一种评估微生物系统弹性的方法技术方案

本发明专利技术涉及一种评估微生物系统弹性的方法，属于微生物学领域。该方法基于重建的弹性概念框架，将微生物群落的弹性定义为抵抗力和功能冗余的协同作用。通过宏基因组学和宏转录组学技术，量化了抵抗力和功能冗余，并构建了相应的评估方法学。首先，通过多组学数据获取和特定功能的微生物群筛选，获得目标功能相关的微生物群。然后，分别评估微生物群在代谢途径中各过程的多样性和凝聚力，以量化抵抗力；根据冗余物种的判别，计算功能冗余。最后，将抵抗力和功能冗余进行线性拟合，并基于抵抗力、功能冗余与拟合线所围面积计算弹性，并进一步计算弹性维持。本发明专利技术能够评估微生物系统在应对外部扰动时维持功能的能力，为环境微生物研究和生态系统管理提供重要技术支撑。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于微生物学领域，涉及一种评估微生物系统弹性的方法。

技术介绍

1、弹性一词于1973年首次引入生态学，并定义弹性为系统吸收和适应干扰的能力，且保持其基本结构和功能不变。微生物系统具有结构和功能，对外部扰动具有适应性，可利用弹性表征微生物系统对扰动的快速响应。然而，由于从20世纪90年代开始，生态学中的大型野外实验才向微观实验转型，导致对于各生态系统中微生物系统的研究滞后，尤其是微生物系统弹性的评估。

2、微生物系统弹性评估可利用的方法有3类：一是借鉴其他生态系统的评估手段，将扰动前、中、后时期某一指标的变化差值作为抵抗力、功能冗余及弹性；二是利用平均变异度评价系统稳定状态；三是利用势函数计算如势能深度、退出时间等指标。然而，当前可利用的方法无法真正的评估弹性，且缺乏合理的方法学，难以捕捉微观层面的动态。这在一定程度上限制了深入探究微生物系统对外部扰动的响应和在微生物系统探究弹性评估的发展。

技术实现思路

1、有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种评估微生物系统弹性的方法。

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【技术保护点】

1.一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：该方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述S1中，多组学数据获取的具体方法包括：

3.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述S2中，特定功能的微生物群筛选的具体方法包括：

4.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述S3中，评估抵抗力的具体方法包括：

5.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述S4中，评估功能冗余的具体方法包括：

6.根据权利要求1所述的...

【技术特征摘要】

1.一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：该方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述s1中，多组学数据获取的具体方法包括：

3.根据权利要求1所述的一种评估微生物系统弹性的方法，其特征在于：所述s2中，特定功能的微生物群筛选的具体方法包括：

4....

【专利技术属性】
技术研发人员：何欣霞，李哲，鲁伦慧，盛星，
申请(专利权)人：中国科学院重庆绿色智能技术研究院，
类型：发明
国别省市：