【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种利用三代长读长测序平台检测法布雷病(fd;fabry disease) gla基因多种突变的引物组和方法,以及适用于此方法的试剂盒。
技术介绍
1、法布雷病(fd,omim 301500)是一种罕见的x连锁溶酶体疾病,由编码α-半乳糖苷酶a(α-gal a)的 gla基因的致病变异引起。α-gaia的缺乏导致鞘糖脂(主要是gb3)及其衍生物球状鞘氨醇(lyso-gb3)在全身细胞、组织和器官(包括肾脏、心脏、中枢和周围神经系统)中累积,从而引起血液循环障碍并进一步导致心、肾功能衰竭和神经系统紊乱而死亡。
2、fd是一种x连锁溶酶体疾病,由 gla基因致病性变异引起。 gla基因由7个外显子组成,长度约为10kb, gla基因cdna编码约50kda(429个氨基酸)的前体蛋白,该前体蛋白被蛋白水解裂解成溶酶体成熟蛋白。
...【技术保护点】
1.一种引物组,其用于同时扩增法布雷病多种突变,其中所述引物组包含GLA-F1/R1引物对、GLA-F2/R2引物对、GLA-F3/R3引物对、GLA-F4/R4引物对、GLA-F5/R5引物对、GLA-F6/R6引物对、GLA-F7/R7引物对中的一对或多对;其中所述GLA-F1/R1引物对、GLA-F2/R2引物对、GLA-F3/R3引物对、GLA-F4/R4引物对、GLA-F5/R5引物对、GLA-F6/R6引物对、GLA-F7/R7引物对的核苷酸序列分别如SEQ ID NO: 1和8、SEQ ID NO: 2和9、SEQ ID NO: 3和10、SEQID N
...【技术特征摘要】
1.一种引物组,其用于同时扩增法布雷病多种突变,其中所述引物组包含gla-f1/r1引物对、gla-f2/r2引物对、gla-f3/r3引物对、gla-f4/r4引物对、gla-f5/r5引物对、gla-f6/r6引物对、gla-f7/r7引物对中的一对或多对;其中所述gla-f1/r1引物对、gla-f2/r2引物对、gla-f3/r3引物对、gla-f4/r4引物对、gla-f5/r5引物对、gla-f6/r6引物对、gla-f7/r7引物对的核苷酸序列分别如seq id no: 1和8、seq id no: 2和9、seq id no: 3和10、seqid no: 4和11、seq id no: 5和12、seq id no: 6和13、seq id no: 7和14所示。
2.根据权利要求1所述的引物组,其中所述引物组包含gla-f1/r1引物对、gla-f2/r2引物对、gla-f3/r3引物对、gla-f4/r4引物对中的一对或多对。
3.根据权利要求1所述的引物组,其中所述法布雷病多种突变包含gla基因的点突变和gla基因内插入和缺失。
4.根据权利要求3所述的引物组,其中所述gla基因内插入和缺失包含gla基因的外显子区域的插入和缺失和gla基因的内含子区域的插入和缺失。
5. 根据权利要求1所述的引物组,其中所述引物组进一步包含gla-gap引物;其中所述gla-gap引物包含序列如seq id no: 15-54所示的引物。
6.根据权利要求5所述的引物组,其中所述法布雷病多种突变进一步包含gla-gap引物范围内的大片段缺失。
7.根据权利要求1所述的引物组,其中所述gla-f1/r1引物对、gla-f2/r2引物对、gla-f3/r3引物对、gla-f4/r4引物对、gla-f5/r5引物对、gla-f6/r6引物对、gla-f7/r7引物对的扩增产物的长度为11.5kb。
8.根据权利要求5所述的引物组,其中所述gla-gap引物范围为300-400kb。
9.根据权利要求1或5所述的引物组,其中所述引物组的引物的5’端还包含dna条形码。
10.根据权利要求9所述的引物组,其中所述dna条形码是相同的或不同的,所述dna条形码的长度为5-50nt。
11.根据权利要求1或5所述的引物组,其中所述引物组在一个反应体系中同时扩增法布雷病多种突变。
12.权利要求1-10中任一项所述的引物组在制备用于检测法布雷病多种突变的试剂盒中的应用。
13.一种同时检测法布雷病多种突变的试剂盒,其包括以下试剂:
14.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述法布雷病多种突变包含gla基因的点突变、gla基因内插入和缺失和/或gla-gap引物范围内的大片段缺失。
15.根据权利要求14所述的试剂...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘俊涛,孟万利,姚凤霞,毛爱平,张为民,卢玉林,郝娜,邱正庆,任志林,
申请(专利权)人:北京贝瑞和康生物技术有限公司,
类型:发明
国别省市:
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