一种基于四角蛤蜊有参转录组序列开发的SSR分子标记、扩增引物及应用制造技术

本发明专利技术属于分子标记技术开发及应用技术领域，公开了一种基于四角蛤蜊有参转录组序列开发的SSR分子标记，所述SSR分子标记包括16个微卫星标记对应的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.16所示。目前未见有从基因组和转录组中开发四角蛤蜊微卫星的报道，本发明专利技术首次基于高通量转录组测序技术，从四角蛤蜊转录组数据中开发出16个稳定、条带清晰、多态性高的微卫星分子标记，为四角蛤蜊种群遗传学分析、亲缘关系鉴定、高密度遗传图谱构建及分子标记辅助育种领域，具有良好的实际生产和应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子标记技术开发及应用，尤其是一种基于四角蛤蜊有参转录组序列开发的ssr分子标记、扩增引物及应用。

技术介绍

1、四角蛤蜊(mactra veneriformis)隶属于瓣鳃纲(lamellibranchia)，异齿亚纲(heterodonta)，帘蛤目(veneroida)，蛤蜊科(mactridae)，蛤蜊属(mactra)，俗称白蚬子，沙蛤、沙蜊、白蛤，是中国主要的经济贝类之一，营埋栖性生活，主要分布潮间带中下区及浅海的泥沙滩中，分布于中国、韩国、日本，在我国以天津、辽宁、山东、江苏沿海产量较多。因其味道鲜美、营养价值高，如高蛋白，低脂肪，富含不饱和脂肪酸等优点，深受消费者的喜爱。近年来，随着工业的发展，围海造陆规模在部分沿海城市逐渐扩大，滩涂贝类的产卵场收到极大的影响，在一定程度上导致四角蛤蜊等滩涂贝类资源的减少，因此急需阐明四角蛤蜊种群资源背景，为四角蛤蜊新品种的培育奠定基础。

2、微卫星标记(ssr)是一类重要的分子标记，目前开发的方法主要有两种，一种是传统的基因组开发方法(genomic ssr，g-ssr)，一种是本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于四角蛤蜊有参转录组序列开发的SSR分子标记，其特征在于：所述SSR分子标记包括16个微卫星标记Mv01、Mv05、Mv09、Mv12、Mv13、Mv16、Mv18、Mv20、Mv22、Mv30、Mv42、Mv43、Mv45、Mv70、Mv71、Mv72，其对应的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.16所示。

2.如权利要求1所述的SSR分子标记的扩增引物，其特征在于：所述扩增引物包括16个扩增引物对，其对应的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.17-SEQ ID NO.48所示。

3.如权利要求1所述的SSR分子标记的获取方法，...

【技术特征摘要】

1.一种基于四角蛤蜊有参转录组序列开发的ssr分子标记，其特征在于：所述ssr分子标记包括16个微卫星标记mv01、mv05、mv09、mv12、mv13、mv16、mv18、mv20、mv22、mv30、mv42、mv43、mv45、mv70、mv71、mv72，其对应的核苷酸序列依次如seq id no.1-seq id no.16所示。

2.如权利要求1所述的ssr分子标记的扩增引物，其特征在于：所述扩增引物包括16个扩增引物对，其对应的核苷酸序列依次如seq ...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈丽梅，黄庚胤，王墨染，张丹，郭永军，
申请(专利权)人：天津农学院，
类型：发明
国别省市：