一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法技术

本申请提供了一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法，涉及人工智能药物研发技术领域，包括：遍历VDJdb数据库进行筛选，构建多个数据集，生成噪声数据集；采用U‑ViT网络进行去噪，生成氨基酸序列；设计综合损失函数，构建专家模型，通过多层感知机进行结合亲和力预测，生成亲和力条件；采用随机采样器结合指导梯度，生成TCR序列和结构。通过本申请可以解决现有技术中由于TCR序列和结构信息分离处理，导致设计过程冗长且效率低下的技术问题，通过结合TCR序列和结构信息，利用先进的数据处理和模型构建技术，进行序列和结构的共同设计，提高了TCR设计的效率和准确性。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及人工智能药物研发，尤其涉及一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法。

技术介绍

1、t细胞受体(tcrs)在免疫系统中起着至关重要的作用，负责识别和应对病原体及恶性细胞。tcrs使t细胞能够特异性地识别并消除被感染或癌变的细胞，是免疫监视和治疗的关键。tcrs通过v(d)j重组过程识别肽-主要组织相容性复合体(pmhc)，在互补决定区(cdrs)中生成多样的序列。每个tcr由α链和β链组成，每条链各有三个cdr(cdr1、cdr2和cdr3)，其中cdr3b在特异性识别中尤为重要。目前，现有tcr设计方法往往只考虑序列信息或结构信息，而未能有效结合两者，导致设计的tcr在实际应用中性能不足，缺乏有效的端到端算法，能够同时考虑tcr的其他部分和cdr区域，进行序列与结构的协同设计。

2、综上所述，现有技术中存在由于tcr序列和结构信息分离处理，导致设计过程冗长且效率低下的技术问题。

技术实现思路

1、本申请的目的是提供一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法，用以解决现有技本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，遍历VDJdb数据库进行筛选，构建多个数据集，包括：

3.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，基于所述训练数据集、所述验证数据集、所述测试数据集构建扩散模型，生成噪声数据集，包括：

4.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的T细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，采用U-ViT网络对所述噪声数据集进行去噪，结合miniMPNN生成氨基酸序列，包括：...

【技术特征摘要】

1.一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，遍历vdjdb数据库进行筛选，构建多个数据集，包括：

3.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，基于所述训练数据集、所述验证数据集、所述测试数据集构建扩散模型，生成噪声数据集，包括：

4.如权利要求1所述的一种基于扩散模型的t细胞受体序列和结构共设计方法，其特征在于，采用u-vit网络对所述噪声数据集进行去噪，结合minimpnn生成氨基酸序列，包括：

【专利技术属性】
技术研发人员：安铎，景天舒，王哲，
申请(专利权)人：致免科技有限公司，
类型：发明
国别省市：