生成基于推理的虚拟染色图像注释的方法技术

一种生成虚拟染色图像注释的方法。该方法包括提供由图像处理软件执行的神经网络。该图像处理软件在计算设备的处理器上运行。该方法包括采用内源信号的多个化学染色图案训练神经网络以识别虚拟染色图案。该方法包括产生和注释用于生物标志物的生物样本的图像。生物样本包括内源信号。该方法包括使用经训练的神经网络识别生物样本的图像中的虚拟染色图案。最后，该方法包括使用空间匹配将生物样本的图像中的虚拟染色图案与注释叠加以产生虚拟染色图像注释。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及一种用于生物标志物发现、基于组织的研究和诊断测试的虚拟染色应用。更具体地，本公开涉及一种虚拟染色方法，用于将多种免疫组织化学(“ihc”)染色技术独立地应用于同一组织样本和同一组织位置，而无需清洗ihc染色或修改组织。本文所描述的虚拟染色方法还可以与其它现有虚拟染色和传统测定读数组合，以创建新的多重读数。

技术介绍

1、免疫组织化学分析经常被许多医学和生物学领域的临床医生和研究人员用于评估和诊断各种疾病。在这些领域中，使用生物标志物信息来评估肿瘤组织中的原位蛋白质表达的需求日益增长。如在immunohistochemical staining characteristics ofnephrogenic adenoma using the pin-4cocktail(p63,amacr,and ck903)and gata-3,mcdaniel,a.,et al.,am.j.surg.pathol.2014dec；38(12):1664-71中所讨论的，使用pin-4混合物(p63，amacr和ck903)和gata-3显色ihc染色对肾源性腺瘤进本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于生成基于推理的虚拟染色图像注释的方法，包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述注释包括由所述一个或多个神经网络用于执行语义分割的特征。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述获得并产生所述生物样本的所述图像包括测序或成像质谱技术。

4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述获得并产生所述生物样本的所述图像包括免疫组织化学或免疫荧光技术。

5.根据权利要求4所述的方法，其中，所述免疫组织化学或免疫荧光技术包括直接比较相同组织切片上两个或更多个抗体克隆的虚拟染色图案。

6.根据权利要求4所述的方法，其中，所述免疫...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种用于生成基于推理的虚拟染色图像注释的方法，包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述注释包括由所述一个或多个神经网络用于执行语义分割的特征。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述获得并产生所述生物样本的所述图像包括测序或成像质谱技术。

4.根据权利要求1所述的方法，其中，所述获得并产生所述生物样本的所述图像包括免疫组织化学或免疫荧光技术。

5.根据权利要求4所述的方法，其中，所述免疫组织化学或免疫荧光技术包括直接比较相同组织切片上两个或更多个抗体克隆的虚拟染色图案。

6.根据权利要求4所述的方法，其中，所述免疫组织化学或免疫荧光技术包括：

7.根据权利要求1所述的方法，其中，可以调节所述虚拟染色图案的不透明度水平，以便能够聚焦于特定的抗体克隆。...

【专利技术属性】
技术研发人员：K·德哈恩，Y·里文逊，F·科隆内塞，T·刘，R·科齐克夫斯基，
申请(专利权)人：皮克托实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：