一种FFPE样本中DNA的高完整度提取方法技术

本发明专利技术公开了一种FFPE样本中DNA的高完整度提取方法，在现有FFPE磁珠法的基础上，明确环境条件与磁珠粒径的优选组合关系，通过裂解液、洗涤液的pH设定，以及磁珠粒径选择，得到了核酸片段长、完整度高的DNA提取方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及dna提取，具体涉及一种ffpe样本中dna的高完整度提取方法。

技术介绍

1、ffpe(formalin fixed paraffin embedded，福尔马林固定和石蜡包埋)是一种常见的组织样本处理方法。通过将组织用福尔马林进行固定，并用石蜡进行包埋，使组织在长期保存和切片后仍能保持完整性，这使得ffpe样本成为癌症诊断、治疗和预后评估等领域中最常用的组织样本类型之一。

2、然而，福尔马林的固定和石蜡的高温渗入，容易使得组织中的核酸发生不同程度的降解和分子间的交联，导致难以从ffpe样本中提取高质量dna。随着下一代测序技术(ngs)的不断进步，通过优化核酸提取方法，研究人员可以更好地利用ffpe样本，深入挖掘其中的珍贵信息资源，为疾病研究和个性化治疗带来更多的可能和机会。

3、专利技术专利cn103725672b公开了一种一种从福尔马林固定石蜡包埋组织中共分离dna和rna的试剂盒及方法，通过先对ffpe切片脱蜡，再组织裂解，最后采用柱提法实现dna分离。

4、专利技术专利申请cn108841920本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种FFPE样本中DNA的高完整度提取方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的FFPE样本中DNA的高完整度提取方法，其特征在于，所述步骤1具体为，取适量FFPE切片，置于一洁净的1.5mL离心管中，加入400μL脱蜡液，剧烈涡旋5s，短暂离心让样品浸泡到脱蜡液中，50-70℃孵育2-8min，然后10200rpm(10000×g)离心2min，弃上清，得到脱蜡后的样本组织。

3.根据权利要求1所述的FFPE样本中DNA的高完整度提取方法，其特征在于，所述步骤1脱蜡处理用到的脱蜡液为矿物油、硅油、液状石蜡、十一烷、1,5-环辛二烯中的一种或多...

【技术特征摘要】

1.一种ffpe样本中dna的高完整度提取方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的ffpe样本中dna的高完整度提取方法，其特征在于，所述步骤1具体为，取适量ffpe切片，置于一洁净的1.5ml离心管中，加入400μl脱蜡液，剧烈涡旋5s，短暂离心让样品浸泡到脱蜡液中，50-70℃孵育2-8min，然后10200rpm(10000×g)离心2min，弃上清，得到脱蜡后的样本组织。

3.根据权利要求1所述的ffpe样本中dna的高完整度提取方法，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：王旭之，罗健，蒋思远，
申请(专利权)人：合肥中科宏硕医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：