本公开提供了一种二级质谱鉴定序列的评估优化方法及装置，属于检测技术领域，该方法包括：生成每个原始序列对应的第一候选序列；其中，分别将第一原始序列中的每一个片段替换为片段分子质量相同的随机子序列，得到第一原始序列对应的多个第一候选序列；第一原始序列为任一个原始序列，原始序列为基于二级质谱得到的鉴定序列；基于多个第一原始序列和对应的多个第一候选序列构建评估序列集，计算评估序列集中每个序列与二级质谱的匹配度；基于匹配度从评估序列集中选取第一序列，将第一序列确定为评估优化结果。本公开提供的二级质谱鉴定序列的评估优化方法及装置可以提高二级质谱鉴定序列的评估优化效果。
【技术实现步骤摘要】
本公开属于检测，更具体地说，是涉及一种二级质谱鉴定序列的评估优化方法及装置。
技术介绍
1、利用液质联用技术（lc-ms/ms）产生的质谱数据进行从头测序（de novosequencing），已成为蛋白质组学研究中的一项关键手段。动态规划(dynamicprogramming)是实现从头测序的主要方法，动态规划这项技术具有运算时间复杂度高、复杂的赋分函数（scoring function）难以应用的缺点。以往的优化方向倾向于降低动态规划计算时候的精度，例如将计算单位从0.01道尔顿（dalton）扩大到0.1道尔顿，然后将从头测序生成的多肽序列与二级质谱进行数据库比对，达到优化的目的。但如果数据库内不包含相应的多肽序列，优化结果的可信度很低。另一种优化方向则是在二级质谱集中，通过停留时间（retention time）等质谱参数，找到同源的质谱进行结果比对。这种方法的缺点在于，同一实验组的质谱采用的动态规划方法相同，同源的质谱鉴定结果互相影响，质谱中的噪音峰对鉴定结果的干扰会扩大。因此，存在优化结果变差的可能性。
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【技术保护点】
1.一种二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，还包括：
3.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，所述确定每个片段分子质量对应的多个第一子序列，包括：
4.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，还包括：
5.如权利要求4所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，所述分别将第一原始序列中的每一个片段替换为片段分子质量相同的随机子序列，包括：
6.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其...
【技术特征摘要】
1.一种二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，还包括：
3.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，所述确定每个片段分子质量对应的多个第一子序列，包括：
4.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，还包括：
5.如权利要求4所述的二级质谱鉴定序列的评估优化方法，其特征在于，所述分别将第一原始序列中的每一个片段替换为片段分子质量相同的随机子序列，包括：
6.如权利要求2所述的二级质谱鉴定序列的评估优...
【专利技术属性】
技术研发人员：韩放，
申请(专利权)人：河北省科学院应用数学研究所，
类型：发明
国别省市：
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