本发明专利技术涉及一种与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法和应用，属于生物技术领域。本发明专利技术通过检测GPR107基因18号染色体第7909242位碱基的基因型，得出T/T基因型个体蛋重高于T/C基因型个体和C/C基因型个体，T/C基因型个体蛋重高于C/C基因型个体，将其用于筛选优质蛋鸭的蛋重指标，其有益效果是可以高效快速地鉴定鸭蛋重性状，有助于提高选种准确性，加快育种进展，降低育种成本和生产成本。此外，本发明专利技术公开的检测方法简单易操作，在实验室即可开展，也可以应用到基因组育种技术中。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法和应用，属于生物。
技术介绍
1、在家禽生产中，对蛋禽和肉禽而言，产蛋性能都是极其重要的主选经济性状。产蛋性能优良的品种在提高种用家禽的供种能力，降低制种成本，提高商品代生产能力和经济效益等方面更具优势。产蛋性能主要受遗传、环境和营养等多种因素的影响，属于微效多基因控制的低遗传力数量性状。过去，对家禽产蛋性能的选育主要以常规表型选育为主，经过近一个世纪的选育，对产蛋量和蛋重这些重要产蛋性能的选育已经有较大程度的提高，尤其在蛋鸡中，产蛋数等指标已经趋于极限。随着家禽产蛋性能的提高以及选育技术的发展，传统表型选择，已经远不能满足蛋重等产蛋性能指标的遗传选育需求；尤其是对水禽而言，由于对其喜水性和求偶交配等生物学特性了解的局限，导致水禽育种一直处于大群选育状态，已经成为阻碍水禽产蛋性能选育进展的瓶颈之一。
2、鸭蛋蛋重对蛋鸭生产经济价值有显著影响。在市场上，鸭蛋通常以不同加工产品如咸鸭蛋、皮蛋等产品形式面向市场，其产品价格通常与其重量相关，较重的鸭蛋表示更高的产品等级，市场体现出更高的价格和更高的生产经济效益。此外，鸭蛋的蛋重也会影响其孵化率和雏鸭的出生重，研究表明，合适的蛋重可以显著提高受精率和孵化率；雏鸭初生重与蛋重显著正相关。蛋鸭蛋重指标具有复杂的遗传特性,且受多基因所控制。研究表明蛋重性状遗传力可达45～55%,这就意味着通过遗传标记选育蛋重指标；但当前蛋重选育传统选育技术下选育进展缓慢，急需研发新的关联基因，为蛋重性状的选育工作提供多条途径。
r/>技术实现思路
1、本专利技术的目的是针对现有技术存在的缺陷，提出一种与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法和应用，可快速、准确鉴定鸭蛋重性状。
2、本专利技术测量了金定母鸭43周龄时的蛋重，利用全基因组重测序技术进行snp基因分型，通过全基因组关联分析筛选得到与鸭蛋重显著相关的gpr107基因分子标记，为鸭的蛋重性状选育提供了新的基因和分子标记资源。gpr107基因是g蛋白偶联受体（gpcr）家族的成员，gpcr是一类广泛存在于生物体中的受体，也是hpg轴功能的核心。在下丘脑中，gpcr可以响应不同的神经递质和激素，如多巴胺、去甲肾上腺素和5-羟色胺等，影响下丘脑神经元的活动，调节gnrh的释放，促进lh和fsh的分泌，最终影响繁殖功能，调控产蛋性状。
3、本专利技术通过以下技术方案解决技术问题：本专利技术首先提供一种与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法， 包括以下步骤，
4、第一步、将待测鸭dna样品，用鸭dna特异性引物对进行pcr
5、扩增，得到扩增产物；
6、第二步、将所述扩增产物进行sanger测序；
7、第三步、根据第二步的测序结果判断目标位点的snp分子标记
8、基因型。
9、上述方法的所述第一步中鸭dna特异性引物对的脱氧核糖核苷酸序列由上游引物：5’-cccagacacccgaaatag-3’（seq id no: 1）
10、下游引物：5’-agcaaagaagagcgagga-3’（seq id no: 2）组成，所述鸭dna特异性引物对应的分子标记位于鸭参考基因组gcf_015476345.1_zju1.0版本18号染色体第7909242位碱基，碱基突变为t或c，基因型为t/t、t/c和c/c。
11、pcr反应体系终浓度以25μl计为：
12、待测鸭dna 50 ng
13、2 x accurate taq master mix 12.5μl
14、上游引物 1 μl
15、下游引物 1 μl
16、灭菌水 补充至25 μl，
17、pcr扩增的反应条件为94℃预变性5min；94℃变性30sec，55℃退火30sec，72℃延伸60sec，共30循环；72℃延伸2min；20℃保存。
18、扩增产物长度为190bp，包含鸭参考基因组gcf_015476345.1_zju1.0版本18号染色体上第7909242位碱基，所述扩增产物序列如seq id no: 3或seq id no: 4所示。
