测序L-多核苷酸的方法技术

技术编号:44478700 阅读:23 留言:0更新日期:2025-03-04 17:46
本公开提供了扩增和测序L‑型多核苷酸的新颖方法。进一步提供的包括可以用于该方法中的L‑型核苷酸和D‑型酶。还提供了制备L‑型核苷酸和D‑型酶的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

【技术保护点】

1.一种核苷酸或核苷,其包含:

2.权利要求1所述的核苷酸,其中所述可裂解标记连接至所述含氮碱基、所述3’O或所述5’磷酸基团。

3.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式I的结构:

4.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式II的结构

5.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式III的结构:

6.权利要求1、2、4或5所述的核苷酸,其中所述标记选自由以下各项组成的组:

7.权利要求1-4中任一项所述的核苷酸,其中所述可裂解保护基团选自烯丙基、二甲基二硫基、硝基苄基和叠氮基保护基团。

8.权利要求7所述的核苷酸...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种核苷酸或核苷,其包含:

2.权利要求1所述的核苷酸,其中所述可裂解标记连接至所述含氮碱基、所述3’o或所述5’磷酸基团。

3.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式i的结构:

4.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式ii的结构

5.权利要求1所述的核苷酸,其具有根据式iii的结构:

6.权利要求1、2、4或5所述的核苷酸,其中所述标记选自由以下各项组成的组:

7.权利要求1-4中任一项所述的核苷酸,其中所述可裂解保护基团选自烯丙基、二甲基二硫基、硝基苄基和叠氮基保护基团。

8.权利要求7所述的核苷酸,其中所述可裂解保护基团选自:

9.权利要求1、2、4或5所述的核苷酸,其中所述可裂解连接体是可光裂解的、通过与水溶性膦接触而裂解或被水溶性含过渡金属的催化剂裂解。

10.权利要求9所述的核苷酸,其中所述可裂解连接体包含烯丙基或叠氮基。

11.权利要求[0124]所述的核苷酸,其中所述可裂解连接体包含:

12.权利要求3所述的核苷酸,其选自:

13.权利要求4所述的核苷酸,其选自:

14.权利要求5所述的核苷酸,其选自:

15.权利要求4所述的核苷酸,其选自:

16.权利要求5所述的核苷酸,其选自:

17.一种镜像核酸聚合酶,其包含与seq id no:1具有至少90%序列同一性的序列,其中所述聚合酶包含d-型氨基酸。

18.权利要求17所述的聚合酶,其中所述聚合酶由d-型氨基酸组成。

19.权利要求17或18所述的聚合酶,其包含与seq id no:1具有至少95%序列同一性的序列。

20.权利要求19所述的聚合酶,其包含与seq id no:1具有至少96%、97%、98%或99%序列同一性的序列。

21.权利要求17-20中任一项所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自e276、k317、n424和s651的氨基酸位点处的一个或多个修饰。

22.权利要求21所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比一个或多个选自e276a、k317g、n424a和s651a的替换。

23.权利要求22所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比e276a、k317g、n424a和s651a替换。

24.权利要求17-23中任一项所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自i80、i127、i171、i176、i191、i228、i256、i264、i268、i400、i597、i610、i618、i630、i642、i715、i733和i744的氨基酸位点处的一个或多个修饰。

25.权利要求24所述的聚合酶,其中其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自i80、i127、i171、i176、i191、i228、i256、i264、i268、i400、i597、i610、i618、i630、i642、i715、i733和i744的氨基酸位点处的一个或多个从ile替换为ala、val、leu或tyr的替换。

26.权利要求25所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比一个或多个选自i80v、i127v、i171a、i176v、i191v、i228v、i256v、i264a、i268l、i400v、i597v、i610v、i618a、i630l、i642v、i715y、i733v和i744v的替换。

27.权利要求26所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比i80v、i127v、i171a、i176v、i191v、i228v、i256v、i264a、i268l、i400v、i597v、i610v、i618a、i630l、i642v、i715y、i733v和i744v的替换。

28.权利要求17-27中任一项所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自m129、i130、g131、d141、e143、l408、y409、p410、a485、t514和i521的氨基酸位点处的一个或多个修饰。

29.权利要求28所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自d141、e143、y409和a485的氨基酸位点处的一个或多个修饰。

30.权利要求29所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比一个或多个选自d141a、e143a、y409v和a485l的替换。

31.权利要求30所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比d141a、e143a、y409v和a485l的替换。

32.权利要求28所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比在一个或多个选自d141、e143、l408、y409、p410、a485、t514和i521的氨基酸位点处的一个或多个修饰。

33.权利要求32所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比一个或多个选自d141a、e143a、l408a、y409a、p410i、a485v、t514s和i521l的替换。

34.权利要求33所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比d141a、e143a、l408a、y409a、p410i、a485v、t514s和i521l的替换。

35.权利要求28所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比一个或多个选自m129l、d141a、e143a、l408a、y409a、p410i、a485v、t514s、i521l的替换或在i130与g131之间d的增添的修饰。

36.权利要求35所述的聚合酶,其包含与seq id no:1相比m129l、d141a、e143a、l408a、y409a、p410i、a485v、t514s和i521l的替换和在i130与g131之间d的增添。

37.权利要求17-36中任一项所述的聚合酶,其包含选自seq id nos:2-7的序列。

38.权利要求37所述的聚合酶,其由选自seq id nos:2-7的序列组成。

39.一种复制l-多核苷酸的方法,其包括以下步骤:将包含(i)所述l-多核苷酸、(ii)l-引物、(iii)l-dntp、(iv)权利要求1-38中任一项所述的聚合酶和(v)缓冲液的混合物温育,从而诱导所述l-聚合酶的复制。

40.权利要求39所述的方法,其中所述l-多核苷酸是dna或rna。

41.权利要求39-40中任一项所述的方法,其中所述混合物包含l-datp、l-dgtp、l-dctp和l-dttp。

42.权利要求39-41中任一项所述的方法,其中所述缓冲液包含50mm tris-hcl,ph7.5,20mm mgcl2,1mm dtt和50mm kcl。

43.权利要求39-42中任一项所述的方法,其中所述温育步骤包括pcr。

44.一种测序l-多核苷酸的方法,其包括以下的循环:

45.权利要求44所述的方法,其中所述循环重复至少3、...

【专利技术属性】
技术研发人员:D·H·金J·H·钟B·S·黄
申请(专利权)人:得克斯奥梅有限公司
类型:发明
国别省市:

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