基于CASP的RNA传感器系统、方法及其用途技术方案

本发明专利技术涉及对哺乳动物细胞中的目标RNA分子进行检测的传感器系统、方法和用途。所述传感器系统包括识别部分、信号处理蛋白以及执行部分，其中，所述识别部分由DiCas7‑11蛋白/Csx29蛋白/crRNA复合物组成，所述信号处理蛋白包含定位结构域、Csx30结构域、转录调控结构域以及转录激活结构域，所述执行部分包含与所述信号处理蛋白的所述转录调控结构域相互作用的核酸序列。本发明专利技术的系统和方法可有利地用于对哺乳动物宿主细胞内源RNA进行检测，进而实现RNA依赖性表达、疾病诊断以及靶向治疗。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物，涉及利用crispr相关蛋白酶(casp)对哺乳动物细胞中的目标rna分子进行检测的传感器系统，以及该系统在内源rna定量检测、rna依赖性表达、疾病诊断和靶向治疗中的用途。

技术介绍

1、目前正在进行的大规模单细胞测序项目产生了大量数据。例如，人细胞图谱项目human cell atlas和癌症基因组图谱项目cancer genome atlas收集了超过4000条转录组学数据，其中包括不同时空条件以及多种细胞类型和状态下表达水平动态变化、单碱基突变以及转录调控网络的全面信息。这些数据能够用于在规模尺度下对细胞类型和状态进行分析识别，从而揭示正常和异常组织中的细胞特异性生理特征及细胞发育轨迹；还能够用于提升对细胞水平生理活动的预测能力，并为基础和临床医学提供可用的生物标志物。例如，可基于此类生物标志物将癌细胞的mrna作为免疫或基因治疗的靶标。

2、为更好的利用转录组学大数据，本领域亟需开发性能更高且可编程的rna传感技术，以便能够通过rna序列信息追踪细胞谱系、识别细胞的类型和/或状态，并基于识别和追踪的结果对细胞进行后本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于检测哺乳动物细胞中目标RNA分子的系统，所述系统包括：

2.如权利要求1所述的系统，其中，所述识别部分的所述DiCas7-11蛋白具有D429A/D654A突变；

3.如权利要求1或2所述的系统，其中，所述信号处理蛋白的定位结构域为AcrIIA4，所述转录调控结构域为dSpCas9；所述执行部分包含sgRNA；

4.如权利要求1或2所述的系统，其中，所述信号处理蛋白的定位结构域为细胞膜定位结构域，所述转录调控结构域为别构转录因子；所述执行部分为输出基因表达盒，其中，所述输出基因表达盒包含输出蛋白编码序列以及控制所述输出蛋白转录的诱导型启动子...

【技术特征摘要】

1.一种用于检测哺乳动物细胞中目标rna分子的系统，所述系统包括：

2.如权利要求1所述的系统，其中，所述识别部分的所述dicas7-11蛋白具有d429a/d654a突变；

3.如权利要求1或2所述的系统，其中，所述信号处理蛋白的定位结构域为acriia4，所述转录调控结构域为dspcas9；所述执行部分包含sgrna；

4.如权利要求1或2所述的系统，其中，所述信号处理蛋白的定位结构域为细胞膜定位结构域，所述转录调控结构域为别构转录因子；所述执行部分为输出基因表达盒，其中，所述输出基因表达盒包含输出蛋白编码序列以及控制所述输出蛋白转录的诱导型启动子；其中，所述诱导型启动子包含与所述别构转录因子相互作用的操纵位点；

5.一种用于检测哺乳动物细胞中目标rna分子的方法，所述方法包括将包含如下序列的质粒转染至所述哺乳动物细胞：

6.如权利要求5所述的方法，其中，所述信号处理蛋白的定位结构域为acriia4，所述转录调控结构域为dspcas9；所述执行部分表达盒包含sgrna表达盒与输出基因表达盒，其中，所述sgrna的间隔区与所述输出基因的启动子互补；

7.如权利要求5所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员：娄春波，吴琼，张敏，张雪，许永跃，项延会，张博，
申请(专利权)人：中国科学院深圳先进技术研究院，
类型：发明
国别省市：