19、所述第三步中，判断标准是snp位点为t/t基因型鸭的蛋重高于t/c基因型鸭和c/c基因型鸭，为t/c基因型鸭的蛋重高于c/c基因型鸭。
20、本专利技术进一步提供一种与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法的应用，用于检测金定鸭的43周龄鸭蛋重性状。
21、本专利技术通过检测gpr107基因18号染色体第7909242位碱基的基因型，得出t/t基因型个体43周龄蛋重高于t/c基因型和c/c基因型个体，t/c基因型个体蛋重高于c/c基因型个体。以待测鸭的基因组dna为模板，采用特异引物对进行pcr扩增，然后将该pcr扩增产物进行sanger测序和snp分子标记基因分型，基于该snp分子标记的基因型可以实现对鸭产蛋性能进行选择。在育种中，根据育种目标，通过淘汰t/c基因型个体，保留t/t基因型或者c/c基因型个体，将其用于筛选优质鸭蛋重指标，其有益效果是可以高效快速地鉴定鸭蛋重性状，为优质鸭的早期选育提供科学依据，有助于加快育种进展，提高育种准确性，降低育种成本和生产成本，对于优质鸭具有很大的应用价值和育种价值。此外，本专利技术公开的检测方法简单易操作，在实验室即可开展，也可以应用到基因组育种技术中。
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【技术保护点】
1.一种与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法，其特征在于：包括以下步骤，第一步、将待测鸭DNA样品，用鸭DNA特异性引物对进行PCR扩增，得到扩增产物；第二步、将所述扩增产物进行Sanger测序；第三步、根据第二步的测序结果判断目标位点的SNP分子标记基因型。
2.根据权利要求1所述与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法， 其特征在于：所述第一步中鸭DNA特异性引物对的脱氧核糖核苷酸序列由上游引物SEQ ID NO: 1和下游引物SEQ ID NO: 2组成，所述鸭DNA特异性引物对应的分子标记位于鸭参考基因组GCF_015476345.1_ZJU1.0版本18号染色体第7909242位碱基，碱基突变为T或C，基因型为T/T、T/C和C/C。
3.根据权利要求2所述与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法， 其特征在于：PCR反应体系终浓度以25μl计为：
4.根据权利要求3所述与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法， 其特征在于：扩增产物长度为190bp，包含鸭参考基因组GCF_015476345.1_ZJU1.0版本18号染色体上第7909242位碱基，所述扩增产物序列如SEQ ID NO: 3或SEQ ID NO: 4所示。
5.根据权利要求2所述与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法， 其特征在于：所述第三步中，判断标准是SNP位点为T/T基因型鸭的蛋重高于T/C基因型鸭和C/C基因型鸭，为T/C基因型鸭的蛋重高于C/C基因型鸭。
6.一种与鸭蛋重性状相关的GPR107基因检测方法的应用，其特征在于：用于检测金定鸭的43周龄鸭蛋重性状。
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【技术特征摘要】
1.一种与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法，其特征在于：包括以下步骤，第一步、将待测鸭dna样品，用鸭dna特异性引物对进行pcr扩增，得到扩增产物；第二步、将所述扩增产物进行sanger测序；第三步、根据第二步的测序结果判断目标位点的snp分子标记基因型。
2.根据权利要求1所述与鸭蛋重性状相关的gpr107基因检测方法， 其特征在于：所述第一步中鸭dna特异性引物对的脱氧核糖核苷酸序列由上游引物seq id no: 1和下游引物seq id no: 2组成，所述鸭dna特异性引物对应的分子标记位于鸭参考基因组gcf_015476345.1_zju1.0版本18号染色体第7909242位碱基，碱基突变为t或c，基因型为t/t、t/c和c/c。
3.根据权利要求2所述与鸭蛋重性状相关...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘宏祥，朱春红，章双杰，李慧芳，陶志云，宋卫涛，王志成，古丽娜·艾山，曾涛，顾昊天，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：
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