的边缘区域,起到将n-亚视黄基-磷脂酰乙醇胺(n-ret-pe)从管腔转运到视盘膜细胞质小叶的转运蛋白(或“翻转酶”)的作用。abca4蛋白缺陷会导致有毒类视黄酸化合物的积累,最终导致光感受器和视网膜色素上皮细胞死亡。abca4的6882bp编码序列太大,无法通过单个aav载体完整递送。此外外,由于在整个基因中发现了数百种致病突变,所以单一的碱基编辑方法无法解决大量患者的问题。因此,本领域需要纠正abca4基因中的突变的替代策略。
技术实现思路
1、abca4相关的视网膜病变,例如斯特格氏病,是影响成人和儿童的严重罕见遗传性视网膜疾病,由abca4基因的双等位基因致病突变引起。据估计,全世界每8,000至10,00
...【技术保护点】
1.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
2.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
3.如权利要求2所述的核酸反式剪接分子,其中所述SEQ ID NO:55的变体包含SEQ IDNO:56-59中的任一者。
4.如权利要求3所述的核酸反式剪接分子,其中所述SEQ ID NO:55的变体包含SEQ IDNO:56。
5.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述接头结构域包含与SEQ ID NO:27具有至少85%同一性、至少86%同一性、至少87%同一性、至少88%同一性或至少89%同
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
2.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
3.如权利要求2所述的核酸反式剪接分子,其中所述seq id no:55的变体包含seq idno:56-59中的任一者。
4.如权利要求3所述的核酸反式剪接分子,其中所述seq id no:55的变体包含seq idno:56。
5.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述接头结构域包含与seq id no:27具有至少85%同一性、至少86%同一性、至少87%同一性、至少88%同一性或至少89%同一性、90%同一性、91%同一性、至少92%同一性、至少93%同一性、至少94%同一性、至少95%同一性、至少96%同一性、至少97%同一性、至少98%同一性或至少99%同一性的序列。
6.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述接头结构域包含seqid no:27、基本上由其组成或由其组成。
7.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述结合结构域退火到所述内源abca4 mrna前体中的内含子。
8.如权利要求7所述的核酸反式剪接分子,其中所述内源abca4 mrna前体中的所述内含子是内含子22。
9.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述结合结构域包含seqid no:18或seq id no:20。
10.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述结合结构域基本上由seq id no:18或seq id no:20组成或由其组成。
11.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述结合结构域基本上由seq id no:20组成或由其组成。
12.如权利要求1或5-11中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述cds包含abca4外显子1-22或其变体。
13.如权利要求12所述的核酸反式剪接分子,其中所述cds包含seq id no:53-59中的任一者、基本上由其组成或由其组成。
14.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
15.如权利要求14所述的核酸反式剪接分子,其中所述cds包含seq id no:53-59中的任一者、基本上由其组成或由其组成。
16.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
17.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包含增效子,所述增效子包括包含ggtaagt或seq id no:61的至少一个序列。
18.如权利要求17所述的核酸反式剪接分子,其中所述增效子在3′可操作地连接到所述接头结构域。
19.如权利要求17或18中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述增效子包含三个串联排列并可操作地连接的序列,其中所述三个序列中的每一个包含ggtaagt或seq idno:61。
20.如权利要求17-19中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述增效子包含三个串联排列的序列,其中所述三个序列包含seq id no:62。
21.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包含翻译增效子,其中所述翻译增效子包含seq id no:63或与seq id no:63具有至少90%同一性的序列,其中seq id no:63或所述与seq id no:63具有至少90%同一性的序列在3′可操作地连接到所述增效子。
