在纳米孔测序期间减少普鲁士蓝形成的组合物和方法技术

技术编号:43695525 阅读:34 留言:0更新日期:2024-12-18 21:11
本申请公开了可用于基于纳米孔的核酸测序的电化学池、纳米孔装置和相关缓冲组合物。还公开了用于在基于纳米孔的核酸测序方法、诸如纳米孔扩展测序(Nano‑SBX)和纳米孔合成测序(Nano‑SBS)方法中使用所述电化学池、装置和组合物的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本申请涉及在基于纳米孔的测定过程中减少普鲁士蓝有害形成的电化学池(cell)和相关缓冲组合物,以及在基于纳米孔的核酸检测技术(诸如纳米孔测序)中使用该组合物的方法。


技术介绍

1、基于纳米孔的核酸测序是一种已被广泛研究的引人注目的方法。在一种方法中,单链多核苷酸的序列借由当多核苷酸通过嵌入脂质双层中的纳米孔移位时离子电流的变化来检测,该脂质双分子层将电化学池的两侧分开。在多核苷酸移位期间,纳米孔孔径的部分堵塞会随着时间的推移改变离子流,从而导致电流变化,该电流变化可以被池测量。

2、扩展测序(“sbx”)是一种基于纳米孔的核酸测序方法,该方法使用生化过程将dna序列转录到称为“xpandomer”的可测量聚合物分子上。参见例如美国专利号7,939,259,标题为“通过扩展进行高通量核酸测序”;以及pct公开号wo2020236526a1,标题为“用于纳米孔测序的移位控制元件、报告子代码和用于移位控制的其他手段”。在sbx过程中,靶核酸序列沿着主链xpandomer序列编码,其中报告子构建体间隔约10nm,如此涉及以使在纳米孔移位过程中提供高信噪本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种电化学池,其包括:

2.根据权利要求1所述的池,其中所述金属在1M NH4Cl、800mM尿素、100mM HEPES、pH7.4的缓冲溶液中或在1M NH4Cl、800mM尿素、100mM MES、pH在6.2-6.8的缓冲溶液中相对于Ag/AgCl参比电极被极化至约0.3V的电势时表现出小于或等于10-3mA/cm2的电流密度。

3.根据权利要求1至2中任一项所述的池,其中所述金属含有小于10%的铁、小于8%的铁、小于6%的铁或小于5%的铁。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的池,其中所述金属为镍合金。

5.根据权利要求4所述...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种电化学池,其包括:

2.根据权利要求1所述的池,其中所述金属在1m nh4cl、800mm尿素、100mm hepes、ph7.4的缓冲溶液中或在1m nh4cl、800mm尿素、100mm mes、ph在6.2-6.8的缓冲溶液中相对于ag/agcl参比电极被极化至约0.3v的电势时表现出小于或等于10-3ma/cm2的电流密度。

3.根据权利要求1至2中任一项所述的池,其中所述金属含有小于10%的铁、小于8%的铁、小于6%的铁或小于5%的铁。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的池,其中所述金属为镍合金。

5.根据权利要求4所述的池,其中所述金属为选自c276、c22、625和mp35n的镍合金。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的池,其中所述池封闭在约0.1与约1000飞升之间的溶液体积。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的池,其中所述亚铁氰化物离子和所述铁氰化物离子的总浓度在约25mm与250mm之间。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的池,其中所述缓冲组合物包含浓度为约0mm至约1500mm的乙酸铵。

9.根据权利要求1至8中任一项所述的池,其中所述缓冲组合物包含浓度为小于2000mm或小于1000mm的氯化铵。

10.根据权利要求1至9中任一项所述的池,其中所述缓冲组合物包含浓度为约0mm至约1500mm的乙酸铵和浓度为小于2000mm的氯化铵;任选地,浓度为0mm的乙酸铵和浓度为小于1000mm的氯化铵。

11.根据权利要求1至10中任一项所述的池,其中向所述池施加电压范围为450mv至1200mv的交流电(ac),使得持续至少1小时、至少2小时、至少4小时、至少6小时、至少8小时或至少10小时在所述池中没有可见的普鲁士蓝形成。

12.一种用于对靶核酸进行测序的方法,所述方法包括:

13.根据权利要求12所述的方法,其中所述金属在1m nh4cl、800mm尿素、100mm hepes、ph 7.4的缓冲溶液中或在1m nh4cl、800mm尿素、100mm mes、ph在6.2-6.8的缓冲溶液中相对于ag/agcl参比电极被极化至约0.3v的电势时表现出小于或等于10-3ma/cm2的电流密度。

14.根据权利要求12至13中任一项所述的方法,其中所述金属含有小于10%的铁、小于8%的铁、小于6%的铁或小于5%的铁。

15.根据权利要求12至14中任一项所述的方法,其中所述金属为镍合金;任选地,所述金属为选自c276、c22、625和mp35n的镍合金。

16.根据权利要求12至15中任一项所述的方法,其中所述池封闭在约0.1与约1000飞升之间的溶液体积。

17.根据权利要求12至16中任一项所述的方法,其中所述亚铁氰化物离子和所述铁氰化物离子的总浓度在约25mm与250mm之间。

18.根据权利要求12至17中任一项所述的方法,其中所述缓冲组合物包含浓度为约0...

【专利技术属性】
技术研发人员:C·马哈克A·阿迪尔S·克里斯蒂Z·亨茨K·穆诺兹M·阿布塞克C·切克P·克里萨利
申请(专利权)人:豪夫迈·罗氏有限公司
类型:发明
国别省市:

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