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基于RNAErnie预训练模型的RNA N4-乙酰胞苷修饰位点预测方法及系统技术方案

技术编号:43964138 阅读:21 留言:0更新日期:2025-01-07 21:49
本发明专利技术涉及一种基于RNAErnie预训练模型的RNAN4‑乙酰胞苷修饰位点预测方法及系统。所述方法包括:采集RNA序列数据集输入至RNAErnie预训练模型中捕捉上下文依赖关系并提取出全局特征;通过RNAErnie预训练模型结合六种传统特征编码方法进行特征编码;通过深度神经网络模型中进行特征降维后输入至软投票集成模型中集成不同分类器的预测结果,得到RNAN4‑乙酰胞苷修饰位点预测结果。通过RNAErnie预训练模型进行多级掩码,并结合六种传统特征编码方式可以捕捉到序列的细节和物理化学属性;利用深度神经网络自动进行特征降维,减少了计算复杂度并保留了关键信息;将降维后的特征输入软投票集成模型,通过集成多个分类器得到最终预测结果,显著提升了预测的准确性和鲁棒性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息,特别是涉及一种基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法及系统。


技术介绍

1、迄今为止,在rna中已经发现了超过170种修饰的核苷。rna的转录后化学修饰,统称为“表转录组”,对基因表达和细胞过程具有实质性影响,在分子相互作用和分子间关系中起着重要作用。n4-乙酰胞苷(ac4c)是由酶nat10催化的常见类型,在胞苷碱基的第四位的氮上添加乙酰基。最初在真核生物和原核生物的trna和rrna中发现了ac4c,目前的研究还确定了ac4c存在于人类mrna中,它可以提高翻译效率,增强mrna稳定性,并调节基因表达。此外,越来越多的证据表明,ac4c与多种人类疾病有关,包括炎症、代谢紊乱、自身免疫性疾病和癌症等。总之,ac4c修饰作为rna的关键转录后修饰,在细胞功能和疾病过程中发挥重要作用。探讨rna-ac4c修饰位点的功能和机制对于阐明其生物学意义和推进相关疾病的治疗策略至关重要。

2、传统的rna-ac4c修饰位点探测包括生物实验方法、高通量测序技术、计算机辅助分析方法。其中,传统的生物实验方法本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于RNAErnie预训练模型的RNAN4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的基于RNAErnie预训练模型的RNAN4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法还包括:

3.根据权利要求1所述的基于RNAErnie预训练模型的RNAN4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法还包括:

4.根据权利要求1所述的基于RNAErnie预训练模型的RNAN4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,采集RNA序列数据集之后,所述方法还包括:

5.根据权利要求1所述的基于RNAErni...

【技术特征摘要】

1.一种基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法还包括:

3.根据权利要求1所述的基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法还包括:

4.根据权利要求1所述的基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,采集rna序列数据集之后,所述方法还包括:

5.根据权利要求1所述的基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,所述rnaernie预训练模型建立在通过知识集成增强表示框架的基础上,且结合transformer层和多头自注意机制;其中:

6.根据权利要求1所述的基于rnaernie预训练模型的rnan4-乙酰胞苷修饰位点预测方法,其特征在于,将所述rna序列数据集中的每条r...

【专利技术属性】
技术研发人员:张子龙贾艳娜崔菲菲耿奥运付修豪
申请(专利权)人:海南大学
类型:发明
国别省市:

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