一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法技术

本发明专利技术提供了一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，所述建库方法包括：选取模式植物拟南芥内源5’‑leaders，根据5’‑leaders长度为50‑150 nt区间的序列和5’‑leaders长度大于150 nt的序列分别进行构建，获得两种5’‑leaders文库；通过载体无缝连接分别将所述5’‑leaders文库构建获得两种质粒文库；将所述两种质粒文库混合后侵染烟草叶片，后提取烟草注射部位的总RNA，并对不同核糖体结合的RNA组分进行分离，获得分离出来的RNA；对所述分离出来的RNA进行建库、测序，分析且对不同的转录本的翻译能力进行赋值，从而获得核酸序列的翻译效率。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医学，特别涉及一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法。

技术介绍

1、植物在自然界中随时会面临病原微生物的侵染，为了预防和抵抗病原微生物的入侵，在漫长的演化过程中植物形成了多层次的免疫系统。一般而言，植物的免疫系统包括pattern triggered immunity (pti) (couto and zipfel, 2016)、effector-triggeredimmunity (eti) (jones and dangl, 2006)和系统获得抗性(systemic acquiredresistance, sar)(gaffney et al., 1993)。病原微生物表面保守的分子模式(pathogen-associated molecular patterns, pamps)能够被植物细胞膜上的模式识别受体(pattern-recognition receptors, prrs)所识别，快速激活广谱的免疫反应pti。植物响应病原微生物的前期免疫反应包括活性氧(ros)的产生、细胞质钙离子浓度的变化以及丝裂原活化蛋白激酶(mi本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述建库方法包括：

2. 根据权利要求1所述的一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述根据5’-leaders长度为50-150 nt区间的序列和5’-leaders长度大于150 nt的序列分别进行构建，获得两种5’-leaders文库，具体包括：

3. 根据权利要求1所述的一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述通过对每条序列设计特异性引物，分别扩增出1232种5’-leaders DNA，具体包括：转录因子758种和植物激素相关基因549种。p>

4.根据权...

【技术特征摘要】

1.一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述建库方法包括：

2. 根据权利要求1所述的一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述根据5’-leaders长度为50-150 nt区间的序列和5’-leaders长度大于150 nt的序列分别进行构建，获得两种5’-leaders文库，具体包括：

3. 根据权利要求1所述的一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述通过对每条序列设计特异性引物，分别扩增出1232种5’-leaders dna，具体包括：转录因子758种和植物激素相关基因549种。

4.根据权利要求1所述的一种大规模测定核酸序列翻译效率的建库方法，其特征在于，所述通过载体无缝连接分别将所述5’-leaders文库构建，获得两种质粒...

【专利技术属性】
技术研发人员：胥国勇，袁术，朱思涛，牛瑞霞，
申请(专利权)人：武汉大学，
类型：发明
国别省市：