微生物判别方法及微生物判别装置制造方法及图纸

微生物判别方法具备：获取样品的质荷比的列表即样品列表的步骤(ST32)；对于所述样品列表和根据基因组数据预测出的每个微生物的质荷比列表的数据库即质荷比数据库，在对与特定的组中包含的蛋白质对应的质荷比进行加权的基础上进行比较，判别样品的步骤(ST40～ST44，ST40A)；以及输出判别出的结果的步骤(ST50，ST54)。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本专利技术涉及微生物判别方法及微生物判别装置。

技术介绍

1、在非专利文献1中，公开了2种在使用质量分析法的微生物的判别中能够采用的方法。

2、第1种方法是指纹法，将对未知的微生物测量出的质谱与对每个已知的微生物测量出的质谱的数据库进行比较，由此判别未知的微生物。但是，在该方法中，存在微生物的质谱的图案容易强烈地受到培养基条件及测量的再现法的影响等问题。

3、针对这样的指纹法的问题，作为第2种方法，着眼于基于使用了基因组数据库的生物信息学的方法。在该方法中，将对未知的微生物测量出的质谱与根据基因组数据库预测出的蛋白质的质荷比的数据库进行比较，由此判别未知的微生物。在该方法中，预测的质荷比不受培养基条件及测量的再现法的影响，因此能够解决上述的指纹法的问题。

4、现有技术文献

5、非专利文献

6、非专利文献1：田村广人等，“以核糖体蛋白质为生物标志物的利用mald i-tof ms的细菌识别-s10-利用germs法的细菌的迅速识别-”，岛津评论附印，第70卷，第3·4号，2013年

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【技术保护点】

1.一种微生物判别方法，其特征在于，具备：

2.如权利要求1所述的微生物判别方法，其特征在于，所述组由蛋白质的名称、蛋白质的功能及家族中的至少1项规定。

3.如权利要求1或2所述的微生物判别方法，其特征在于，基于以下条件中的至少1个条件来选择所述组：表达量为规定的阈值以上这样的条件、具有对生命维持而言必不可缺的功能这样的条件、氨基酸序列的相似度为规定的阈值以上的微生物以规定的比例以上存在这样的条件、为碱性蛋白质这样的条件、在通过MALDI-MS测量进行测量时能够以±14Da以内的误差范围分析质荷比这样的条件、蛋白质的质量包含于4～30kDa这样的条件、组中包含的蛋...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种微生物判别方法，其特征在于，具备：

2.如权利要求1所述的微生物判别方法，其特征在于，所述组由蛋白质的名称、蛋白质的功能及家族中的至少1项规定。

3.如权利要求1或2所述的微生物判别方法，其特征在于，基于以下条件中的至少1个条件来选择所述组：表达量为规定的阈值以上这样的条件、具有对生命维持而言必不可缺的功能这样的条件、氨基酸序列的相似度为规定的阈值以上的微生物以规定的比例以上存在这样的条件、为碱性蛋白质这样的条件、在通过maldi-ms测量进行测量时能够以±14da以内的误差范围分析质荷比这样的条件、蛋白质的质量包含于4～30kda这样的条件、组中包含的蛋白质的种类为规定的数量以上这样的条件，

4.如权利要求1或2所述的微生物判别方法，其特征在于，所述组包含核糖体蛋白质、侣伴蛋白、dna结合蛋白中的至少1种。

5.如权利要求1或2所述的微生物判别方法，其特征在于，所述判别样品的步骤包括：通过包括基于...

【专利技术属性】
技术研发人员：寺本华奈江，关口勇地，三浦大典，
申请(专利权)人：株式会社岛津制作所，
类型：发明
国别省市：