【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学和药物设计领域，尤其涉及一种用于提高网络接近度法优选药物效率的技术方法。
技术介绍
1、网络药理学结合生物信息学、网络科学和药物学，研究药物分子与生物体内靶点、通路、基因、蛋白质等分子的相互作用网络。这种方法的核心在于系统生物学的观念，即生命系统被视为一个复杂的网络，其中各组成部分之间存在复杂的相互作用。疾病的发生涉及这个复杂网络中部分或全部节点的变化，而药物作用在复杂网络中有限的靶点上，从而影响网络对疾病的治疗产生作用。
2、网络接近度法的药物优选方法是一种基于复杂网络分析的策略，用于在药物开发过程中筛选和优化潜在的药物候选分子。它通过分析药物与其潜在靶标之间的网络距离或连接性来预测药物的作用效果。这种方法的核心思想是，药物作用靶标与疾病相关蛋白在生物网络中的距离越近，它们之间发生相互作用的可能性就越大。
3、但是在传统的网络接近度算法中使用的计算策略存在重复计算d值问题，当需要计算大量分子与靶蛋白网络之间的接近度时，这些分子作用的蛋白可能存在重叠，对每一个分子都独立进行一次网络接近度计...
【技术保护点】
1.一种高效的基于网络接近度法的药物优选方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，包含疾病靶网络和药物靶点的蛋白质互作网络是基于公开文献和数据库获取的。
3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述包含疾病靶网络和药物靶点的蛋白质互作网络是原始蛋白质互作网络图中的最大连通分量。
4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述最短距离采用igraph包中的shortest.paths函数实现。
5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括依据药物在其他数据库中的扰动相似度评分进行药物优选。
<...【技术特征摘要】
1.一种高效的基于网络接近度法的药物优选方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，包含疾病靶网络和药物靶点的蛋白质互作网络是基于公开文献和数据库获取的。
3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述包含疾病靶网络和药物靶点的蛋白质互作网络是原始蛋白质互作网络图中的最大连通分量。
4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述最短距离采用igraph包中的shortest.paths函数实现。
5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括依据药物在其他数据库中的扰动相似度评分进行药物优选。
6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述其他数据库中的扰动相似度评分为camp和lincs数据库中的scaled_score值。
【专利技术属性】
技术研发人员：代绍兴，包杨欢，杨鹏鹏，周子昂，吕豪豪，
申请(专利权)人：普百思生物科技苏州有限公司，
类型：发明
国别省市：
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