22.如权利要求21所述的核酸反式剪接分子,其中所述翻译增效子与seq id no:63具有至少91%同一性,与seq id no:63具有至少92%同一性,与seq id no:63具有至少93%同一性,与seq id no:63具有至少94%同一性,与seq id no:63具有至少95%同一性,与seq id no:63具有至少96%同一性,与seq id no:63具有至少97%同一性,与seq id no:63具有至少98%同一性,或与seq id no:63具有至少99%同一性。
23.如权利要求21或22中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述翻译增效子包含seq id no:63、基本上由其组成或由其组成。
24.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包括包含gtaagt、gtaagg、gtaagc或gtaact中任一者的剪接结构域。
25.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包括包含gtaagt、基本上由其组成或由其组成的剪接结构域。
26.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包含5′非翻译区。
27.如权利要求26所述的核酸反式剪接分子,其中所述5′非翻译区包含seq id no:13或seq id no:64、基本上由其组成或由其组成。
28.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包含3′转录终止子结构域。
29.如权利要求28所述的核酸反式剪接分子,其中所述3′转录终止子结构域编码形成三螺旋结构的核糖核酸,所述三螺旋结构保护所述反式剪接分子的3′端。
30.如权利要求28或权利要求29所述的核酸反式剪接分子,其中所述3′转录终止子结构域包含野生型malat1序列(seq id no:33)或与seq id no:33具有至少80%同一性的核酸序列。
31.如权利要求30所述的核酸反式剪接分子,其中所述3′转录终止子结构域包含如下核酸序列,所述核酸序列与seq id no:33具有至少80%同一性;与seq id no:33具有至少85%同一性;与seq id no:33具有至少90%同一性;与seq id no:33具有至少91%同一性;与seq id no:33具有至少92%同一性;与seq id no:33具有至少93%同一性;与seq idno:33具有至少94%同一性;与seq id no:33具有至少95%同一性;与seq id no:33具有至少96%同一性;与seq id no:33具有至少97%同一性;与seq id no:33具有至少98%同一性;与seq id no:33具有至少99%同一性;或与seq id no:33100%同一。
32.如权利要求28或权利要求29所述的核酸反式剪接分子,其中所述3′转录终止子结构域包含seq id no:33或seq id no:66、基本上由其组成或由其组成。
33.如前述权利要求中任一项所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子还包含至少一个在3′操作性连接到所述剪接结构域的终止密码子。
34.如权利要求33所述的核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子在5′至3′方向上包含操作性连接的以下各者:
35.如权利要求34所述的核酸反式剪接分子,其中
36.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子包含:
37.如权利要求36所述的核酸反式剪接分子,其中
38.一种核酸反式剪接分子,所述核酸反式剪接分子在5′至3′方向上包含操作性连接的以下各者:
39.如权利要求37或权利要求38所述的核酸反式剪接分子,其中所述核酸反式剪接分子包含seq id no:69、seq id no:78或seq id no:90、基本上由其组成或由其组成。
40.如权利要求1-20中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述核酸反式剪接分子包含seq id no:70或seq id no:71、基本上由其组成或由其组成。
41.如权利要求1-12中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述核酸反式剪接分子包含与seq id no:40-44、46或48-50中的任一者具有至少80%同一性的核酸序列。
42.一种核糖核酸反式剪接分子,所述核糖核酸反式剪接分子从如权利要求1-41中任一项所述的核酸反式剪接分子转录。
43.如权利要求1-41中任一项所述的核酸反式剪接分子,其中所述内源abca4 mrna前体包含至少一个与abca4相关的视网膜营养不良相关的突变。
44.如权利要求43所述的核酸反式剪接分子,其中所述abca4相关的视网膜营养不良是隐性遗传的。
45.如权利要求43或44所述的核酸反式剪接分子,其中所述abca4相关的视网膜营养不良与跨越所述abca4基因的外显子1-22的等位基因致病突变和与视锥-视杆细胞营养不良(例如,视锥-视杆细胞营养不良-3)、斯特格氏黄斑营养不良(例如,斯特格氏病-1)、眼底黄色斑点...
【专利技术属性】
技术研发人员:R·克伦巴赫,S·杜利,A·多伊,K·伯克哈特,J·格雷,彭凌涛,D·吴,A·诺码,K·戈西克,S·斯洛莫维奇,A·克莱门斯,R·贝尔,
申请(专利权)人:海鞘治疗公司,
类型:发明
国别省市:
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